28 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shew185_2088 on replicon NC_009665
Organism: Shewanella baltica OS185



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004347  SO_0666  prophage MuSo1, portal protein, putative  90.84 
 
 		 546 aa  1020    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2135  prophage MuSo1, portal protein, putative  98.9 
 
 		 546 aa  1123    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2088  prophage MuSo1, portal protein, putative  100 
 
 		 546 aa  1131    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0947183  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2679  prophage MuSo2, portal protein, putative  64.61 
 
 		 519 aa  589  1e-167  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0764  portal protein  62.35 
 
 		 521 aa  568  1e-160  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0673  portal protein  62.35 
 
 		 521 aa  568  1e-160  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3391  Mu-like prophage FluMu protein GP28  49.37 
 
 		 544 aa  439  9.999999999999999e-123  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.50016  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1876  hypothetical protein  47.23 
 
 		 513 aa  431  1e-119  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3782  hypothetical protein  47 
 
 		 525 aa  425  1e-117  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.468452  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1642  hypothetical protein  49.6 
 
 		 517 aa  417  9.999999999999999e-116  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3372  portal protein, putative  48.7 
 
 		 490 aa  416  9.999999999999999e-116  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2249  hypothetical protein  45.19 
 
 		 560 aa  403  1e-111  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1282  portal protein, putative  47.25 
 
 		 493 aa  392  1e-108  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  7.709860000000001e-24 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3008  hypothetical protein  43.09 
 
 		 547 aa  353  4e-96  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.505507  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2701  Mu-like prophage FluMu protein gp28-like  40.65 
 
 		 595 aa  347  3e-94  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3048  hypothetical protein  26.95 
 
 		 452 aa  101  3e-20  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0449427  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3406  hypothetical protein  25.58 
 
 		 482 aa  94.4  5e-18  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.662335  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2103  hypothetical protein  25.67 
 
 		 476 aa  93.2  1e-17  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.136375  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1297  hypothetical protein  25.67 
 
 		 476 aa  93.2  1e-17  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1969  hypothetical protein  25.38 
 
 		 426 aa  90.5  7e-17  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.527917 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0670  protein of unknown function DUF264  26.88 
 
 		 441 aa  87.4  7e-16  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2933  prophage MuMc02, terminase, ATPase subunit, putative  24.54 
 
 		 443 aa  73.6  0.000000000008  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0566615  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4503  hypothetical protein  25.66 
 
 		 457 aa  73.2  0.00000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.443193 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3416  hypothetical protein  25.18 
 
 		 521 aa  70.5  0.00000000008  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.940331  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1911  protein of unknown function DUF264  33.78 
 
 		 427 aa  69.7  0.0000000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.695816 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3289  hypothetical protein  25.26 
 
 		 596 aa  47  0.0008  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.699131  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0830  protein of unknown function DUF264  22.87 
 
 		 503 aa  43.9  0.008  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0649  hypothetical protein  27.92 
 
 		 523 aa  43.9  0.008  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>