71 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CFF8240_0649 on replicon NC_008599
Organism: Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008599  CFF8240_0649  hypothetical protein  100 
 
 		 523 aa  1082    Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1911  protein of unknown function DUF264  34.95 
 
 		 427 aa  210  5e-53  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.695816 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0830  protein of unknown function DUF264  31.29 
 
 		 503 aa  174  2.9999999999999996e-42  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0641  protein of unknown function DUF264  31.52 
 
 		 478 aa  173  6.999999999999999e-42  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1017  protein of unknown function DUF264  31.07 
 
 		 478 aa  171  2e-41  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3406  hypothetical protein  30.51 
 
 		 482 aa  170  5e-41  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.662335  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1969  hypothetical protein  31.2 
 
 		 426 aa  170  6e-41  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.527917 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3048  hypothetical protein  29.78 
 
 		 452 aa  162  2e-38  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0449427  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4503  hypothetical protein  30.51 
 
 		 457 aa  161  3e-38  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.443193 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2103  hypothetical protein  28.64 
 
 		 476 aa  159  9e-38  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.136375  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1297  hypothetical protein  28.64 
 
 		 476 aa  159  9e-38  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2933  prophage MuMc02, terminase, ATPase subunit, putative  29.56 
 
 		 443 aa  157  6e-37  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0566615  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0670  protein of unknown function DUF264  28.47 
 
 		 441 aa  144  3e-33  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00833  Terminase, ATPase subunit  28.31 
 
 		 588 aa  131  2.0000000000000002e-29  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00841  hypothetical protein  28.31 
 
 		 588 aa  131  2.0000000000000002e-29  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2868  terminase, ATPase subunit  28.08 
 
 		 588 aa  131  3e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3050  terminase, ATPase subunit  28.31 
 
 		 588 aa  131  3e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00590407 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0924  terminase, ATPase subunit  28.31 
 
 		 588 aa  131  4.0000000000000003e-29  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2777  hypothetical protein  28.31 
 
 		 588 aa  130  4.0000000000000003e-29  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000134113 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0587  hypothetical protein  22.69 
 
 		 601 aa  130  8.000000000000001e-29  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.50668 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05025  hypothetical protein  28.34 
 
 		 593 aa  129  1.0000000000000001e-28  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_1057  terminase  28.38 
 
 		 605 aa  129  2.0000000000000002e-28  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1026  terminase, ATPase subunit  26.98 
 
 		 590 aa  127  4.0000000000000003e-28  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1399  hypothetical protein  27.59 
 
 		 594 aa  125  1e-27  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2800  putative conserved hypothetical protein  26.19 
 
 		 594 aa  126  1e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0207  hypothetical protein  26.9 
 
 		 583 aa  126  1e-27  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.256688 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3289  hypothetical protein  26.42 
 
 		 596 aa  125  2e-27  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.699131  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01363  phage terminase, ATPase subunit  27.6 
 
 		 533 aa  125  3e-27  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.35276  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2916  hypothetical protein  26.68 
 
 		 589 aa  123  9e-27  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.518687 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0695  hypothetical protein  26.42 
 
 		 577 aa  122  1.9999999999999998e-26  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0943  hypothetical protein  27.07 
 
 		 697 aa  121  3e-26  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_37610  Phage P2 terminase ATPase subunit, gpP-like protein  25.93 
 
 		 585 aa  121  3e-26  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3493  hypothetical protein  26.27 
 
 		 591 aa  120  6e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  2.68635e-25 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0897  hypothetical protein  25.5 
 
 		 595 aa  120  7e-26  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.672051  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2937  hypothetical protein  26.27 
 
 		 591 aa  119  9.999999999999999e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  3.83908e-26 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1352  putative ATPase subunit of terminase (gpP-like)  25.16 
 
 		 601 aa  117  3.9999999999999997e-25  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.211848  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4835  hypothetical protein  26.52 
 
 		 588 aa  117  6e-25  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.283168  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0720  hypothetical protein  25.87 
 
 		 602 aa  112  2.0000000000000002e-23  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.0748735 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3416  hypothetical protein  27.65 
 
 		 521 aa  111  3e-23  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.940331  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3171  hypothetical protein  25.15 
 
 		 589 aa  110  5e-23  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2327  hypothetical protein  23.61 
 
 		 587 aa  110  5e-23  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1282  hypothetical protein  25.29 
 
 		 602 aa  110  6e-23  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3501  hypothetical protein  25.28 
 
 		 589 aa  109  1e-22  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.203909 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5052  hypothetical protein  25.17 
 
 		 682 aa  109  1e-22  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0704  hypothetical protein  25.17 
 
 		 682 aa  109  1e-22  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4364  hypothetical protein  23.21 
 
 		 589 aa  106  9e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000000000106491 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2641  hypothetical protein  24.52 
 
 		 570 aa  105  2e-21  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3833  protein of unknown function DUF264  23.76 
 
 		 575 aa  104  4e-21  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0239  protein of unknown function DUF264  23.95 
 
 		 615 aa  103  1e-20  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.111761  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1939  terminase (ATPase subunit) related protein  28.32 
 
 		 506 aa  102  2e-20  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.347904 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4323  phage large terminase subunit GpP  25 
 
 		 590 aa  101  3e-20  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00512482 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0773  putative bacteriophage terminase  28.78 
 
 		 598 aa  101  3e-20  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.841115  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3052  phage large terminase subunit GpP  24.77 
 
 		 590 aa  97.4  6e-19  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.680947  hitchhiker  0.000000111956 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2767  hypothetical protein  22.48 
 
 		 599 aa  91.3  4e-17  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.851255 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1472  hypothetical protein  22.25 
 
 		 599 aa  90.1  8e-17  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1876  hypothetical protein  21.94 
 
 		 513 aa  66.6  0.0000000009  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1356  hypothetical protein  24.46 
 
 		 254 aa  57.8  0.0000005  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2679  prophage MuSo2, portal protein, putative  21.69 
 
 		 519 aa  57.4  0.0000007  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0666  prophage MuSo1, portal protein, putative  20.83 
 
 		 546 aa  55.5  0.000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1642  hypothetical protein  30.56 
 
 		 517 aa  55.1  0.000003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0764  portal protein  21.43 
 
 		 521 aa  54.3  0.000005  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0673  portal protein  21.43 
 
 		 521 aa  54.3  0.000005  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0096  hypothetical protein  21.74 
 
 		 505 aa  52.8  0.00001  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3782  hypothetical protein  21.11 
 
 		 525 aa  53.1  0.00001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.468452  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3372  portal protein, putative  21.08 
 
 		 490 aa  50.8  0.00006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2326  hypothetical protein  26.72 
 
 		 241 aa  49.7  0.0001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1241  IS3 family transposase OrfA  41.54 
 
 		 91 aa  48.5  0.0003  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.00141321  n/a   
 
 
-
 
NC_008505  LACR_C03  transposase  38.46 
 
 		 91 aa  45.8  0.002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1384  hypothetical protein  28.39 
 
 		 477 aa  44.7  0.004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2088  prophage MuSo1, portal protein, putative  27.92 
 
 		 546 aa  43.9  0.007  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0947183  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0640  IS3 family transposase OrfA  36.92 
 
 		 91 aa  43.5  0.009  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>