47 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VSAL_I0773 on replicon NC_011312
Organism: Aliivibrio salmonicida LFI1238



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011312  VSAL_I0773  putative bacteriophage terminase  100 
 
 		 598 aa  1251    Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.841115  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3171  hypothetical protein  38.29 
 
 		 589 aa  394  1e-108  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4835  hypothetical protein  39.72 
 
 		 588 aa  394  1e-108  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.283168  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1399  hypothetical protein  38.91 
 
 		 594 aa  389  1e-107  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2916  hypothetical protein  37.91 
 
 		 589 aa  389  1e-107  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.518687 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1352  putative ATPase subunit of terminase (gpP-like)  38.1 
 
 		 601 aa  388  1e-106  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.211848  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5052  hypothetical protein  38.1 
 
 		 682 aa  385  1e-106  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0704  hypothetical protein  38.1 
 
 		 682 aa  385  1e-106  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4364  hypothetical protein  39.01 
 
 		 589 aa  380  1e-104  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000000000106491 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2777  hypothetical protein  38.56 
 
 		 588 aa  380  1e-104  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000134113 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00833  Terminase, ATPase subunit  38.73 
 
 		 588 aa  382  1e-104  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0924  terminase, ATPase subunit  38.56 
 
 		 588 aa  380  1e-104  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2868  terminase, ATPase subunit  38.5 
 
 		 588 aa  381  1e-104  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0587  hypothetical protein  38.32 
 
 		 601 aa  380  1e-104  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.50668 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3050  terminase, ATPase subunit  38.56 
 
 		 588 aa  380  1e-104  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00590407 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00841  hypothetical protein  38.73 
 
 		 588 aa  382  1e-104  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_37610  Phage P2 terminase ATPase subunit, gpP-like protein  36.81 
 
 		 585 aa  380  1e-104  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0207  hypothetical protein  39.47 
 
 		 583 aa  375  1e-102  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.256688 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2327  hypothetical protein  37.37 
 
 		 587 aa  370  1e-101  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3289  hypothetical protein  38.41 
 
 		 596 aa  368  1e-100  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.699131  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4323  phage large terminase subunit GpP  37.88 
 
 		 590 aa  367  1e-100  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00512482 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01363  phage terminase, ATPase subunit  39.58 
 
 		 533 aa  364  3e-99  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.35276  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3052  phage large terminase subunit GpP  37.7 
 
 		 590 aa  364  3e-99  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.680947  hitchhiker  0.000000111956 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3501  hypothetical protein  36.8 
 
 		 589 aa  361  3e-98  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.203909 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3493  hypothetical protein  36.18 
 
 		 591 aa  357  2.9999999999999997e-97  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  2.68635e-25 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1472  hypothetical protein  35.95 
 
 		 599 aa  357  5e-97  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2767  hypothetical protein  35.78 
 
 		 599 aa  355  1e-96  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.851255 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0695  hypothetical protein  36.83 
 
 		 577 aa  353  4e-96  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2937  hypothetical protein  36.41 
 
 		 591 aa  353  7e-96  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  3.83908e-26 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2800  putative conserved hypothetical protein  36.66 
 
 		 594 aa  346  8e-94  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_1057  terminase  34.55 
 
 		 605 aa  344  2e-93  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0239  protein of unknown function DUF264  35.43 
 
 		 615 aa  340  4e-92  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.111761  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0897  hypothetical protein  34.86 
 
 		 595 aa  338  9.999999999999999e-92  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.672051  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1939  terminase (ATPase subunit) related protein  40.16 
 
 		 506 aa  333  4e-90  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.347904 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05025  hypothetical protein  33.9 
 
 		 593 aa  331  3e-89  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2641  hypothetical protein  36.05 
 
 		 570 aa  328  2.0000000000000001e-88  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0720  hypothetical protein  33.78 
 
 		 602 aa  324  2e-87  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.0748735 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1026  terminase, ATPase subunit  35.13 
 
 		 590 aa  322  9.000000000000001e-87  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0943  hypothetical protein  33.33 
 
 		 697 aa  321  1.9999999999999998e-86  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1282  hypothetical protein  33.06 
 
 		 602 aa  308  1.0000000000000001e-82  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3833  protein of unknown function DUF264  33.86 
 
 		 575 aa  290  6e-77  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1356  hypothetical protein  40.33 
 
 		 254 aa  192  1e-47  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0649  hypothetical protein  28.78 
 
 		 523 aa  101  4e-20  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1940  terminase (ATPase subunit) related protein  41.67 
 
 		 89 aa  76.3  0.000000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.739724  normal  0.241183 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2326  hypothetical protein  27.08 
 
 		 241 aa  57.8  0.0000006  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3406  hypothetical protein  23.4 
 
 		 482 aa  55.8  0.000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.662335  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3048  hypothetical protein  20.47 
 
 		 452 aa  49.7  0.0001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0449427  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>