59 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PXO_01363 on replicon NC_010717
Organism: Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
CP001509  ECD_00833  Terminase, ATPase subunit  61.86 
 
 		 588 aa  664    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00841  hypothetical protein  61.86 
 
 		 588 aa  664    Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0924  terminase, ATPase subunit  61.67 
 
 		 588 aa  662    Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3171  hypothetical protein  61.23 
 
 		 589 aa  655    Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_37610  Phage P2 terminase ATPase subunit, gpP-like protein  75.61 
 
 		 585 aa  858    Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3289  hypothetical protein  67.17 
 
 		 596 aa  731    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.699131  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2916  hypothetical protein  61.19 
 
 		 589 aa  676    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.518687 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4835  hypothetical protein  60.93 
 
 		 588 aa  676    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.283168  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2777  hypothetical protein  61.67 
 
 		 588 aa  663    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000134113 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0207  hypothetical protein  59.47 
 
 		 583 aa  635    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.256688 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01363  phage terminase, ATPase subunit  100 
 
 		 533 aa  1109    Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.35276  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1399  hypothetical protein  58.92 
 
 		 594 aa  636    Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1352  putative ATPase subunit of terminase (gpP-like)  64.03 
 
 		 601 aa  718    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.211848  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2868  terminase, ATPase subunit  61.67 
 
 		 588 aa  665    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3050  terminase, ATPase subunit  61.67 
 
 		 588 aa  662    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00590407 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4323  phage large terminase subunit GpP  59.5 
 
 		 590 aa  628  1e-179  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00512482 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3052  phage large terminase subunit GpP  58.93 
 
 		 590 aa  622  1e-177  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.680947  hitchhiker  0.000000111956 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2327  hypothetical protein  58.17 
 
 		 587 aa  619  1e-176  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3501  hypothetical protein  57.01 
 
 		 589 aa  603  1.0000000000000001e-171  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.203909 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4364  hypothetical protein  57.12 
 
 		 589 aa  592  1e-168  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000000000106491 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1939  terminase (ATPase subunit) related protein  60.14 
 
 		 506 aa  543  1e-153  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.347904 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2641  hypothetical protein  48.13 
 
 		 570 aa  501  1e-140  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0720  hypothetical protein  45.37 
 
 		 602 aa  462  1e-129  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.0748735 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_1057  terminase  51.48 
 
 		 605 aa  459  9.999999999999999e-129  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0695  hypothetical protein  46.27 
 
 		 577 aa  461  9.999999999999999e-129  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1282  hypothetical protein  45.82 
 
 		 602 aa  460  9.999999999999999e-129  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3833  protein of unknown function DUF264  46.47 
 
 		 575 aa  452  1.0000000000000001e-126  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05025  hypothetical protein  43.73 
 
 		 593 aa  446  1.0000000000000001e-124  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1026  terminase, ATPase subunit  47.17 
 
 		 590 aa  448  1.0000000000000001e-124  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5052  hypothetical protein  44.53 
 
 		 682 aa  417  9.999999999999999e-116  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0704  hypothetical protein  44.53 
 
 		 682 aa  417  9.999999999999999e-116  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0587  hypothetical protein  46.51 
 
 		 601 aa  417  9.999999999999999e-116  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.50668 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0897  hypothetical protein  42.75 
 
 		 595 aa  407  1.0000000000000001e-112  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.672051  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2800  putative conserved hypothetical protein  42.54 
 
 		 594 aa  402  1e-111  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3493  hypothetical protein  42.11 
 
 		 591 aa  399  9.999999999999999e-111  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  2.68635e-25 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2937  hypothetical protein  41.73 
 
 		 591 aa  394  1e-108  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  3.83908e-26 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2767  hypothetical protein  46.76 
 
 		 599 aa  389  1e-107  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.851255 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1472  hypothetical protein  46.98 
 
 		 599 aa  390  1e-107  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0943  hypothetical protein  41.09 
 
 		 697 aa  379  1e-104  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0773  putative bacteriophage terminase  39.58 
 
 		 598 aa  364  3e-99  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.841115  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0239  protein of unknown function DUF264  39.48 
 
 		 615 aa  356  6.999999999999999e-97  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.111761  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1356  hypothetical protein  61.9 
 
 		 254 aa  322  8e-87  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0649  hypothetical protein  27.6 
 
 		 523 aa  125  3e-27  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1940  terminase (ATPase subunit) related protein  63.64 
 
 		 89 aa  119  9.999999999999999e-26  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.739724  normal  0.241183 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2326  hypothetical protein  32.13 
 
 		 241 aa  107  4e-22  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1911  protein of unknown function DUF264  26.54 
 
 		 427 aa  80.9  0.00000000000006  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.695816 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0830  protein of unknown function DUF264  23.46 
 
 		 503 aa  80.9  0.00000000000006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2103  hypothetical protein  22.81 
 
 		 476 aa  80.5  0.00000000000007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.136375  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1297  hypothetical protein  22.81 
 
 		 476 aa  80.5  0.00000000000007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1017  protein of unknown function DUF264  23.46 
 
 		 478 aa  77.8  0.0000000000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0641  protein of unknown function DUF264  23.94 
 
 		 478 aa  76.6  0.000000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2933  prophage MuMc02, terminase, ATPase subunit, putative  22.68 
 
 		 443 aa  63.9  0.000000006  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0566615  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3048  hypothetical protein  22.42 
 
 		 452 aa  63.5  0.00000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0449427  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1969  hypothetical protein  24.14 
 
 		 426 aa  63.2  0.00000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.527917 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4503  hypothetical protein  23.16 
 
 		 457 aa  60.1  0.0000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.443193 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3406  hypothetical protein  21.29 
 
 		 482 aa  56.6  0.000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.662335  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0670  protein of unknown function DUF264  22.94 
 
 		 441 aa  55.5  0.000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1462  hypothetical protein  25.68 
 
 		 421 aa  49.3  0.0002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0096  hypothetical protein  24.31 
 
 		 505 aa  46.2  0.001  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>