44 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xaut_4503 on replicon NC_009720
Organism: Xanthobacter autotrophicus Py2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011989  Avi_3048  hypothetical protein  77.46 
 
 		 452 aa  709    Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0449427  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0670  protein of unknown function DUF264  77.95 
 
 		 441 aa  691    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4503  hypothetical protein  100 
 
 		 457 aa  931    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.443193 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2933  prophage MuMc02, terminase, ATPase subunit, putative  66.21 
 
 		 443 aa  567  1e-160  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0566615  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2103  hypothetical protein  58.74 
 
 		 476 aa  499  1e-140  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.136375  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1297  hypothetical protein  58.74 
 
 		 476 aa  499  1e-140  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1911  protein of unknown function DUF264  50.5 
 
 		 427 aa  347  2e-94  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.695816 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1969  hypothetical protein  46.63 
 
 		 426 aa  315  8e-85  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.527917 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3406  hypothetical protein  37.99 
 
 		 482 aa  239  5e-62  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.662335  normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0649  hypothetical protein  30.51 
 
 		 523 aa  161  2e-38  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3416  hypothetical protein  33.59 
 
 		 521 aa  149  1.0000000000000001e-34  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.940331  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0830  protein of unknown function DUF264  26.54 
 
 		 503 aa  94.4  4e-18  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0641  protein of unknown function DUF264  27.21 
 
 		 478 aa  94  5e-18  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1017  protein of unknown function DUF264  27.38 
 
 		 478 aa  92.4  2e-17  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0666  prophage MuSo1, portal protein, putative  25.65 
 
 		 546 aa  77  0.0000000000007  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1876  hypothetical protein  25 
 
 		 513 aa  75.9  0.000000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2135  prophage MuSo1, portal protein, putative  25.83 
 
 		 546 aa  76.3  0.000000000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2088  prophage MuSo1, portal protein, putative  25.83 
 
 		 546 aa  75.9  0.000000000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0947183  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2249  hypothetical protein  26.19 
 
 		 560 aa  71.6  0.00000000003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1462  hypothetical protein  26.39 
 
 		 421 aa  65.5  0.000000002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0673  portal protein  26.55 
 
 		 521 aa  62.4  0.00000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2679  prophage MuSo2, portal protein, putative  25.68 
 
 		 519 aa  62.4  0.00000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0764  portal protein  26.55 
 
 		 521 aa  62.4  0.00000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3782  hypothetical protein  22.31 
 
 		 525 aa  60.5  0.00000007  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.468452  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0943  hypothetical protein  23.17 
 
 		 697 aa  60.1  0.00000007  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3289  hypothetical protein  23.63 
 
 		 596 aa  59.7  0.00000009  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.699131  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01363  phage terminase, ATPase subunit  23.16 
 
 		 533 aa  59.7  0.00000009  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.35276  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1282  hypothetical protein  23.72 
 
 		 602 aa  59.3  0.0000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0587  hypothetical protein  21.72 
 
 		 601 aa  58.5  0.0000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.50668 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2701  Mu-like prophage FluMu protein gp28-like  22.02 
 
 		 595 aa  58.2  0.0000003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1642  hypothetical protein  28.33 
 
 		 517 aa  56.2  0.000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0096  hypothetical protein  23.03 
 
 		 505 aa  55.5  0.000002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0720  hypothetical protein  23.77 
 
 		 602 aa  54.7  0.000004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.0748735 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1352  putative ATPase subunit of terminase (gpP-like)  24.02 
 
 		 601 aa  53.1  0.000009  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.211848  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2327  hypothetical protein  23.62 
 
 		 587 aa  51.2  0.00004  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1399  hypothetical protein  21.87 
 
 		 594 aa  48.1  0.0003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1384  hypothetical protein  28.48 
 
 		 477 aa  48.1  0.0003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0564  hypothetical protein  38.96 
 
 		 477 aa  48.1  0.0003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1915  hypothetical protein  23.25 
 
 		 260 aa  47.8  0.0004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.436221  hitchhiker  0.00000000650109 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05025  hypothetical protein  22.51 
 
 		 593 aa  47  0.0008  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1282  portal protein, putative  24.71 
 
 		 493 aa  46.6  0.0008  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  7.709860000000001e-24 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3372  portal protein, putative  23.82 
 
 		 490 aa  45.8  0.001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2800  putative conserved hypothetical protein  19.45 
 
 		 594 aa  45.8  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3008  hypothetical protein  24.49 
 
 		 547 aa  43.5  0.007  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.505507  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>