64 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hoch_1017 on replicon NC_013440
Organism: Haliangium ochraceum DSM 14365



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013440  Hoch_1017  protein of unknown function DUF264  100 
 
 
478 aa  983    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0830  protein of unknown function DUF264  98.33 
 
 
503 aa  967    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0641  protein of unknown function DUF264  97.91 
 
 
478 aa  970    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0649  hypothetical protein  31.07 
 
 
523 aa  171  2e-41  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1911  protein of unknown function DUF264  32.23 
 
 
427 aa  147  3e-34  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.695816 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3406  hypothetical protein  28 
 
 
482 aa  140  3.9999999999999997e-32  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.662335  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1969  hypothetical protein  30.82 
 
 
426 aa  134  3e-30  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.527917 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3048  hypothetical protein  27.87 
 
 
452 aa  108  1e-22  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0449427  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2933  prophage MuMc02, terminase, ATPase subunit, putative  26.7 
 
 
443 aa  108  2e-22  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0566615  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2103  hypothetical protein  28.19 
 
 
476 aa  104  4e-21  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.136375  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1297  hypothetical protein  28.19 
 
 
476 aa  104  4e-21  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0670  protein of unknown function DUF264  26.48 
 
 
441 aa  94  5e-18  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4503  hypothetical protein  27.21 
 
 
457 aa  92  2e-17  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.443193 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3416  hypothetical protein  26.59 
 
 
521 aa  90.1  7e-17  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.940331  normal 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05025  hypothetical protein  25 
 
 
593 aa  80.9  0.00000000000005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_1057  terminase  24.39 
 
 
605 aa  80.5  0.00000000000006  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3501  hypothetical protein  25.66 
 
 
589 aa  80.1  0.00000000000008  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.203909 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0695  hypothetical protein  22.25 
 
 
577 aa  78.6  0.0000000000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4323  phage large terminase subunit GpP  23.14 
 
 
590 aa  77.8  0.0000000000004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00512482 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01363  phage terminase, ATPase subunit  23.46 
 
 
533 aa  77.8  0.0000000000004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.35276  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3052  phage large terminase subunit GpP  23.35 
 
 
590 aa  77.4  0.0000000000005  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.680947  hitchhiker  0.000000111956 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3289  hypothetical protein  24.45 
 
 
596 aa  75.9  0.000000000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.699131  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1026  terminase, ATPase subunit  24.25 
 
 
590 aa  74.3  0.000000000005  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1282  hypothetical protein  24.94 
 
 
602 aa  73.2  0.000000000009  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4364  hypothetical protein  23.64 
 
 
589 aa  73.2  0.00000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000000000106491 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5052  hypothetical protein  23.16 
 
 
682 aa  73.2  0.00000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0704  hypothetical protein  23.16 
 
 
682 aa  73.2  0.00000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0587  hypothetical protein  25.86 
 
 
601 aa  70.5  0.00000000006  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.50668 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4835  hypothetical protein  21.51 
 
 
588 aa  66.6  0.0000000008  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.283168  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1876  hypothetical protein  24.74 
 
 
513 aa  66.6  0.000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0720  hypothetical protein  23.33 
 
 
602 aa  66.6  0.000000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.0748735 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2800  putative conserved hypothetical protein  20.45 
 
 
594 aa  65.1  0.000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_37610  Phage P2 terminase ATPase subunit, gpP-like protein  22.02 
 
 
585 aa  64.7  0.000000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0943  hypothetical protein  23.79 
 
 
697 aa  63.9  0.000000005  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3833  protein of unknown function DUF264  20.95 
 
 
575 aa  62  0.00000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0239  protein of unknown function DUF264  21.72 
 
 
615 aa  61.6  0.00000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.111761  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3171  hypothetical protein  23.81 
 
 
589 aa  60.8  0.00000004  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2767  hypothetical protein  22.62 
 
 
599 aa  60.8  0.00000005  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.851255 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0897  hypothetical protein  21.91 
 
 
595 aa  60.5  0.00000006  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.672051  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1472  hypothetical protein  22.62 
 
 
599 aa  60.5  0.00000007  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0207  hypothetical protein  21.01 
 
 
583 aa  59.3  0.0000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.256688 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1399  hypothetical protein  23.48 
 
 
594 aa  59.3  0.0000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2327  hypothetical protein  22.43 
 
 
587 aa  56.6  0.0000009  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3493  hypothetical protein  21.98 
 
 
591 aa  53.9  0.000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  hitchhiker  2.68635e-25 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2868  terminase, ATPase subunit  21.32 
 
 
588 aa  53.9  0.000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00833  Terminase, ATPase subunit  20.94 
 
 
588 aa  53.1  0.000009  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00841  hypothetical protein  20.94 
 
 
588 aa  53.1  0.000009  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2937  hypothetical protein  21.96 
 
 
591 aa  52.8  0.00001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  hitchhiker  3.83908e-26 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0924  terminase, ATPase subunit  20.94 
 
 
588 aa  53.1  0.00001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0096  hypothetical protein  22.12 
 
 
505 aa  52.8  0.00001  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3050  terminase, ATPase subunit  20.94 
 
 
588 aa  53.1  0.00001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00590407 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2777  hypothetical protein  20.94 
 
 
588 aa  53.1  0.00001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000134113 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1310  hypothetical protein  20.93 
 
 
522 aa  52  0.00002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0537638  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1384  hypothetical protein  25.79 
 
 
477 aa  50.4  0.00007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2129  hypothetical protein  21.07 
 
 
527 aa  50.1  0.00008  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1352  putative ATPase subunit of terminase (gpP-like)  21.81 
 
 
601 aa  50.4  0.00008  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.211848  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1462  hypothetical protein  23.79 
 
 
421 aa  48.9  0.0002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0375  hypothetical protein  21.07 
 
 
526 aa  49.3  0.0002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0776802  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0564  hypothetical protein  25.9 
 
 
477 aa  47.8  0.0004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1939  terminase (ATPase subunit) related protein  29.23 
 
 
506 aa  47.4  0.0006  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.347904 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1282  portal protein, putative  22.72 
 
 
493 aa  45.4  0.002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  7.709860000000001e-24 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3391  Mu-like prophage FluMu protein GP28  23.11 
 
 
544 aa  45.4  0.002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.50016  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1356  hypothetical protein  22.03 
 
 
254 aa  43.9  0.007  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4366  hypothetical protein  25.67 
 
 
496 aa  43.5  0.009  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.9507  normal  0.531855 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>