51 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dvul_2767 on replicon NC_008751
Organism: Desulfovibrio vulgaris DP4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011883  Ddes_0239  protein of unknown function DUF264  60.23 
 
 
615 aa  702    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.111761  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1472  hypothetical protein  99.5 
 
 
599 aa  1238    Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2767  hypothetical protein  100 
 
 
599 aa  1243    Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.851255 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5052  hypothetical protein  50.68 
 
 
682 aa  572  1.0000000000000001e-162  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0704  hypothetical protein  50.68 
 
 
682 aa  572  1.0000000000000001e-162  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0720  hypothetical protein  47.21 
 
 
602 aa  542  1e-153  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.0748735 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1282  hypothetical protein  46.19 
 
 
602 aa  516  1.0000000000000001e-145  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0587  hypothetical protein  43.19 
 
 
601 aa  511  1e-143  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.50668 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2800  putative conserved hypothetical protein  45.08 
 
 
594 aa  502  1e-141  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2937  hypothetical protein  43.99 
 
 
591 aa  493  9.999999999999999e-139  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  hitchhiker  3.83908e-26 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3493  hypothetical protein  44.16 
 
 
591 aa  494  9.999999999999999e-139  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  hitchhiker  2.68635e-25 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3289  hypothetical protein  44.35 
 
 
596 aa  480  1e-134  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.699131  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0897  hypothetical protein  42.81 
 
 
595 aa  474  1e-132  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.672051  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_1057  terminase  43.15 
 
 
605 aa  471  1.0000000000000001e-131  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0695  hypothetical protein  40.76 
 
 
577 aa  463  1e-129  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05025  hypothetical protein  42.29 
 
 
593 aa  463  1e-129  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1026  terminase, ATPase subunit  41.57 
 
 
590 aa  459  9.999999999999999e-129  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1352  putative ATPase subunit of terminase (gpP-like)  42.81 
 
 
601 aa  450  1e-125  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.211848  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0924  terminase, ATPase subunit  42.64 
 
 
588 aa  445  1.0000000000000001e-124  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0943  hypothetical protein  43 
 
 
697 aa  446  1.0000000000000001e-124  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2868  terminase, ATPase subunit  42.64 
 
 
588 aa  446  1.0000000000000001e-124  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3050  terminase, ATPase subunit  42.64 
 
 
588 aa  446  1.0000000000000001e-124  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00590407 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2777  hypothetical protein  42.47 
 
 
588 aa  444  1e-123  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000134113 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00841  hypothetical protein  42.47 
 
 
588 aa  443  1e-123  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4835  hypothetical protein  42.59 
 
 
588 aa  444  1e-123  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.283168  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00833  Terminase, ATPase subunit  42.47 
 
 
588 aa  443  1e-123  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2916  hypothetical protein  41.01 
 
 
589 aa  444  1e-123  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.518687 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4323  phage large terminase subunit GpP  42.36 
 
 
590 aa  439  9.999999999999999e-123  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00512482 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3171  hypothetical protein  42.54 
 
 
589 aa  439  9.999999999999999e-123  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3052  phage large terminase subunit GpP  42.19 
 
 
590 aa  436  1e-121  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.680947  hitchhiker  0.000000111956 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1399  hypothetical protein  42.74 
 
 
594 aa  437  1e-121  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3501  hypothetical protein  42.64 
 
 
589 aa  431  1e-119  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.203909 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0207  hypothetical protein  42.98 
 
 
583 aa  426  1e-118  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.256688 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_37610  Phage P2 terminase ATPase subunit, gpP-like protein  41.06 
 
 
585 aa  421  1e-116  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01363  phage terminase, ATPase subunit  42.73 
 
 
533 aa  412  1e-114  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.35276  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4364  hypothetical protein  40.65 
 
 
589 aa  407  1.0000000000000001e-112  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000000000106491 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2327  hypothetical protein  39.38 
 
 
587 aa  399  9.999999999999999e-111  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1939  terminase (ATPase subunit) related protein  42.8 
 
 
506 aa  377  1e-103  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.347904 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0773  putative bacteriophage terminase  36.61 
 
 
598 aa  368  1e-100  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.841115  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2641  hypothetical protein  35.47 
 
 
570 aa  359  6e-98  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3833  protein of unknown function DUF264  36.41 
 
 
575 aa  349  1e-94  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1356  hypothetical protein  45.06 
 
 
254 aa  221  3.9999999999999997e-56  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0649  hypothetical protein  22.51 
 
 
523 aa  94  7e-18  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2326  hypothetical protein  28.03 
 
 
241 aa  79  0.0000000000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1940  terminase (ATPase subunit) related protein  55.56 
 
 
89 aa  78.6  0.0000000000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.739724  normal  0.241183 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0830  protein of unknown function DUF264  22.27 
 
 
503 aa  63.9  0.000000008  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0641  protein of unknown function DUF264  21.72 
 
 
478 aa  60.8  0.00000006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1017  protein of unknown function DUF264  22.62 
 
 
478 aa  60.8  0.00000007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1911  protein of unknown function DUF264  22.64 
 
 
427 aa  59.7  0.0000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.695816 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3406  hypothetical protein  21.46 
 
 
482 aa  57.8  0.0000006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.662335  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1969  hypothetical protein  21.29 
 
 
426 aa  45.4  0.003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.527917 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>