50 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PC1_2641 on replicon NC_012917
Organism: Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012880  Dd703_3833  protein of unknown function DUF264  56.64 
 
 		 575 aa  657    Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2641  hypothetical protein  100 
 
 		 570 aa  1187    Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4835  hypothetical protein  49.49 
 
 		 588 aa  568  1e-161  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.283168  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3501  hypothetical protein  49.06 
 
 		 589 aa  566  1e-160  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.203909 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0207  hypothetical protein  49.41 
 
 		 583 aa  558  1e-158  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.256688 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2916  hypothetical protein  48.36 
 
 		 589 aa  556  1e-157  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.518687 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00841  hypothetical protein  49.23 
 
 		 588 aa  556  1e-157  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3050  terminase, ATPase subunit  49.23 
 
 		 588 aa  556  1e-157  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00590407 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2777  hypothetical protein  49.23 
 
 		 588 aa  556  1e-157  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000134113 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0924  terminase, ATPase subunit  49.23 
 
 		 588 aa  556  1e-157  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3289  hypothetical protein  49.57 
 
 		 596 aa  557  1e-157  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.699131  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00833  Terminase, ATPase subunit  49.23 
 
 		 588 aa  556  1e-157  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2868  terminase, ATPase subunit  48.71 
 
 		 588 aa  554  1e-156  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4364  hypothetical protein  47.78 
 
 		 589 aa  554  1e-156  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000000000106491 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4323  phage large terminase subunit GpP  49.3 
 
 		 590 aa  551  1e-155  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00512482 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3052  phage large terminase subunit GpP  49.13 
 
 		 590 aa  546  1e-154  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.680947  hitchhiker  0.000000111956 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1352  putative ATPase subunit of terminase (gpP-like)  48.15 
 
 		 601 aa  540  9.999999999999999e-153  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.211848  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3171  hypothetical protein  48.09 
 
 		 589 aa  541  9.999999999999999e-153  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2327  hypothetical protein  46.42 
 
 		 587 aa  534  1e-150  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_37610  Phage P2 terminase ATPase subunit, gpP-like protein  47.59 
 
 		 585 aa  532  1e-150  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1399  hypothetical protein  45.74 
 
 		 594 aa  520  1e-146  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01363  phage terminase, ATPase subunit  48.13 
 
 		 533 aa  501  1e-140  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.35276  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1939  terminase (ATPase subunit) related protein  49.28 
 
 		 506 aa  473  1e-132  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.347904 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0695  hypothetical protein  41.62 
 
 		 577 aa  432  1e-120  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0587  hypothetical protein  39.46 
 
 		 601 aa  407  1.0000000000000001e-112  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.50668 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05025  hypothetical protein  38.95 
 
 		 593 aa  389  1e-107  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_1057  terminase  37.23 
 
 		 605 aa  381  1e-104  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2937  hypothetical protein  36.79 
 
 		 591 aa  377  1e-103  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  3.83908e-26 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3493  hypothetical protein  36.79 
 
 		 591 aa  375  1e-103  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  2.68635e-25 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5052  hypothetical protein  37.04 
 
 		 682 aa  371  1e-101  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0704  hypothetical protein  37.04 
 
 		 682 aa  371  1e-101  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2800  putative conserved hypothetical protein  37.46 
 
 		 594 aa  365  1e-99  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0897  hypothetical protein  37.2 
 
 		 595 aa  363  4e-99  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.672051  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0720  hypothetical protein  36.71 
 
 		 602 aa  363  4e-99  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.0748735 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1282  hypothetical protein  36.56 
 
 		 602 aa  360  3e-98  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1472  hypothetical protein  35.3 
 
 		 599 aa  353  4e-96  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2767  hypothetical protein  35.3 
 
 		 599 aa  353  5.9999999999999994e-96  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.851255 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1026  terminase, ATPase subunit  37.2 
 
 		 590 aa  348  2e-94  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0943  hypothetical protein  41.89 
 
 		 697 aa  337  2.9999999999999997e-91  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0773  putative bacteriophage terminase  36.05 
 
 		 598 aa  328  2.0000000000000001e-88  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.841115  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0239  protein of unknown function DUF264  33.78 
 
 		 615 aa  321  1.9999999999999998e-86  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.111761  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1356  hypothetical protein  45.31 
 
 		 254 aa  240  4e-62  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0649  hypothetical protein  24.52 
 
 		 523 aa  105  2e-21  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2326  hypothetical protein  32.77 
 
 		 241 aa  98.2  3e-19  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1940  terminase (ATPase subunit) related protein  42.35 
 
 		 89 aa  75.1  0.000000000004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.739724  normal  0.241183 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1911  protein of unknown function DUF264  23.29 
 
 		 427 aa  58.2  0.0000004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.695816 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3406  hypothetical protein  21.12 
 
 		 482 aa  53.5  0.00001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.662335  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1969  hypothetical protein  25.94 
 
 		 426 aa  48.9  0.0002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.527917 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2933  prophage MuMc02, terminase, ATPase subunit, putative  19.6 
 
 		 443 aa  46.6  0.001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0566615  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2359  transposase IS3/IS911 family protein  36.84 
 
 		 81 aa  43.5  0.01  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00000764898  decreased coverage  0.000016732 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>