57 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene YPK_0943 on replicon NC_010465
Organism: Yersinia pseudotuberculosis YPIII



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010465  YPK_0943  hypothetical protein  100 
 
 		 697 aa  1459    Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0897  hypothetical protein  57.36 
 
 		 595 aa  694    Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.672051  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2800  putative conserved hypothetical protein  52.58 
 
 		 594 aa  630  1e-179  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3493  hypothetical protein  51.75 
 
 		 591 aa  621  1e-176  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  2.68635e-25 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2937  hypothetical protein  51.75 
 
 		 591 aa  615  1e-175  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  3.83908e-26 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0720  hypothetical protein  50.83 
 
 		 602 aa  592  1e-168  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.0748735 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_1057  terminase  49.83 
 
 		 605 aa  591  1e-167  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05025  hypothetical protein  49.84 
 
 		 593 aa  589  1e-167  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1282  hypothetical protein  51.25 
 
 		 602 aa  586  1e-166  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1026  terminase, ATPase subunit  49.75 
 
 		 590 aa  564  1.0000000000000001e-159  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5052  hypothetical protein  43.98 
 
 		 682 aa  492  9.999999999999999e-139  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0704  hypothetical protein  43.98 
 
 		 682 aa  492  9.999999999999999e-139  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0695  hypothetical protein  43.19 
 
 		 577 aa  465  1e-129  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0587  hypothetical protein  42.32 
 
 		 601 aa  441  9.999999999999999e-123  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.50668 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1472  hypothetical protein  41.61 
 
 		 599 aa  431  1e-119  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2767  hypothetical protein  41.61 
 
 		 599 aa  431  1e-119  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.851255 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0239  protein of unknown function DUF264  40.27 
 
 		 615 aa  403  1e-111  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.111761  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4323  phage large terminase subunit GpP  40.58 
 
 		 590 aa  402  9.999999999999999e-111  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00512482 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3052  phage large terminase subunit GpP  40.24 
 
 		 590 aa  396  1e-109  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.680947  hitchhiker  0.000000111956 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1352  putative ATPase subunit of terminase (gpP-like)  40.07 
 
 		 601 aa  392  1e-108  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.211848  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3501  hypothetical protein  40.07 
 
 		 589 aa  390  1e-107  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.203909 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4364  hypothetical protein  47.17 
 
 		 589 aa  387  1e-106  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000000000106491 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3050  terminase, ATPase subunit  41.83 
 
 		 588 aa  383  1e-105  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00590407 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2777  hypothetical protein  41.83 
 
 		 588 aa  383  1e-105  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000134113 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1399  hypothetical protein  39.73 
 
 		 594 aa  385  1e-105  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00833  Terminase, ATPase subunit  42.02 
 
 		 588 aa  384  1e-105  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0924  terminase, ATPase subunit  41.83 
 
 		 588 aa  383  1e-105  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3289  hypothetical protein  40.07 
 
 		 596 aa  385  1e-105  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.699131  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00841  hypothetical protein  42.02 
 
 		 588 aa  384  1e-105  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01363  phage terminase, ATPase subunit  41.09 
 
 		 533 aa  379  1e-104  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.35276  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_37610  Phage P2 terminase ATPase subunit, gpP-like protein  40.51 
 
 		 585 aa  382  1e-104  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3171  hypothetical protein  39.28 
 
 		 589 aa  380  1e-104  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2868  terminase, ATPase subunit  38.86 
 
 		 588 aa  382  1e-104  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4835  hypothetical protein  42.59 
 
 		 588 aa  378  1e-103  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.283168  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0207  hypothetical protein  39.33 
 
 		 583 aa  369  1e-100  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.256688 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2327  hypothetical protein  43.48 
 
 		 587 aa  365  1e-99  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2916  hypothetical protein  36.12 
 
 		 589 aa  358  1.9999999999999998e-97  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.518687 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1939  terminase (ATPase subunit) related protein  39.73 
 
 		 506 aa  340  4e-92  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.347904 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2641  hypothetical protein  41.89 
 
 		 570 aa  337  3.9999999999999995e-91  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3833  protein of unknown function DUF264  35.74 
 
 		 575 aa  329  1.0000000000000001e-88  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0773  putative bacteriophage terminase  33.33 
 
 		 598 aa  321  1.9999999999999998e-86  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.841115  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1356  hypothetical protein  41.8 
 
 		 254 aa  194  7e-48  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0649  hypothetical protein  27.07 
 
 		 523 aa  121  4.9999999999999996e-26  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2326  hypothetical protein  27.49 
 
 		 241 aa  72.8  0.00000000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3406  hypothetical protein  26.68 
 
 		 482 aa  72.4  0.00000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.662335  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2933  prophage MuMc02, terminase, ATPase subunit, putative  25.41 
 
 		 443 aa  72  0.00000000003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0566615  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1911  protein of unknown function DUF264  25.63 
 
 		 427 aa  72  0.00000000004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.695816 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0830  protein of unknown function DUF264  23.57 
 
 		 503 aa  64.7  0.000000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1017  protein of unknown function DUF264  23.79 
 
 		 478 aa  63.9  0.000000008  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2103  hypothetical protein  22.13 
 
 		 476 aa  62.4  0.00000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.136375  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1297  hypothetical protein  22.13 
 
 		 476 aa  62.4  0.00000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4503  hypothetical protein  23.17 
 
 		 457 aa  60.1  0.0000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.443193 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1969  hypothetical protein  24.47 
 
 		 426 aa  60.5  0.0000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.527917 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3048  hypothetical protein  23.17 
 
 		 452 aa  59.7  0.0000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0449427  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0641  protein of unknown function DUF264  23.21 
 
 		 478 aa  59.7  0.0000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1940  terminase (ATPase subunit) related protein  41.67 
 
 		 89 aa  58.9  0.0000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.739724  normal  0.241183 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0670  protein of unknown function DUF264  23.48 
 
 		 441 aa  52.8  0.00002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>