54 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SNSL254_A2937 on replicon NC_011080
Organism: Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009784  VIBHAR_05025  hypothetical protein  54.39 
 
 		 593 aa  666    Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1026  terminase, ATPase subunit  55.56 
 
 		 590 aa  636    Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_1057  terminase  51.66 
 
 		 605 aa  652    Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2800  putative conserved hypothetical protein  72.94 
 
 		 594 aa  923    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0897  hypothetical protein  68.39 
 
 		 595 aa  873    Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.672051  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0720  hypothetical protein  54.41 
 
 		 602 aa  669    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.0748735 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3493  hypothetical protein  98.98 
 
 		 591 aa  1229    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  2.68635e-25 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2937  hypothetical protein  100 
 
 		 591 aa  1241    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  3.83908e-26 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1282  hypothetical protein  53.91 
 
 		 602 aa  650    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0943  hypothetical protein  51.75 
 
 		 697 aa  615  1e-175  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5052  hypothetical protein  49.06 
 
 		 682 aa  563  1.0000000000000001e-159  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0704  hypothetical protein  49.06 
 
 		 682 aa  563  1.0000000000000001e-159  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1472  hypothetical protein  43.41 
 
 		 599 aa  477  1e-133  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2767  hypothetical protein  43.24 
 
 		 599 aa  475  1e-132  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.851255 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0695  hypothetical protein  42.81 
 
 		 577 aa  470  1.0000000000000001e-131  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0587  hypothetical protein  40.88 
 
 		 601 aa  458  1e-127  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.50668 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1352  putative ATPase subunit of terminase (gpP-like)  42.66 
 
 		 601 aa  439  9.999999999999999e-123  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.211848  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0239  protein of unknown function DUF264  40.99 
 
 		 615 aa  440  9.999999999999999e-123  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.111761  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2777  hypothetical protein  42.41 
 
 		 588 aa  436  1e-121  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000134113 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00833  Terminase, ATPase subunit  42.58 
 
 		 588 aa  437  1e-121  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4835  hypothetical protein  41.48 
 
 		 588 aa  438  1e-121  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.283168  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2868  terminase, ATPase subunit  42.41 
 
 		 588 aa  437  1e-121  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3050  terminase, ATPase subunit  42.41 
 
 		 588 aa  436  1e-121  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00590407 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0924  terminase, ATPase subunit  42.41 
 
 		 588 aa  436  1e-121  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00841  hypothetical protein  42.58 
 
 		 588 aa  437  1e-121  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3171  hypothetical protein  41.62 
 
 		 589 aa  435  1e-120  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4323  phage large terminase subunit GpP  42.3 
 
 		 590 aa  429  1e-119  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00512482 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3052  phage large terminase subunit GpP  42.3 
 
 		 590 aa  427  1e-118  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.680947  hitchhiker  0.000000111956 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0207  hypothetical protein  41.67 
 
 		 583 aa  426  1e-118  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.256688 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3289  hypothetical protein  41.4 
 
 		 596 aa  426  1e-118  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.699131  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4364  hypothetical protein  41.2 
 
 		 589 aa  422  1e-117  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000000000106491 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3501  hypothetical protein  42 
 
 		 589 aa  421  1e-116  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.203909 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1399  hypothetical protein  41.36 
 
 		 594 aa  416  9.999999999999999e-116  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2916  hypothetical protein  39.15 
 
 		 589 aa  413  1e-114  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.518687 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_37610  Phage P2 terminase ATPase subunit, gpP-like protein  41.49 
 
 		 585 aa  413  1e-114  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01363  phage terminase, ATPase subunit  41.73 
 
 		 533 aa  394  1e-108  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.35276  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2327  hypothetical protein  38.81 
 
 		 587 aa  394  1e-108  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2641  hypothetical protein  36.79 
 
 		 570 aa  377  1e-103  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1939  terminase (ATPase subunit) related protein  42.65 
 
 		 506 aa  365  1e-99  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.347904 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3833  protein of unknown function DUF264  37.65 
 
 		 575 aa  356  5.999999999999999e-97  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0773  putative bacteriophage terminase  36.41 
 
 		 598 aa  353  7e-96  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.841115  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1356  hypothetical protein  45.42 
 
 		 254 aa  219  1e-55  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0649  hypothetical protein  26.27 
 
 		 523 aa  119  9.999999999999999e-26  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2326  hypothetical protein  28.57 
 
 		 241 aa  89.7  1e-16  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1940  terminase (ATPase subunit) related protein  46.67 
 
 		 89 aa  77.4  0.0000000000008  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.739724  normal  0.241183 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1911  protein of unknown function DUF264  24.58 
 
 		 427 aa  73.2  0.00000000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.695816 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1969  hypothetical protein  21.77 
 
 		 426 aa  62  0.00000003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.527917 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3406  hypothetical protein  22.82 
 
 		 482 aa  59.7  0.0000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.662335  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2933  prophage MuMc02, terminase, ATPase subunit, putative  21.35 
 
 		 443 aa  55.5  0.000003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0566615  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0830  protein of unknown function DUF264  22.37 
 
 		 503 aa  52.8  0.00002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1017  protein of unknown function DUF264  21.96 
 
 		 478 aa  52.8  0.00002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0641  protein of unknown function DUF264  21.94 
 
 		 478 aa  50.4  0.00008  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2103  hypothetical protein  18.8 
 
 		 476 aa  45.1  0.004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.136375  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1297  hypothetical protein  18.8 
 
 		 476 aa  45.1  0.004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>