58 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene YPK_2327 on replicon NC_010465
Organism: Yersinia pseudotuberculosis YPIII



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
CP001509  ECD_00833  Terminase, ATPase subunit  63.73 
 
 		 588 aa  807    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3052  phage large terminase subunit GpP  59.9 
 
 		 590 aa  726    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.680947  hitchhiker  0.000000111956 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3050  terminase, ATPase subunit  63.39 
 
 		 588 aa  806    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00590407 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2868  terminase, ATPase subunit  63.56 
 
 		 588 aa  807    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4364  hypothetical protein  57.44 
 
 		 589 aa  681    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000000000106491 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0207  hypothetical protein  57.39 
 
 		 583 aa  686    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.256688 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4323  phage large terminase subunit GpP  60.41 
 
 		 590 aa  733    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00512482 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2777  hypothetical protein  63.39 
 
 		 588 aa  804    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000134113 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2327  hypothetical protein  100 
 
 		 587 aa  1231    Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4835  hypothetical protein  57.53 
 
 		 588 aa  709    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.283168  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2916  hypothetical protein  55.73 
 
 		 589 aa  677    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.518687 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_37610  Phage P2 terminase ATPase subunit, gpP-like protein  55.96 
 
 		 585 aa  670    Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0924  terminase, ATPase subunit  63.56 
 
 		 588 aa  806    Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3501  hypothetical protein  57.84 
 
 		 589 aa  715    Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.203909 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00841  hypothetical protein  63.73 
 
 		 588 aa  807    Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1352  putative ATPase subunit of terminase (gpP-like)  55.27 
 
 		 601 aa  664    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.211848  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3289  hypothetical protein  55.13 
 
 		 596 aa  663    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.699131  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3171  hypothetical protein  60.53 
 
 		 589 aa  738    Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1399  hypothetical protein  52.04 
 
 		 594 aa  625  1e-178  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01363  phage terminase, ATPase subunit  58.17 
 
 		 533 aa  619  1e-176  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.35276  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1939  terminase (ATPase subunit) related protein  58.94 
 
 		 506 aa  606  9.999999999999999e-173  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.347904 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2641  hypothetical protein  46.42 
 
 		 570 aa  534  1e-150  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3833  protein of unknown function DUF264  42.38 
 
 		 575 aa  458  9.999999999999999e-129  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0587  hypothetical protein  42.96 
 
 		 601 aa  455  1.0000000000000001e-126  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.50668 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_1057  terminase  50.54 
 
 		 605 aa  450  1e-125  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0704  hypothetical protein  48.72 
 
 		 682 aa  451  1e-125  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5052  hypothetical protein  48.72 
 
 		 682 aa  451  1e-125  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0695  hypothetical protein  42.41 
 
 		 577 aa  444  1e-123  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05025  hypothetical protein  41.64 
 
 		 593 aa  436  1e-121  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1026  terminase, ATPase subunit  50.91 
 
 		 590 aa  434  1e-120  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1282  hypothetical protein  48.62 
 
 		 602 aa  424  1e-117  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0720  hypothetical protein  44.27 
 
 		 602 aa  421  1e-116  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.0748735 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0897  hypothetical protein  39.79 
 
 		 595 aa  401  9.999999999999999e-111  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.672051  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2800  putative conserved hypothetical protein  42.44 
 
 		 594 aa  400  9.999999999999999e-111  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2937  hypothetical protein  38.81 
 
 		 591 aa  394  1e-108  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  3.83908e-26 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3493  hypothetical protein  38.81 
 
 		 591 aa  394  1e-108  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  2.68635e-25 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1472  hypothetical protein  38.74 
 
 		 599 aa  389  1e-107  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2767  hypothetical protein  38.57 
 
 		 599 aa  388  1e-106  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.851255 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0773  putative bacteriophage terminase  37.37 
 
 		 598 aa  370  1e-101  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.841115  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0943  hypothetical protein  43.48 
 
 		 697 aa  365  1e-100  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0239  protein of unknown function DUF264  37.29 
 
 		 615 aa  343  5.999999999999999e-93  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.111761  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1356  hypothetical protein  59.84 
 
 		 254 aa  322  9.999999999999999e-87  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2326  hypothetical protein  31.43 
 
 		 241 aa  111  4.0000000000000004e-23  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0649  hypothetical protein  23.61 
 
 		 523 aa  110  6e-23  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1940  terminase (ATPase subunit) related protein  53.41 
 
 		 89 aa  105  2e-21  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.739724  normal  0.241183 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1911  protein of unknown function DUF264  27.97 
 
 		 427 aa  65.1  0.000000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.695816 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3048  hypothetical protein  22.17 
 
 		 452 aa  62  0.00000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0449427  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1969  hypothetical protein  30.81 
 
 		 426 aa  62  0.00000003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.527917 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0641  protein of unknown function DUF264  21.77 
 
 		 478 aa  59.7  0.0000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2933  prophage MuMc02, terminase, ATPase subunit, putative  20.93 
 
 		 443 aa  58.9  0.0000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0566615  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0830  protein of unknown function DUF264  21.43 
 
 		 503 aa  56.6  0.000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1017  protein of unknown function DUF264  22.43 
 
 		 478 aa  56.6  0.000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2103  hypothetical protein  21.39 
 
 		 476 aa  55.5  0.000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.136375  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1297  hypothetical protein  21.39 
 
 		 476 aa  55.5  0.000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4503  hypothetical protein  23.62 
 
 		 457 aa  51.6  0.00004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.443193 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0670  protein of unknown function DUF264  21.54 
 
 		 441 aa  51.2  0.00005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3406  hypothetical protein  24.18 
 
 		 482 aa  50.4  0.00009  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.662335  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0096  hypothetical protein  23.78 
 
 		 505 aa  47.4  0.0007  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>