57 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BTH_II1352 on replicon NC_007650
Organism: Burkholderia thailandensis E264



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009800  EcHS_A0924  terminase, ATPase subunit  59.63 
 
 
588 aa  726    Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_37610  Phage P2 terminase ATPase subunit, gpP-like protein  60.9 
 
 
585 aa  722    Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3052  phage large terminase subunit GpP  55.82 
 
 
590 aa  678    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.680947  hitchhiker  0.000000111956 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3050  terminase, ATPase subunit  60.14 
 
 
588 aa  726    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00590407 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2868  terminase, ATPase subunit  60.14 
 
 
588 aa  734    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4364  hypothetical protein  54.24 
 
 
589 aa  655    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000000000106491 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01363  phage terminase, ATPase subunit  64.03 
 
 
533 aa  718    Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.35276  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0207  hypothetical protein  61.87 
 
 
583 aa  728    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.256688 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4323  phage large terminase subunit GpP  56.32 
 
 
590 aa  684    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00512482 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2777  hypothetical protein  59.63 
 
 
588 aa  726    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000134113 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2327  hypothetical protein  55.27 
 
 
587 aa  664    Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4835  hypothetical protein  63.57 
 
 
588 aa  755    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.283168  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2916  hypothetical protein  58.22 
 
 
589 aa  740    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.518687 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00841  hypothetical protein  59.8 
 
 
588 aa  727    Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3501  hypothetical protein  55.92 
 
 
589 aa  672    Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.203909 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00833  Terminase, ATPase subunit  59.8 
 
 
588 aa  727    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3171  hypothetical protein  58.67 
 
 
589 aa  710    Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1399  hypothetical protein  57.96 
 
 
594 aa  703    Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1352  putative ATPase subunit of terminase (gpP-like)  100 
 
 
601 aa  1246    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.211848  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3289  hypothetical protein  64.79 
 
 
596 aa  791    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.699131  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1939  terminase (ATPase subunit) related protein  66.26 
 
 
506 aa  677    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.347904 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2641  hypothetical protein  48.15 
 
 
570 aa  540  9.999999999999999e-153  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05025  hypothetical protein  47.17 
 
 
593 aa  501  1e-140  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1026  terminase, ATPase subunit  47.4 
 
 
590 aa  489  1e-137  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_1057  terminase  44.97 
 
 
605 aa  487  1e-136  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3833  protein of unknown function DUF264  45.72 
 
 
575 aa  479  1e-134  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0720  hypothetical protein  44.56 
 
 
602 aa  477  1e-133  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.0748735 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1282  hypothetical protein  44.41 
 
 
602 aa  473  1e-132  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0695  hypothetical protein  44.15 
 
 
577 aa  463  1e-129  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0704  hypothetical protein  43.69 
 
 
682 aa  454  1.0000000000000001e-126  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5052  hypothetical protein  43.69 
 
 
682 aa  454  1.0000000000000001e-126  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0897  hypothetical protein  43.88 
 
 
595 aa  454  1.0000000000000001e-126  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.672051  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2800  putative conserved hypothetical protein  44.7 
 
 
594 aa  449  1e-125  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3493  hypothetical protein  43.01 
 
 
591 aa  443  1e-123  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  hitchhiker  2.68635e-25 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2937  hypothetical protein  42.66 
 
 
591 aa  439  9.999999999999999e-123  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  hitchhiker  3.83908e-26 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1472  hypothetical protein  41.96 
 
 
599 aa  436  1e-121  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0587  hypothetical protein  41.09 
 
 
601 aa  437  1e-121  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.50668 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2767  hypothetical protein  41.79 
 
 
599 aa  433  1e-120  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.851255 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0239  protein of unknown function DUF264  40.44 
 
 
615 aa  412  1e-113  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.111761  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0943  hypothetical protein  40.07 
 
 
697 aa  392  1e-108  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0773  putative bacteriophage terminase  38.1 
 
 
598 aa  388  1e-106  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.841115  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1356  hypothetical protein  59.29 
 
 
254 aa  311  2e-83  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2326  hypothetical protein  33.9 
 
 
241 aa  119  9.999999999999999e-26  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0649  hypothetical protein  25.16 
 
 
523 aa  117  5e-25  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1940  terminase (ATPase subunit) related protein  56.32 
 
 
89 aa  109  2e-22  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.739724  normal  0.241183 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2103  hypothetical protein  22.08 
 
 
476 aa  60.1  0.0000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.136375  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1297  hypothetical protein  22.08 
 
 
476 aa  60.1  0.0000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1911  protein of unknown function DUF264  30.06 
 
 
427 aa  59.3  0.0000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.695816 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3406  hypothetical protein  24.05 
 
 
482 aa  57  0.000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.662335  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4503  hypothetical protein  24.23 
 
 
457 aa  51.6  0.00004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.443193 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3048  hypothetical protein  22.38 
 
 
452 aa  51.2  0.00006  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0449427  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1969  hypothetical protein  26.47 
 
 
426 aa  50.4  0.00009  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.527917 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1017  protein of unknown function DUF264  21.81 
 
 
478 aa  50.4  0.0001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0096  hypothetical protein  24.26 
 
 
505 aa  48.1  0.0004  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0830  protein of unknown function DUF264  21.38 
 
 
503 aa  47.8  0.0005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2933  prophage MuMc02, terminase, ATPase subunit, putative  30.83 
 
 
443 aa  48.1  0.0005  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0566615  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0641  protein of unknown function DUF264  23.61 
 
 
478 aa  45.8  0.002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>