52 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dd703_3833 on replicon NC_012880
Organism: Dickeya dadantii Ech703



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012880  Dd703_3833  protein of unknown function DUF264  100 
 
 
575 aa  1199    Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2641  hypothetical protein  56.64 
 
 
570 aa  657    Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4835  hypothetical protein  49.41 
 
 
588 aa  518  1e-146  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.283168  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0207  hypothetical protein  49.48 
 
 
583 aa  503  1e-141  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.256688 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00833  Terminase, ATPase subunit  47.59 
 
 
588 aa  499  1e-140  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00841  hypothetical protein  47.59 
 
 
588 aa  499  1e-140  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3050  terminase, ATPase subunit  47.42 
 
 
588 aa  498  1e-139  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00590407 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2868  terminase, ATPase subunit  47.42 
 
 
588 aa  498  1e-139  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4323  phage large terminase subunit GpP  46.84 
 
 
590 aa  496  1e-139  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00512482 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2777  hypothetical protein  47.42 
 
 
588 aa  498  1e-139  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000134113 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0924  terminase, ATPase subunit  47.42 
 
 
588 aa  498  1e-139  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2916  hypothetical protein  46.67 
 
 
589 aa  489  1e-137  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.518687 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3052  phage large terminase subunit GpP  46.49 
 
 
590 aa  491  1e-137  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.680947  hitchhiker  0.000000111956 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3501  hypothetical protein  46.43 
 
 
589 aa  491  1e-137  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.203909 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3289  hypothetical protein  45.61 
 
 
596 aa  489  1e-137  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.699131  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_37610  Phage P2 terminase ATPase subunit, gpP-like protein  45.97 
 
 
585 aa  483  1e-135  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1352  putative ATPase subunit of terminase (gpP-like)  45.72 
 
 
601 aa  479  1e-134  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.211848  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3171  hypothetical protein  46.61 
 
 
589 aa  474  1e-132  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4364  hypothetical protein  44.7 
 
 
589 aa  471  1.0000000000000001e-131  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000000000106491 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1399  hypothetical protein  43.94 
 
 
594 aa  467  9.999999999999999e-131  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2327  hypothetical protein  42.38 
 
 
587 aa  458  9.999999999999999e-129  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01363  phage terminase, ATPase subunit  46.47 
 
 
533 aa  452  1.0000000000000001e-126  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.35276  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1939  terminase (ATPase subunit) related protein  47.65 
 
 
506 aa  438  1e-121  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.347904 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0695  hypothetical protein  38.73 
 
 
577 aa  383  1e-105  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0587  hypothetical protein  37.14 
 
 
601 aa  369  1e-101  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.50668 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0897  hypothetical protein  37.11 
 
 
595 aa  362  1e-98  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.672051  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0720  hypothetical protein  38.17 
 
 
602 aa  360  3e-98  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.0748735 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05025  hypothetical protein  37.12 
 
 
593 aa  357  3.9999999999999996e-97  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3493  hypothetical protein  37.65 
 
 
591 aa  357  3.9999999999999996e-97  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  hitchhiker  2.68635e-25 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0704  hypothetical protein  38.82 
 
 
682 aa  357  5e-97  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5052  hypothetical protein  38.82 
 
 
682 aa  357  5e-97  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2937  hypothetical protein  37.65 
 
 
591 aa  356  5.999999999999999e-97  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  hitchhiker  3.83908e-26 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_1057  terminase  37.02 
 
 
605 aa  356  6.999999999999999e-97  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2800  putative conserved hypothetical protein  38.59 
 
 
594 aa  352  1e-95  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1026  terminase, ATPase subunit  37.05 
 
 
590 aa  345  1e-93  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1282  hypothetical protein  35.77 
 
 
602 aa  342  1e-92  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1472  hypothetical protein  35.4 
 
 
599 aa  334  2e-90  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2767  hypothetical protein  35.4 
 
 
599 aa  333  3e-90  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.851255 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0943  hypothetical protein  35.74 
 
 
697 aa  329  1.0000000000000001e-88  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0239  protein of unknown function DUF264  35.23 
 
 
615 aa  318  2e-85  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.111761  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0773  putative bacteriophage terminase  33.86 
 
 
598 aa  290  6e-77  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.841115  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1356  hypothetical protein  43.67 
 
 
254 aa  208  3e-52  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0649  hypothetical protein  23.76 
 
 
523 aa  104  5e-21  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2326  hypothetical protein  29.29 
 
 
241 aa  86.3  0.000000000000001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0830  protein of unknown function DUF264  21.4 
 
 
503 aa  63.2  0.00000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1911  protein of unknown function DUF264  23.6 
 
 
427 aa  63.5  0.00000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.695816 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1017  protein of unknown function DUF264  20.95 
 
 
478 aa  62  0.00000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0641  protein of unknown function DUF264  20.5 
 
 
478 aa  60.1  0.0000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3406  hypothetical protein  23.7 
 
 
482 aa  57.8  0.0000005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.662335  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1940  terminase (ATPase subunit) related protein  41.67 
 
 
89 aa  55.5  0.000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.739724  normal  0.241183 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1969  hypothetical protein  23.21 
 
 
426 aa  49.3  0.0002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.527917 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1462  hypothetical protein  23.79 
 
 
421 aa  43.9  0.008  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>