53 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcenmc03_0207 on replicon NC_010508
Organism: Burkholderia cenocepacia MC0-3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
CP001509  ECD_00833  Terminase, ATPase subunit  63.68 
 
 
588 aa  788    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01363  phage terminase, ATPase subunit  59.26 
 
 
533 aa  654    Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.35276  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0207  hypothetical protein  100 
 
 
583 aa  1209    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.256688 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4323  phage large terminase subunit GpP  60.1 
 
 
590 aa  703    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00512482 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2777  hypothetical protein  63.85 
 
 
588 aa  789    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000134113 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2327  hypothetical protein  56.71 
 
 
587 aa  706    Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4364  hypothetical protein  58.12 
 
 
589 aa  675    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000000000106491 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2868  terminase, ATPase subunit  64.36 
 
 
588 aa  793    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4835  hypothetical protein  90.82 
 
 
588 aa  1120    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.283168  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2916  hypothetical protein  59.76 
 
 
589 aa  763    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.518687 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3050  terminase, ATPase subunit  63.85 
 
 
588 aa  788    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00590407 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0924  terminase, ATPase subunit  63.85 
 
 
588 aa  788    Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3501  hypothetical protein  59.04 
 
 
589 aa  694    Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.203909 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3052  phage large terminase subunit GpP  59.58 
 
 
590 aa  696    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.680947  hitchhiker  0.000000111956 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3289  hypothetical protein  59.14 
 
 
596 aa  720    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.699131  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1939  terminase (ATPase subunit) related protein  66.33 
 
 
506 aa  676    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.347904 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3171  hypothetical protein  63.54 
 
 
589 aa  759    Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1352  putative ATPase subunit of terminase (gpP-like)  61.96 
 
 
601 aa  745    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.211848  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1399  hypothetical protein  55.46 
 
 
594 aa  668    Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00841  hypothetical protein  63.68 
 
 
588 aa  788    Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_37610  Phage P2 terminase ATPase subunit, gpP-like protein  56.85 
 
 
585 aa  676    Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2641  hypothetical protein  49.58 
 
 
570 aa  573  1.0000000000000001e-162  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3833  protein of unknown function DUF264  49.91 
 
 
575 aa  524  1e-147  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5052  hypothetical protein  45.1 
 
 
682 aa  494  9.999999999999999e-139  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0704  hypothetical protein  45.1 
 
 
682 aa  494  9.999999999999999e-139  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1026  terminase, ATPase subunit  44.56 
 
 
590 aa  478  1e-133  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_1057  terminase  43.68 
 
 
605 aa  476  1e-133  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05025  hypothetical protein  43.89 
 
 
593 aa  475  1e-132  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1282  hypothetical protein  44.5 
 
 
602 aa  473  1e-132  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0720  hypothetical protein  43.78 
 
 
602 aa  465  9.999999999999999e-131  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.0748735 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0695  hypothetical protein  44.17 
 
 
577 aa  468  9.999999999999999e-131  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2800  putative conserved hypothetical protein  43.84 
 
 
594 aa  460  9.999999999999999e-129  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0897  hypothetical protein  43.21 
 
 
595 aa  456  1e-127  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.672051  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0587  hypothetical protein  41.85 
 
 
601 aa  453  1.0000000000000001e-126  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.50668 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3493  hypothetical protein  42.2 
 
 
591 aa  450  1e-125  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  hitchhiker  2.68635e-25 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2937  hypothetical protein  41.84 
 
 
591 aa  448  1.0000000000000001e-124  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  hitchhiker  3.83908e-26 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1472  hypothetical protein  42.27 
 
 
599 aa  432  1e-120  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2767  hypothetical protein  42.1 
 
 
599 aa  431  1e-119  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.851255 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0239  protein of unknown function DUF264  42.09 
 
 
615 aa  419  1e-116  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.111761  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0773  putative bacteriophage terminase  39.72 
 
 
598 aa  399  9.999999999999999e-111  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.841115  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0943  hypothetical protein  39.16 
 
 
697 aa  384  1e-105  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1356  hypothetical protein  63.39 
 
 
254 aa  345  8.999999999999999e-94  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1940  terminase (ATPase subunit) related protein  65.91 
 
 
89 aa  128  3e-28  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.739724  normal  0.241183 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0649  hypothetical protein  27.13 
 
 
523 aa  127  5e-28  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2326  hypothetical protein  35.17 
 
 
241 aa  121  3e-26  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0641  protein of unknown function DUF264  21.98 
 
 
478 aa  63.5  0.00000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1017  protein of unknown function DUF264  21.23 
 
 
478 aa  62.4  0.00000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0830  protein of unknown function DUF264  21.23 
 
 
503 aa  61.2  0.00000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3406  hypothetical protein  23.76 
 
 
482 aa  55.5  0.000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.662335  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1911  protein of unknown function DUF264  24.14 
 
 
427 aa  55.1  0.000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.695816 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1969  hypothetical protein  25.48 
 
 
426 aa  52.8  0.00002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.527917 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2933  prophage MuMc02, terminase, ATPase subunit, putative  21.24 
 
 
443 aa  52.4  0.00002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0566615  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0096  hypothetical protein  28 
 
 
505 aa  49.3  0.0002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>