53 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ddes_0239 on replicon NC_011883
Organism: Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011883  Ddes_0239  protein of unknown function DUF264  100 
 
 		 615 aa  1280    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.111761  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1472  hypothetical protein  59.8 
 
 		 599 aa  704    Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2767  hypothetical protein  59.63 
 
 		 599 aa  703    Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.851255 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5052  hypothetical protein  49.07 
 
 		 682 aa  535  1e-151  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0704  hypothetical protein  49.07 
 
 		 682 aa  535  1e-151  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0720  hypothetical protein  44.57 
 
 		 602 aa  486  1e-136  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.0748735 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1282  hypothetical protein  43.56 
 
 		 602 aa  466  9.999999999999999e-131  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2800  putative conserved hypothetical protein  42.62 
 
 		 594 aa  465  1e-129  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3493  hypothetical protein  41.67 
 
 		 591 aa  457  1e-127  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  2.68635e-25 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0587  hypothetical protein  41.71 
 
 		 601 aa  458  1e-127  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.50668 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2937  hypothetical protein  41.33 
 
 		 591 aa  452  1.0000000000000001e-126  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  3.83908e-26 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0897  hypothetical protein  39.77 
 
 		 595 aa  441  9.999999999999999e-123  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.672051  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_1057  terminase  41.48 
 
 		 605 aa  441  9.999999999999999e-123  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05025  hypothetical protein  42.02 
 
 		 593 aa  430  1e-119  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2916  hypothetical protein  41.14 
 
 		 589 aa  428  1e-118  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.518687 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4835  hypothetical protein  42.57 
 
 		 588 aa  427  1e-118  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.283168  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1026  terminase, ATPase subunit  42.61 
 
 		 590 aa  428  1e-118  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0695  hypothetical protein  40.27 
 
 		 577 aa  426  1e-118  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1352  putative ATPase subunit of terminase (gpP-like)  40.7 
 
 		 601 aa  427  1e-118  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.211848  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00833  Terminase, ATPase subunit  41.69 
 
 		 588 aa  423  1e-117  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2777  hypothetical protein  41.5 
 
 		 588 aa  423  1e-117  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000134113 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00841  hypothetical protein  41.69 
 
 		 588 aa  423  1e-117  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0924  terminase, ATPase subunit  41.5 
 
 		 588 aa  422  1e-117  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3050  terminase, ATPase subunit  42.02 
 
 		 588 aa  421  1e-116  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00590407 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2868  terminase, ATPase subunit  41.67 
 
 		 588 aa  422  1e-116  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3289  hypothetical protein  41.89 
 
 		 596 aa  421  1e-116  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.699131  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0943  hypothetical protein  40.77 
 
 		 697 aa  417  9.999999999999999e-116  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0207  hypothetical protein  41.14 
 
 		 583 aa  407  1.0000000000000001e-112  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.256688 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3171  hypothetical protein  40.91 
 
 		 589 aa  394  1e-108  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1399  hypothetical protein  39.93 
 
 		 594 aa  394  1e-108  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_37610  Phage P2 terminase ATPase subunit, gpP-like protein  40 
 
 		 585 aa  388  1e-106  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01363  phage terminase, ATPase subunit  40.15 
 
 		 533 aa  370  1e-101  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.35276  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3501  hypothetical protein  38.96 
 
 		 589 aa  370  1e-101  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.203909 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3052  phage large terminase subunit GpP  39.27 
 
 		 590 aa  368  1e-100  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.680947  hitchhiker  0.000000111956 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4323  phage large terminase subunit GpP  39.27 
 
 		 590 aa  369  1e-100  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00512482 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4364  hypothetical protein  39.32 
 
 		 589 aa  359  6e-98  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000000000106491 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2327  hypothetical protein  37.54 
 
 		 587 aa  356  5.999999999999999e-97  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0773  putative bacteriophage terminase  36.05 
 
 		 598 aa  350  5e-95  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.841115  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1939  terminase (ATPase subunit) related protein  40.27 
 
 		 506 aa  336  7.999999999999999e-91  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.347904 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2641  hypothetical protein  34.29 
 
 		 570 aa  333  5e-90  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3833  protein of unknown function DUF264  35.79 
 
 		 575 aa  326  7e-88  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1356  hypothetical protein  44.26 
 
 		 254 aa  197  5.000000000000001e-49  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0649  hypothetical protein  23.5 
 
 		 523 aa  105  3e-21  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1940  terminase (ATPase subunit) related protein  51.39 
 
 		 89 aa  73.6  0.00000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.739724  normal  0.241183 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0830  protein of unknown function DUF264  22.47 
 
 		 503 aa  63.5  0.000000009  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0641  protein of unknown function DUF264  21.95 
 
 		 478 aa  62.4  0.00000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2326  hypothetical protein  25.69 
 
 		 241 aa  62  0.00000003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1017  protein of unknown function DUF264  21.72 
 
 		 478 aa  60.5  0.00000008  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3406  hypothetical protein  24.23 
 
 		 482 aa  58.2  0.0000005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.662335  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1911  protein of unknown function DUF264  23.96 
 
 		 427 aa  49.7  0.0002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.695816 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1462  hypothetical protein  25 
 
 		 421 aa  48.1  0.0004  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1969  hypothetical protein  23.08 
 
 		 426 aa  47.4  0.0008  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.527917 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0670  protein of unknown function DUF264  22.49 
 
 		 441 aa  46.6  0.002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>