58 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmwyl1_0587 on replicon NC_009654
Organism: Marinomonas sp. MWYL1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009654  Mmwyl1_0587  hypothetical protein  100 
 
 
601 aa  1252    Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.50668 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5052  hypothetical protein  46.71 
 
 
682 aa  527  1e-148  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0704  hypothetical protein  46.71 
 
 
682 aa  527  1e-148  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0695  hypothetical protein  45.9 
 
 
577 aa  521  1e-146  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_1057  terminase  44.13 
 
 
605 aa  496  1e-139  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1472  hypothetical protein  42.83 
 
 
599 aa  494  9.999999999999999e-139  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2767  hypothetical protein  42.83 
 
 
599 aa  493  9.999999999999999e-139  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.851255 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05025  hypothetical protein  43.26 
 
 
593 aa  486  1e-136  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0720  hypothetical protein  43.75 
 
 
602 aa  484  1e-135  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.0748735 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0897  hypothetical protein  42.43 
 
 
595 aa  473  1e-132  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.672051  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1282  hypothetical protein  43.59 
 
 
602 aa  473  1e-132  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3289  hypothetical protein  42.03 
 
 
596 aa  468  9.999999999999999e-131  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.699131  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3493  hypothetical protein  41.22 
 
 
591 aa  462  1e-129  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  hitchhiker  2.68635e-25 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2800  putative conserved hypothetical protein  42.23 
 
 
594 aa  465  1e-129  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2937  hypothetical protein  40.88 
 
 
591 aa  458  1e-127  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  hitchhiker  3.83908e-26 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1026  terminase, ATPase subunit  43.09 
 
 
590 aa  457  1e-127  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2327  hypothetical protein  42.96 
 
 
587 aa  455  1.0000000000000001e-126  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4323  phage large terminase subunit GpP  42.32 
 
 
590 aa  448  1.0000000000000001e-124  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00512482 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0239  protein of unknown function DUF264  41.16 
 
 
615 aa  446  1.0000000000000001e-124  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.111761  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00833  Terminase, ATPase subunit  40.89 
 
 
588 aa  444  1e-123  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2777  hypothetical protein  40.73 
 
 
588 aa  442  1e-123  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000134113 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3052  phage large terminase subunit GpP  42.15 
 
 
590 aa  444  1e-123  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.680947  hitchhiker  0.000000111956 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3050  terminase, ATPase subunit  41.22 
 
 
588 aa  443  1e-123  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00590407 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0924  terminase, ATPase subunit  40.89 
 
 
588 aa  444  1e-123  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3501  hypothetical protein  42.18 
 
 
589 aa  442  1e-123  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.203909 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00841  hypothetical protein  40.89 
 
 
588 aa  444  1e-123  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2868  terminase, ATPase subunit  40.83 
 
 
588 aa  440  9.999999999999999e-123  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0943  hypothetical protein  42.32 
 
 
697 aa  441  9.999999999999999e-123  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4835  hypothetical protein  40.87 
 
 
588 aa  438  1e-121  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.283168  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1352  putative ATPase subunit of terminase (gpP-like)  41.09 
 
 
601 aa  437  1e-121  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.211848  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0207  hypothetical protein  41.39 
 
 
583 aa  432  1e-120  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.256688 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1399  hypothetical protein  40.82 
 
 
594 aa  433  1e-120  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3171  hypothetical protein  42.66 
 
 
589 aa  431  1e-119  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_37610  Phage P2 terminase ATPase subunit, gpP-like protein  40.34 
 
 
585 aa  428  1e-118  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2916  hypothetical protein  40.55 
 
 
589 aa  426  1e-118  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.518687 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4364  hypothetical protein  40.89 
 
 
589 aa  420  1e-116  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000000000106491 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01363  phage terminase, ATPase subunit  46.51 
 
 
533 aa  417  9.999999999999999e-116  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.35276  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2641  hypothetical protein  39.46 
 
 
570 aa  407  1.0000000000000001e-112  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0773  putative bacteriophage terminase  38.32 
 
 
598 aa  380  1e-104  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.841115  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3833  protein of unknown function DUF264  37.14 
 
 
575 aa  369  1e-101  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1939  terminase (ATPase subunit) related protein  40.2 
 
 
506 aa  364  3e-99  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.347904 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1356  hypothetical protein  44.13 
 
 
254 aa  212  1e-53  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0649  hypothetical protein  22.69 
 
 
523 aa  130  1.0000000000000001e-28  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2326  hypothetical protein  29.5 
 
 
241 aa  93.2  1e-17  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1911  protein of unknown function DUF264  23.49 
 
 
427 aa  76.3  0.000000000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.695816 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0641  protein of unknown function DUF264  22.87 
 
 
478 aa  74.3  0.000000000007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0830  protein of unknown function DUF264  23.53 
 
 
503 aa  73.6  0.00000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1940  terminase (ATPase subunit) related protein  48 
 
 
89 aa  71.2  0.00000000005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.739724  normal  0.241183 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2933  prophage MuMc02, terminase, ATPase subunit, putative  19.87 
 
 
443 aa  70.9  0.00000000007  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0566615  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1017  protein of unknown function DUF264  25.86 
 
 
478 aa  70.5  0.00000000008  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0670  protein of unknown function DUF264  23.04 
 
 
441 aa  68.6  0.0000000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3048  hypothetical protein  22.78 
 
 
452 aa  67.4  0.0000000006  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0449427  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1969  hypothetical protein  22.37 
 
 
426 aa  63.5  0.00000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.527917 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3406  hypothetical protein  22.68 
 
 
482 aa  60.5  0.00000009  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.662335  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2103  hypothetical protein  20.65 
 
 
476 aa  58.5  0.0000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.136375  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1297  hypothetical protein  20.65 
 
 
476 aa  58.5  0.0000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4503  hypothetical protein  21.72 
 
 
457 aa  58.2  0.0000004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.443193 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0096  hypothetical protein  23.84 
 
 
505 aa  45.1  0.003  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>