52 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpal_0670 on replicon NC_011004
Organism: Rhodopseudomonas palustris TIE-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011989  Avi_3048  hypothetical protein  78.26 
 
 		 452 aa  701    Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0449427  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0670  protein of unknown function DUF264  100 
 
 		 441 aa  905    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4503  hypothetical protein  80 
 
 		 457 aa  685    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.443193 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2933  prophage MuMc02, terminase, ATPase subunit, putative  63.72 
 
 		 443 aa  541  1e-153  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0566615  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2103  hypothetical protein  57.8 
 
 		 476 aa  486  1e-136  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.136375  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1297  hypothetical protein  57.8 
 
 		 476 aa  486  1e-136  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1911  protein of unknown function DUF264  47.62 
 
 		 427 aa  330  3e-89  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.695816 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1969  hypothetical protein  44.85 
 
 		 426 aa  305  9.000000000000001e-82  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.527917 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3406  hypothetical protein  36.93 
 
 		 482 aa  236  4e-61  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.662335  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3416  hypothetical protein  35.38 
 
 		 521 aa  157  5.0000000000000005e-37  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.940331  normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0649  hypothetical protein  28.47 
 
 		 523 aa  144  2e-33  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0641  protein of unknown function DUF264  26.7 
 
 		 478 aa  95.5  2e-18  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1017  protein of unknown function DUF264  26.48 
 
 		 478 aa  94  4e-18  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0830  protein of unknown function DUF264  25.82 
 
 		 503 aa  92  2e-17  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0666  prophage MuSo1, portal protein, putative  26.21 
 
 		 546 aa  87.8  3e-16  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2135  prophage MuSo1, portal protein, putative  26.88 
 
 		 546 aa  88.2  3e-16  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2088  prophage MuSo1, portal protein, putative  26.88 
 
 		 546 aa  87.4  4e-16  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0947183  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1876  hypothetical protein  29.6 
 
 		 513 aa  74.7  0.000000000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2679  prophage MuSo2, portal protein, putative  23.37 
 
 		 519 aa  70.5  0.00000000005  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2249  hypothetical protein  29.24 
 
 		 560 aa  70.1  0.00000000008  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0673  portal protein  27.6 
 
 		 521 aa  69.3  0.0000000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0764  portal protein  27.6 
 
 		 521 aa  69.3  0.0000000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0587  hypothetical protein  23.04 
 
 		 601 aa  68.6  0.0000000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.50668 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3782  hypothetical protein  24.45 
 
 		 525 aa  67.8  0.0000000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.468452  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2701  Mu-like prophage FluMu protein gp28-like  23.31 
 
 		 595 aa  67  0.0000000006  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0695  hypothetical protein  22.62 
 
 		 577 aa  62.4  0.00000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3289  hypothetical protein  22.57 
 
 		 596 aa  58.5  0.0000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.699131  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01363  phage terminase, ATPase subunit  22.94 
 
 		 533 aa  55.5  0.000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.35276  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1384  hypothetical protein  29.76 
 
 		 477 aa  55.5  0.000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1642  hypothetical protein  29.71 
 
 		 517 aa  55.8  0.000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1282  portal protein, putative  24.64 
 
 		 493 aa  54.3  0.000004  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  7.709860000000001e-24 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0564  hypothetical protein  31.97 
 
 		 477 aa  53.9  0.000006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3372  portal protein, putative  24.75 
 
 		 490 aa  53.1  0.000009  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0943  hypothetical protein  23.48 
 
 		 697 aa  52.8  0.00001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1282  hypothetical protein  23.24 
 
 		 602 aa  51.2  0.00003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2327  hypothetical protein  21.54 
 
 		 587 aa  51.2  0.00004  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0720  hypothetical protein  22.83 
 
 		 602 aa  51.2  0.00004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.0748735 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3391  Mu-like prophage FluMu protein GP28  29.92 
 
 		 544 aa  50.1  0.00008  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.50016  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0096  hypothetical protein  24.55 
 
 		 505 aa  48.9  0.0002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2800  putative conserved hypothetical protein  21.16 
 
 		 594 aa  48.1  0.0003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2868  terminase, ATPase subunit  22.67 
 
 		 588 aa  48.1  0.0003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3008  hypothetical protein  27.15 
 
 		 547 aa  47.4  0.0006  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.505507  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00841  hypothetical protein  21.9 
 
 		 588 aa  46.6  0.0008  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00833  Terminase, ATPase subunit  21.9 
 
 		 588 aa  46.6  0.0008  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0239  protein of unknown function DUF264  22.49 
 
 		 615 aa  46.6  0.0009  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.111761  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_37610  Phage P2 terminase ATPase subunit, gpP-like protein  23.73 
 
 		 585 aa  46.2  0.001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3050  terminase, ATPase subunit  22.35 
 
 		 588 aa  45.4  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00590407 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2777  hypothetical protein  22.35 
 
 		 588 aa  45.4  0.002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000134113 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0924  terminase, ATPase subunit  21.9 
 
 		 588 aa  45.8  0.002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3171  hypothetical protein  22 
 
 		 589 aa  43.9  0.006  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1915  hypothetical protein  25.85 
 
 		 260 aa  43.9  0.006  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.436221  hitchhiker  0.00000000650109 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1399  hypothetical protein  21.68 
 
 		 594 aa  43.5  0.007  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>