27 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sbal195_2135 on replicon NC_009997
Organism: Shewanella baltica OS195



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004347  SO_0666  prophage MuSo1, portal protein, putative  91.21 
 
 		 546 aa  1023    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2135  prophage MuSo1, portal protein, putative  100 
 
 		 546 aa  1131    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2088  prophage MuSo1, portal protein, putative  98.9 
 
 		 546 aa  1123    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0947183  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2679  prophage MuSo2, portal protein, putative  64.4 
 
 		 519 aa  587  1e-166  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0764  portal protein  62.35 
 
 		 521 aa  566  1e-160  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0673  portal protein  62.35 
 
 		 521 aa  566  1e-160  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3391  Mu-like prophage FluMu protein GP28  49.79 
 
 		 544 aa  441  9.999999999999999e-123  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.50016  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1876  hypothetical protein  47.43 
 
 		 513 aa  433  1e-120  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3782  hypothetical protein  47.2 
 
 		 525 aa  427  1e-118  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.468452  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1642  hypothetical protein  50 
 
 		 517 aa  419  1e-116  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3372  portal protein, putative  48.91 
 
 		 490 aa  418  9.999999999999999e-116  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2249  hypothetical protein  45.38 
 
 		 560 aa  406  1.0000000000000001e-112  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1282  portal protein, putative  47.25 
 
 		 493 aa  394  1e-108  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  7.709860000000001e-24 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3008  hypothetical protein  42.89 
 
 		 547 aa  353  5e-96  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.505507  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2701  Mu-like prophage FluMu protein gp28-like  40.85 
 
 		 595 aa  348  1e-94  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3048  hypothetical protein  26.95 
 
 		 452 aa  102  2e-20  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0449427  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2103  hypothetical protein  26.39 
 
 		 476 aa  92.8  1e-17  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.136375  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1297  hypothetical protein  26.39 
 
 		 476 aa  92.8  1e-17  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3406  hypothetical protein  25.37 
 
 		 482 aa  93.2  1e-17  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.662335  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1969  hypothetical protein  25.13 
 
 		 426 aa  89.4  2e-16  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.527917 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0670  protein of unknown function DUF264  26.88 
 
 		 441 aa  88.2  3e-16  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2933  prophage MuMc02, terminase, ATPase subunit, putative  24.95 
 
 		 443 aa  75.5  0.000000000003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0566615  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4503  hypothetical protein  25.66 
 
 		 457 aa  73.9  0.000000000007  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.443193 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3416  hypothetical protein  25.42 
 
 		 521 aa  71.6  0.00000000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.940331  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1911  protein of unknown function DUF264  34.46 
 
 		 427 aa  71.2  0.00000000004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.695816 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3289  hypothetical protein  25.26 
 
 		 596 aa  47  0.0008  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.699131  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0830  protein of unknown function DUF264  23.28 
 
 		 503 aa  44.7  0.004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>