20 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avi_3008 on replicon NC_011989
Organism: Agrobacterium vitis S4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011989  Avi_3008  hypothetical protein  100 
 
 		 547 aa  1123    Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.505507  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3391  Mu-like prophage FluMu protein GP28  48.2 
 
 		 544 aa  455  1e-127  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.50016  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2088  prophage MuSo1, portal protein, putative  43.09 
 
 		 546 aa  353  5e-96  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0947183  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2135  prophage MuSo1, portal protein, putative  42.89 
 
 		 546 aa  353  5.9999999999999994e-96  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3372  portal protein, putative  44.18 
 
 		 490 aa  348  1e-94  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1876  hypothetical protein  43.87 
 
 		 513 aa  342  7e-93  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0673  portal protein  39.85 
 
 		 521 aa  335  2e-90  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0764  portal protein  39.85 
 
 		 521 aa  335  2e-90  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0666  prophage MuSo1, portal protein, putative  40.88 
 
 		 546 aa  330  5.0000000000000004e-89  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1642  hypothetical protein  45.05 
 
 		 517 aa  329  7e-89  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3782  hypothetical protein  40.7 
 
 		 525 aa  323  4e-87  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.468452  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2679  prophage MuSo2, portal protein, putative  40.37 
 
 		 519 aa  322  9.999999999999999e-87  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1282  portal protein, putative  42.34 
 
 		 493 aa  320  3.9999999999999996e-86  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  7.709860000000001e-24 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2249  hypothetical protein  36.64 
 
 		 560 aa  290  6e-77  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2701  Mu-like prophage FluMu protein gp28-like  35.84 
 
 		 595 aa  248  1e-64  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3048  hypothetical protein  25.6 
 
 		 452 aa  83.2  0.00000000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0449427  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3406  hypothetical protein  30.99 
 
 		 482 aa  62.8  0.00000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.662335  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3416  hypothetical protein  23.43 
 
 		 521 aa  59.3  0.0000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.940331  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1969  hypothetical protein  22.94 
 
 		 426 aa  49.3  0.0002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.527917 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0670  protein of unknown function DUF264  27.15 
 
 		 441 aa  47.4  0.0007  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>