21 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swol_1310 on replicon NC_008346
Organism: Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008346  Swol_1310  hypothetical protein  100 
 
 
522 aa  1081    Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0537638  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0375  hypothetical protein  67.57 
 
 
526 aa  748    Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0776802  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2129  hypothetical protein  67.69 
 
 
527 aa  752    Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1291  hypothetical protein  51.54 
 
 
525 aa  535  1e-151  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0834175  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3729  hypothetical protein  51.73 
 
 
525 aa  533  1e-150  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1245  hypothetical protein  48.76 
 
 
530 aa  489  1e-137  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0027528  normal  0.060022 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2829  hypothetical protein  44.8 
 
 
534 aa  460  9.999999999999999e-129  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4366  hypothetical protein  25.83 
 
 
496 aa  154  4e-36  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.9507  normal  0.531855 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3519  large subunit terminase  26.08 
 
 
568 aa  127  7e-28  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.918493  hitchhiker  0.00317443 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0564  hypothetical protein  23.67 
 
 
477 aa  114  3e-24  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1384  hypothetical protein  24.01 
 
 
477 aa  112  2.0000000000000002e-23  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1003  putative DNA packaging protein GP17 (terminase)  27.76 
 
 
504 aa  86.7  0.000000000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0726  putative terminase large subunit protein  25.68 
 
 
523 aa  79.3  0.0000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.964001  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1699  putative terminase large subunit protein  24.15 
 
 
539 aa  72.8  0.00000000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.140873  normal  0.0380156 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0854  hypothetical protein  33.33 
 
 
229 aa  70.9  0.00000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2353  putative terminase large subunit protein  28.78 
 
 
527 aa  69.7  0.0000000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.158978  unclonable  0.0000000253606 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2187  terminase large subunit  30 
 
 
194 aa  69.3  0.0000000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.479041 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0641  protein of unknown function DUF264  21.05 
 
 
478 aa  51.6  0.00003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0830  protein of unknown function DUF264  21.14 
 
 
503 aa  52  0.00003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1017  protein of unknown function DUF264  20.93 
 
 
478 aa  52  0.00003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010158  YpAngola_0076  hypothetical protein  22.07 
 
 
418 aa  49.7  0.0001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>