22 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dred_2129 on replicon NC_009253
Organism: Desulfotomaculum reducens MI-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008346  Swol_1310  hypothetical protein  67.69 
 
 		 522 aa  752    Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0537638  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0375  hypothetical protein  98.86 
 
 		 526 aa  1073    Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0776802  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2129  hypothetical protein  100 
 
 		 527 aa  1090    Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1291  hypothetical protein  52.45 
 
 		 525 aa  563  1.0000000000000001e-159  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0834175  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3729  hypothetical protein  52.77 
 
 		 525 aa  558  1e-158  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1245  hypothetical protein  49.81 
 
 		 530 aa  520  1e-146  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0027528  normal  0.060022 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2829  hypothetical protein  46.21 
 
 		 534 aa  492  9.999999999999999e-139  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4366  hypothetical protein  27.78 
 
 		 496 aa  177  5e-43  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.9507  normal  0.531855 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1384  hypothetical protein  24.52 
 
 		 477 aa  132  1.0000000000000001e-29  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0564  hypothetical protein  24.47 
 
 		 477 aa  131  3e-29  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3519  large subunit terminase  24.95 
 
 		 568 aa  109  1e-22  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.918493  hitchhiker  0.00317443 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0726  putative terminase large subunit protein  27.8 
 
 		 523 aa  85.5  0.000000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.964001  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2353  putative terminase large subunit protein  26.59 
 
 		 527 aa  74.7  0.000000000003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.158978  unclonable  0.0000000253606 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1003  putative DNA packaging protein GP17 (terminase)  25.96 
 
 		 504 aa  71.6  0.00000000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0854  hypothetical protein  35.44 
 
 		 229 aa  70.5  0.00000000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1699  putative terminase large subunit protein  23.78 
 
 		 539 aa  62  0.00000003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.140873  normal  0.0380156 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2187  terminase large subunit  28.96 
 
 		 194 aa  55.8  0.000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.479041 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0641  protein of unknown function DUF264  20.99 
 
 		 478 aa  52.4  0.00002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1017  protein of unknown function DUF264  21.07 
 
 		 478 aa  50.1  0.0001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0830  protein of unknown function DUF264  20.84 
 
 		 503 aa  48.5  0.0003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010158  YpAngola_0076  hypothetical protein  21.6 
 
 		 418 aa  46.6  0.001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1462  hypothetical protein  22.03 
 
 		 421 aa  43.9  0.008  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>