18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg_0854 on replicon NC_012850
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012850  Rleg_0854  hypothetical protein  100 
 
 
229 aa  478  1e-134  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0726  putative terminase large subunit protein  92.53 
 
 
523 aa  345  2e-94  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.964001  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1003  putative DNA packaging protein GP17 (terminase)  51.55 
 
 
504 aa  174  9.999999999999999e-43  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2187  terminase large subunit  49.03 
 
 
194 aa  159  4e-38  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.479041 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3519  large subunit terminase  45.66 
 
 
568 aa  157  2e-37  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.918493  hitchhiker  0.00317443 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2353  putative terminase large subunit protein  45.86 
 
 
527 aa  150  2e-35  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.158978  unclonable  0.0000000253606 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1699  putative terminase large subunit protein  48.92 
 
 
539 aa  134  9.999999999999999e-31  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.140873  normal  0.0380156 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0386  hypothetical protein  35.91 
 
 
543 aa  116  3.9999999999999997e-25  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  decreased coverage  0.00110205  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0752  hypothetical protein  51.26 
 
 
120 aa  103  2e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.652366  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2403  hypothetical protein  47.58 
 
 
120 aa  83.2  0.000000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1245  hypothetical protein  28.57 
 
 
530 aa  70.5  0.00000000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0027528  normal  0.060022 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2129  hypothetical protein  35.44 
 
 
527 aa  70.5  0.00000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0375  hypothetical protein  35.44 
 
 
526 aa  70.5  0.00000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0776802  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1310  hypothetical protein  33.33 
 
 
522 aa  70.9  0.00000000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0537638  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2829  hypothetical protein  29.38 
 
 
534 aa  62  0.000000007  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4366  hypothetical protein  27.17 
 
 
496 aa  52  0.000009  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.9507  normal  0.531855 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1291  hypothetical protein  30.07 
 
 
525 aa  51.6  0.000009  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0834175  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3729  hypothetical protein  29.58 
 
 
525 aa  50.1  0.00003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>