18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene YpAngola_A2187 on replicon NC_010159
Organism: Yersinia pestis Angola



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010159  YpAngola_A2187  terminase large subunit  100 
 
 		 194 aa  405  1.0000000000000001e-112  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.479041 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1003  putative DNA packaging protein GP17 (terminase)  45.81 
 
 		 504 aa  167  8e-41  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2353  putative terminase large subunit protein  47.57 
 
 		 527 aa  166  2e-40  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.158978  unclonable  0.0000000253606 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0726  putative terminase large subunit protein  46.82 
 
 		 523 aa  166  2e-40  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.964001  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1699  putative terminase large subunit protein  45.45 
 
 		 539 aa  160  8.000000000000001e-39  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.140873  normal  0.0380156 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3519  large subunit terminase  44.1 
 
 		 568 aa  160  1e-38  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.918493  hitchhiker  0.00317443 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0854  hypothetical protein  49.03 
 
 		 229 aa  159  3e-38  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0386  hypothetical protein  35.12 
 
 		 543 aa  115  3e-25  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  decreased coverage  0.00110205  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4366  hypothetical protein  31.02 
 
 		 496 aa  70.1  0.00000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.9507  normal  0.531855 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1310  hypothetical protein  30 
 
 		 522 aa  69.3  0.00000000003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0537638  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1245  hypothetical protein  28.5 
 
 		 530 aa  61.2  0.000000009  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0027528  normal  0.060022 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2829  hypothetical protein  30.05 
 
 		 534 aa  60.5  0.00000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0375  hypothetical protein  28.96 
 
 		 526 aa  56.2  0.0000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0776802  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2129  hypothetical protein  28.96 
 
 		 527 aa  55.8  0.0000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1291  hypothetical protein  25.28 
 
 		 525 aa  52  0.000005  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0834175  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3729  hypothetical protein  25.77 
 
 		 525 aa  52  0.000005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0564  hypothetical protein  26.4 
 
 		 477 aa  47.8  0.0001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1384  hypothetical protein  24.72 
 
 		 477 aa  46.6  0.0002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>