29 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GM21_1003 on replicon NC_012918
Organism: Geobacter sp. M21



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012918  GM21_1003  putative DNA packaging protein GP17 (terminase)  100 
 
 		 504 aa  1051    Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0726  putative terminase large subunit protein  43.83 
 
 		 523 aa  380  1e-104  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.964001  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1699  putative terminase large subunit protein  39.59 
 
 		 539 aa  340  2.9999999999999998e-92  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.140873  normal  0.0380156 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2353  putative terminase large subunit protein  38.28 
 
 		 527 aa  333  3e-90  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.158978  unclonable  0.0000000253606 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0386  hypothetical protein  35.9 
 
 		 543 aa  273  4.0000000000000004e-72  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  decreased coverage  0.00110205  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2189  hypothetical protein  41.29 
 
 		 324 aa  223  8e-57  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.580181 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3519  large subunit terminase  38.41 
 
 		 568 aa  218  2.9999999999999998e-55  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.918493  hitchhiker  0.00317443 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0854  hypothetical protein  51.55 
 
 		 229 aa  173  6.999999999999999e-42  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2187  terminase large subunit  45.81 
 
 		 194 aa  167  4e-40  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.479041 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5696  PBSX family phage terminase large subunit  36.36 
 
 		 440 aa  150  7e-35  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0719  hypothetical protein  37.25 
 
 		 461 aa  142  9.999999999999999e-33  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2354  hypothetical protein  34.68 
 
 		 490 aa  136  7.000000000000001e-31  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1463  Phage terminase, large subunit, PBSX  37.07 
 
 		 417 aa  132  1.0000000000000001e-29  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.8452  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2427  terminase large subunit  27.94 
 
 		 342 aa  91.3  4e-17  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.484378  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1310  hypothetical protein  27.76 
 
 		 522 aa  86.7  9e-16  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0537638  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1245  hypothetical protein  25.74 
 
 		 530 aa  85.1  0.000000000000003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0027528  normal  0.060022 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1942  PBSX family phage terminase large subunit  28.64 
 
 		 433 aa  82  0.00000000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.16151  hitchhiker  0.000128888 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0227  PBSX family phage terminase large subunit  28.16 
 
 		 402 aa  79.7  0.0000000000001  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1143  phage terminase, large subunit, PBSX family  26.87 
 
 		 424 aa  77.8  0.0000000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4366  hypothetical protein  29.38 
 
 		 496 aa  75.9  0.000000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.9507  normal  0.531855 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2829  hypothetical protein  25.43 
 
 		 534 aa  75.5  0.000000000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1291  hypothetical protein  26.56 
 
 		 525 aa  75.9  0.000000000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0834175  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3729  hypothetical protein  26.48 
 
 		 525 aa  74.7  0.000000000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0375  hypothetical protein  24.92 
 
 		 526 aa  71.6  0.00000000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0776802  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2129  hypothetical protein  25.96 
 
 		 527 aa  71.6  0.00000000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5804  putative phage terminase large subunit  27.07 
 
 		 428 aa  68.2  0.0000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3056  phage terminase, large subunit, PBSX family  25.85 
 
 		 421 aa  66.2  0.000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.345936  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1384  hypothetical protein  26.16 
 
 		 477 aa  51.2  0.00004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0564  hypothetical protein  25.38 
 
 		 477 aa  47  0.0008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>