22 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amuc_0386 on replicon NC_010655
Organism: Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010655  Amuc_0386  hypothetical protein  100 
 
 		 543 aa  1120    Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  decreased coverage  0.00110205  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1003  putative DNA packaging protein GP17 (terminase)  36.47 
 
 		 504 aa  290  4e-77  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2353  putative terminase large subunit protein  35.26 
 
 		 527 aa  233  8.000000000000001e-60  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.158978  unclonable  0.0000000253606 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0726  putative terminase large subunit protein  30.42 
 
 		 523 aa  229  9e-59  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.964001  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1699  putative terminase large subunit protein  34.27 
 
 		 539 aa  224  3e-57  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.140873  normal  0.0380156 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3519  large subunit terminase  35.18 
 
 		 568 aa  167  4e-40  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.918493  hitchhiker  0.00317443 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2189  hypothetical protein  33.33 
 
 		 324 aa  150  6e-35  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.580181 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2187  terminase large subunit  35.12 
 
 		 194 aa  115  2.0000000000000002e-24  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.479041 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0854  hypothetical protein  35.91 
 
 		 229 aa  115  2.0000000000000002e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1463  Phage terminase, large subunit, PBSX  34.33 
 
 		 417 aa  97.1  7e-19  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.8452  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5696  PBSX family phage terminase large subunit  32.51 
 
 		 440 aa  87.4  6e-16  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2354  hypothetical protein  30.21 
 
 		 490 aa  85.5  0.000000000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0719  hypothetical protein  29.11 
 
 		 461 aa  70.1  0.00000000009  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1245  hypothetical protein  27.1 
 
 		 530 aa  63.2  0.00000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0027528  normal  0.060022 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5804  putative phage terminase large subunit  30.05 
 
 		 428 aa  61.2  0.00000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2427  terminase large subunit  36.17 
 
 		 342 aa  60.8  0.00000005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.484378  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4366  hypothetical protein  26.53 
 
 		 496 aa  60.1  0.00000009  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.9507  normal  0.531855 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1942  PBSX family phage terminase large subunit  29.27 
 
 		 433 aa  56.2  0.000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.16151  hitchhiker  0.000128888 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3056  phage terminase, large subunit, PBSX family  30.92 
 
 		 421 aa  55.1  0.000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.345936  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0227  PBSX family phage terminase large subunit  23.85 
 
 		 402 aa  54.3  0.000005  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0375  hypothetical protein  23.34 
 
 		 526 aa  49.3  0.0002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0776802  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2129  hypothetical protein  22.91 
 
 		 527 aa  48.5  0.0003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>