107 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrad2831_4915 on replicon NC_010505
Organism: Methylobacterium radiotolerans JCM 2831



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010505  Mrad2831_4915  hypothetical protein  100 
 
 		 370 aa  721    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0400128 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1186  protein of unknown function DUF305  66.76 
 
 		 407 aa  402  1e-111  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.220752  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1820  hypothetical protein  67.59 
 
 		 415 aa  382  1e-105  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.241651 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2580  protein of unknown function DUF305  40.27 
 
 		 224 aa  92.8  7e-18  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1394  hypothetical protein  36.67 
 
 		 212 aa  88.2  2e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.182892 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2059  protein of unknown function DUF305  32.43 
 
 		 208 aa  77  0.0000000000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.243739  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0057  hypothetical protein  32.39 
 
 		 208 aa  75.5  0.000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0357  protein of unknown function DUF305  33.99 
 
 		 208 aa  75.1  0.000000000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0132  protein of unknown function DUF305  33.77 
 
 		 192 aa  73.6  0.000000000005  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.857037  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2579  hypothetical protein  33.33 
 
 		 202 aa  72.8  0.000000000008  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0590  hypothetical protein  33.13 
 
 		 208 aa  71.2  0.00000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3655  hypothetical protein  24.84 
 
 		 221 aa  70.9  0.00000000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4189  hypothetical protein  29.66 
 
 		 195 aa  70.9  0.00000000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.314897  normal  0.043987 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4037  hypothetical protein  24.84 
 
 		 222 aa  70.1  0.00000000006  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0675936  hitchhiker  0.00542387 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0174  hypothetical protein  29.45 
 
 		 205 aa  69.7  0.00000000008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011881  Achl_4525  protein of unknown function DUF305  28.82 
 
 		 280 aa  69.3  0.0000000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.137283 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3538  protein of unknown function DUF305  33.11 
 
 		 205 aa  68.9  0.0000000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.396776 
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4455  hypothetical protein  27.62 
 
 		 229 aa  68.6  0.0000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.248989  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1237  hypothetical protein  28.48 
 
 		 239 aa  68.2  0.0000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.584901  normal  0.0371958 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1610  hypothetical protein  26.97 
 
 		 219 aa  67.4  0.0000000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.506361  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4415  protein of unknown function DUF305  31.94 
 
 		 202 aa  67.4  0.0000000004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.126861  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0137  hypothetical protein  33.1 
 
 		 202 aa  66.2  0.0000000008  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0732771 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0147  hypothetical protein  33.1 
 
 		 202 aa  66.2  0.0000000009  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.404622  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0156  hypothetical protein  33.1 
 
 		 202 aa  66.2  0.0000000009  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.908882  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4859  hypothetical protein  31.72 
 
 		 179 aa  66.2  0.0000000009  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.465099  normal  0.0782365 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2214  protein of unknown function DUF305  31.33 
 
 		 207 aa  65.5  0.000000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.702552  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2457  hypothetical protein  29.66 
 
 		 179 aa  65.1  0.000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.10169  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1313  hypothetical protein  27.78 
 
 		 211 aa  64.3  0.000000003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3396  protein of unknown function DUF305  30.36 
 
 		 237 aa  64.3  0.000000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.886047  normal  0.773197 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0639  putative secreted protein  27.95 
 
 		 191 aa  63.5  0.000000005  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6146  putative secreted protein  35.14 
 
 		 207 aa  63.9  0.000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.666575  normal  0.0345137 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4157  protein of unknown function DUF305  28.12 
 
 		 217 aa  63.9  0.000000005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.427773  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0736  hypothetical protein  26.49 
 
 		 270 aa  62.4  0.00000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0460895  hitchhiker  0.00701181 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0485  hypothetical protein  26.35 
 
 		 207 aa  62  0.00000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.08806 
 
 
-
 
NC_009806  Krad_4586  hypothetical protein  24.84 
 
 		 265 aa  62  0.00000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3044  protein of unknown function DUF305  33.33 
 
 		 230 aa  62  0.00000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.22024  normal  0.753211 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1150  hypothetical protein  30.32 
 
 		 218 aa  60.8  0.00000003  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2368  hypothetical protein  31.91 
 
 		 188 aa  60.8  0.00000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.838223  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2111  hypothetical protein  29.87 
 
 		 223 aa  60.8  0.00000004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.0727975 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5740  hypothetical protein  27.04 
 
 		 199 aa  60.8  0.00000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2129  protein of unknown function DUF305  26.67 
 
 		 223 aa  60.8  0.00000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000673647  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0200  protein of unknown function DUF305  28.4 
 
 		 243 aa  60.8  0.00000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0706  hypothetical protein  32.61 
 
 		 203 aa  60.5  0.00000004  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3672  protein of unknown function DUF305  30.41 
 
 		 210 aa  60.8  0.00000004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1047  protein of unknown function DUF305  29.45 
 
 		 210 aa  60.1  0.00000006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.109327 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0047  hypothetical protein  28.19 
 
 		 232 aa  59.7  0.00000009  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2558  hypothetical protein  25.95 
 
 		 217 aa  59.3  0.00000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.503516  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2280  hypothetical protein  27.27 
 
 		 226 aa  58.9  0.0000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0121  hypothetical protein  29.25 
 
 		 211 aa  58.5  0.0000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.261528  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1473  hypothetical protein  27.33 
 
 		 253 aa  58.2  0.0000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.49823  normal  0.238367 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2254  hypothetical protein  27.32 
 
 		 223 aa  57.8  0.0000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0831973 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1404  protein of unknown function DUF305  28.49 
 
 		 231 aa  56.6  0.0000007  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  decreased coverage  0.00923301  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0139  protein of unknown function DUF305  29.07 
 
 		 237 aa  56.2  0.0000009  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0305  hypothetical protein  31.54 
 
 		 192 aa  56.2  0.0000009  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0086  hypothetical protein  29.29 
 
 		 197 aa  56.2  0.000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5683  hypothetical protein  28.26 
 
 		 197 aa  55.8  0.000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.389225 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5327  hypothetical protein  28.26 
 
 		 197 aa  55.8  0.000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4487  hypothetical protein  27.21 
 
 		 209 aa  55.1  0.000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.161376  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3980  hypothetical protein  28 
 
 		 207 aa  55.5  0.000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1130  protein of unknown function DUF305  24.69 
 
 		 214 aa  54.3  0.000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0486316 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2783  hypothetical protein  30.56 
 
 		 202 aa  54.7  0.000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4123  hypothetical protein  29.86 
 
 		 198 aa  53.5  0.000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0885  protein of unknown function DUF305  30.77 
 
 		 203 aa  53.1  0.000007  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.309526 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_30000  hypothetical protein  26.38 
 
 		 264 aa  53.1  0.000007  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0111824  normal  0.273693 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3974  hypothetical protein  25.13 
 
 		 271 aa  53.1  0.000008  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013732  Slin_6903  protein of unknown function DUF305  25.83 
 
 		 194 aa  53.1  0.000008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.912049  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0285  hypothetical protein  28.29 
 
 		 279 aa  52.8  0.00001  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0312  hypothetical protein  27.7 
 
 		 250 aa  52.8  0.00001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.153905  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1836  hypothetical protein  27.27 
 
 		 246 aa  52.4  0.00001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0521181  normal  0.479841 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4747  hypothetical protein  27.4 
 
 		 199 aa  52.4  0.00001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.244044  normal  0.551165 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4389  hypothetical protein  26.9 
 
 		 185 aa  52  0.00002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.844774 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2090  protein of unknown function DUF305  25 
 
 		 248 aa  50.4  0.00004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0249102  normal  0.0354487 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1143  protein of unknown function DUF305  23.94 
 
 		 200 aa  50.4  0.00005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2245  hypothetical protein  27.36 
 
 		 220 aa  50.1  0.00006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.19318  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5333  protein of unknown function DUF305  25.5 
 
 		 206 aa  50.1  0.00006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.628713  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1810  protein of unknown function DUF305  26.35 
 
 		 257 aa  50.1  0.00006  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.117773  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6160  protein of unknown function DUF305  26.01 
 
 		 253 aa  49.3  0.0001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0315  hypothetical protein  27.15 
 
 		 213 aa  48.1  0.0002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4447  hypothetical protein  31.82 
 
 		 213 aa  48.5  0.0002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.708243  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1517  hypothetical protein  25.35 
 
 		 263 aa  48.5  0.0002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0547298  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3691  hypothetical protein  27.72 
 
 		 197 aa  47.8  0.0003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4526  hypothetical protein  30.06 
 
 		 189 aa  47.8  0.0003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.410166  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2299  hypothetical protein  33.66 
 
 		 131 aa  47  0.0006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.502645  normal  0.300694 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4397  hypothetical protein  28.33 
 
 		 226 aa  46.6  0.0006  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.801052  normal  0.828991 
 
 
-
 
NC_013731  Slin_6656  protein of unknown function DUF305  23.84 
 
 		 197 aa  47  0.0006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.817107 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2567  hypothetical protein  29.29 
 
 		 206 aa  46.6  0.0007  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6259  hypothetical protein  36.84 
 
 		 164 aa  46.6  0.0007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.510981 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4933  protein of unknown function DUF305  43.55 
 
 		 158 aa  46.6  0.0007  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.913389  normal  0.245188 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3856  protein of unknown function DUF305  43.55 
 
 		 158 aa  46.6  0.0007  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.422416  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5806  hypothetical protein  40.38 
 
 		 122 aa  46.6  0.0008  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5858  hypothetical protein  25.29 
 
 		 218 aa  45.4  0.002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0261  hypothetical protein  48.08 
 
 		 127 aa  45.1  0.002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.188703  normal  0.0101728 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2666  hypothetical protein  48.08 
 
 		 127 aa  45.1  0.002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.499995 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3506  protein of unknown function DUF305  25 
 
 		 235 aa  45.4  0.002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.974087  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6564  hypothetical protein  51.02 
 
 		 130 aa  44.3  0.003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0815  hypothetical protein  21.68 
 
 		 207 aa  44.3  0.003  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1508  hypothetical protein  21.88 
 
 		 217 aa  43.9  0.004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  decreased coverage  0.0000100839  normal  0.123657 
 
 
-
 
NC_008758  Pnap_4562  hypothetical protein  43.4 
 
 		 91 aa  44.3  0.004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009806  Krad_4575  hypothetical protein  23.18 
 
 		 300 aa  43.9  0.004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4268  protein of unknown function DUF305  33.06 
 
 		 227 aa  43.9  0.004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.342211  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>