131 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tbd_1313 on replicon NC_007404
Organism: Thiobacillus denitrificans ATCC 25259



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007404  Tbd_1313  hypothetical protein  100 
 
 		 211 aa  434  1e-121  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4389  hypothetical protein  39.63 
 
 		 185 aa  132  5e-30  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.844774 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1473  hypothetical protein  41.71 
 
 		 253 aa  129  3e-29  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.49823  normal  0.238367 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2580  protein of unknown function DUF305  35.06 
 
 		 224 aa  102  5e-21  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4123  hypothetical protein  35.62 
 
 		 198 aa  95.9  4e-19  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1047  protein of unknown function DUF305  31.13 
 
 		 210 aa  87.8  1e-16  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.109327 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0121  hypothetical protein  33.8 
 
 		 211 aa  86.3  3e-16  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.261528  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0305  hypothetical protein  31.02 
 
 		 192 aa  86.7  3e-16  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2783  hypothetical protein  33.79 
 
 		 202 aa  84.3  0.000000000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0132  protein of unknown function DUF305  34.34 
 
 		 192 aa  83.6  0.000000000000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.857037  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2280  hypothetical protein  31.14 
 
 		 226 aa  83.2  0.000000000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1150  hypothetical protein  31.85 
 
 		 218 aa  81.6  0.000000000000007  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6146  putative secreted protein  30.67 
 
 		 207 aa  79.3  0.00000000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.666575  normal  0.0345137 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2213  hypothetical protein  32.64 
 
 		 241 aa  77.8  0.0000000000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3538  protein of unknown function DUF305  33.56 
 
 		 205 aa  77.4  0.0000000000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.396776 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2368  hypothetical protein  30.71 
 
 		 188 aa  75.5  0.0000000000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.838223  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3672  protein of unknown function DUF305  30.41 
 
 		 210 aa  75.5  0.0000000000006  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0357  protein of unknown function DUF305  33.12 
 
 		 208 aa  75.1  0.0000000000007  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0057  hypothetical protein  33.75 
 
 		 208 aa  74.7  0.0000000000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2558  hypothetical protein  28.34 
 
 		 217 aa  74.3  0.000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.503516  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1394  hypothetical protein  31.72 
 
 		 212 aa  73.2  0.000000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.182892 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2579  hypothetical protein  31.68 
 
 		 202 aa  72.8  0.000000000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4487  hypothetical protein  31.91 
 
 		 209 aa  71.6  0.000000000008  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.161376  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0174  hypothetical protein  29.01 
 
 		 205 aa  70.5  0.00000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5740  hypothetical protein  30.43 
 
 		 199 aa  70.1  0.00000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2836  hypothetical protein  28.24 
 
 		 215 aa  69.7  0.00000000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.196211 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1610  hypothetical protein  26.8 
 
 		 219 aa  69.3  0.00000000004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.506361  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4157  protein of unknown function DUF305  27.78 
 
 		 217 aa  68.9  0.00000000005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.427773  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0139  protein of unknown function DUF305  27.27 
 
 		 237 aa  68.9  0.00000000005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4189  hypothetical protein  29.81 
 
 		 195 aa  68.9  0.00000000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.314897  normal  0.043987 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3889  hypothetical protein  28.82 
 
 		 227 aa  68.6  0.00000000007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.154198  normal  0.229372 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1143  protein of unknown function DUF305  30.94 
 
 		 200 aa  68.2  0.00000000009  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0147  hypothetical protein  30.87 
 
 		 202 aa  67.8  0.0000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.404622  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2129  protein of unknown function DUF305  27.65 
 
 		 223 aa  67.4  0.0000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000673647  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0156  hypothetical protein  30.87 
 
 		 202 aa  67.8  0.0000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.908882  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0706  hypothetical protein  30.87 
 
 		 203 aa  66.2  0.0000000003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0086  hypothetical protein  27.08 
 
 		 197 aa  66.2  0.0000000004  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0137  hypothetical protein  30.2 
 
 		 202 aa  65.9  0.0000000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0732771 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4415  protein of unknown function DUF305  30.56 
 
 		 202 aa  65.9  0.0000000005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.126861  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4008  hypothetical protein  26.09 
 
 		 197 aa  65.5  0.0000000006  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4568  hypothetical protein  27.81 
 
 		 231 aa  65.5  0.0000000006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3032  protein of unknown function DUF305  28.66 
 
 		 206 aa  65.5  0.0000000006  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.709279 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0885  protein of unknown function DUF305  31.37 
 
 		 203 aa  65.5  0.0000000006  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.309526 
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4461  hypothetical protein  31.47 
 
 		 213 aa  64.7  0.000000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008538  Arth_4292  hypothetical protein  31.47 
 
 		 213 aa  64.7  0.000000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008539  Arth_4192  hypothetical protein  31.47 
 
 		 213 aa  64.7  0.000000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009806  Krad_4586  hypothetical protein  24.86 
 
 		 265 aa  63.5  0.000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1237  hypothetical protein  27.81 
 
 		 239 aa  63.2  0.000000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.584901  normal  0.0371958 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0315  hypothetical protein  29.21 
 
 		 213 aa  62.4  0.000000004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3980  hypothetical protein  28.38 
 
 		 207 aa  62.4  0.000000005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5858  hypothetical protein  27.59 
 
 		 218 aa  62  0.000000006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3396  protein of unknown function DUF305  24.73 
 
 		 237 aa  62  0.000000006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.886047  normal  0.773197 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5736  hypothetical protein  26.19 
 
 		 227 aa  61.6  0.000000008  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1517  hypothetical protein  26.53 
 
 		 263 aa  61.6  0.000000008  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0547298  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4037  hypothetical protein  25.32 
 
 		 222 aa  61.6  0.000000009  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0675936  hitchhiker  0.00542387 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2254  hypothetical protein  28.92 
 
 		 223 aa  60.8  0.00000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0831973 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1836  hypothetical protein  26.35 
 
 		 246 aa  60.5  0.00000002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0521181  normal  0.479841 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4526  hypothetical protein  29.3 
 
 		 189 aa  60.5  0.00000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.410166  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2111  hypothetical protein  28.67 
 
 		 223 aa  60.8  0.00000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.0727975 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2059  protein of unknown function DUF305  28.99 
 
 		 208 aa  60.1  0.00000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.243739  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0891  hypothetical protein  28.07 
 
 		 229 aa  60.1  0.00000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0590  hypothetical protein  27.49 
 
 		 208 aa  59.3  0.00000004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2533  hypothetical protein  27.92 
 
 		 193 aa  59.7  0.00000004  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.0056757  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1437  hypothetical protein  24.86 
 
 		 228 aa  59.3  0.00000005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.115856  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1455  hypothetical protein  24.86 
 
 		 228 aa  59.3  0.00000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.502246 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2595  protein of unknown function DUF305  26.9 
 
 		 217 aa  58.9  0.00000005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.974704  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0485  hypothetical protein  22.09 
 
 		 207 aa  58.9  0.00000006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.08806 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4244  protein of unknown function DUF305  26.58 
 
 		 217 aa  57.8  0.0000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.827618  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5320  hypothetical protein  26.88 
 
 		 225 aa  57.8  0.0000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0815  hypothetical protein  26.35 
 
 		 207 aa  57.8  0.0000001  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5409  hypothetical protein  26.88 
 
 		 225 aa  57.8  0.0000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.180608  normal  0.175735 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3655  hypothetical protein  23.87 
 
 		 221 aa  57.8  0.0000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5699  hypothetical protein  26.88 
 
 		 227 aa  57.4  0.0000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1130  protein of unknown function DUF305  26.49 
 
 		 214 aa  57.4  0.0000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0486316 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_30000  hypothetical protein  22.47 
 
 		 264 aa  56.6  0.0000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0111824  normal  0.273693 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0639  putative secreted protein  24.07 
 
 		 191 aa  54.7  0.000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_18400  hypothetical protein  28.05 
 
 		 227 aa  54.3  0.000001  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5333  protein of unknown function DUF305  22.98 
 
 		 206 aa  54.7  0.000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.628713  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0869  protein of unknown function DUF305  27.91 
 
 		 233 aa  54.7  0.000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.296281  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2567  hypothetical protein  29.86 
 
 		 206 aa  52.8  0.000004  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3868  hypothetical protein  41.82 
 
 		 134 aa  52.8  0.000004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1097  protein of unknown function DUF305  23.72 
 
 		 223 aa  52.4  0.000004  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000215144  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_04960  hypothetical protein  29.24 
 
 		 232 aa  52.8  0.000004  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3044  protein of unknown function DUF305  28.19 
 
 		 230 aa  52.4  0.000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.22024  normal  0.753211 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4915  hypothetical protein  27.78 
 
 		 370 aa  51.6  0.000008  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0400128 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0047  hypothetical protein  26.44 
 
 		 232 aa  51.2  0.00001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2245  hypothetical protein  27.7 
 
 		 220 aa  50.8  0.00001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.19318  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3242  hypothetical protein  43.14 
 
 		 134 aa  51.2  0.00001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0285  hypothetical protein  22.94 
 
 		 279 aa  50.1  0.00002  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0461  protein of unknown function DUF305  37.7 
 
 		 119 aa  50.4  0.00002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.607138  normal  1 
 
 
-
 
NC_013731  Slin_6657  protein of unknown function DUF305  26.71 
 
 		 209 aa  50.8  0.00002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.50824 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4747  hypothetical protein  25 
 
 		 199 aa  50.4  0.00002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.244044  normal  0.551165 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5806  hypothetical protein  38.89 
 
 		 122 aa  50.4  0.00002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1571  conserved hypothetical protein (DUF305 domain protein)  24.32 
 
 		 206 aa  50.4  0.00002  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3895  hypothetical protein  39.62 
 
 		 134 aa  50.1  0.00003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4455  hypothetical protein  25.89 
 
 		 229 aa  49.3  0.00004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.248989  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3676  hypothetical protein  23.5 
 
 		 243 aa  49.3  0.00004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0963625  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1810  protein of unknown function DUF305  22.58 
 
 		 257 aa  48.9  0.00005  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.117773  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4447  hypothetical protein  25.66 
 
 		 213 aa  48.9  0.00006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.708243  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0401  hypothetical protein  39.62 
 
 		 126 aa  48.9  0.00006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0681518 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>