189 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbro_2595 on replicon NC_013441
Organism: Gordonia bronchialis DSM 43247



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013441  Gbro_2595  protein of unknown function DUF305  100 
 
 
217 aa  437  9.999999999999999e-123  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.974704  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4244  protein of unknown function DUF305  98.16 
 
 
217 aa  429  1e-119  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.827618  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1437  hypothetical protein  48.46 
 
 
228 aa  185  4e-46  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.115856  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1455  hypothetical protein  48.46 
 
 
228 aa  185  4e-46  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.502246 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3676  hypothetical protein  48.35 
 
 
243 aa  184  6e-46  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0963625  normal 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5698  hypothetical protein  49.15 
 
 
237 aa  180  2e-44  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.472111  normal  0.587955 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5311  hypothetical protein  49.15 
 
 
237 aa  180  2e-44  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.126804  normal  0.734032 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3980  hypothetical protein  48.78 
 
 
207 aa  177  1e-43  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2245  hypothetical protein  44.64 
 
 
220 aa  177  1e-43  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.19318  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5320  hypothetical protein  43.81 
 
 
225 aa  171  9e-42  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5409  hypothetical protein  43.81 
 
 
225 aa  171  9e-42  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.180608  normal  0.175735 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4447  hypothetical protein  43.44 
 
 
213 aa  171  1e-41  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.708243  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5699  hypothetical protein  44.69 
 
 
227 aa  170  2e-41  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0891  hypothetical protein  47.39 
 
 
229 aa  169  2e-41  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3889  hypothetical protein  48.66 
 
 
227 aa  169  3e-41  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.154198  normal  0.229372 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4526  hypothetical protein  50.25 
 
 
189 aa  166  2.9999999999999998e-40  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.410166  normal 
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4461  hypothetical protein  52.15 
 
 
213 aa  163  2.0000000000000002e-39  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008538  Arth_4292  hypothetical protein  52.15 
 
 
213 aa  163  2.0000000000000002e-39  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008539  Arth_4192  hypothetical protein  52.15 
 
 
213 aa  163  2.0000000000000002e-39  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_18400  hypothetical protein  50.58 
 
 
227 aa  162  3e-39  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2836  hypothetical protein  53.67 
 
 
215 aa  162  4.0000000000000004e-39  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.196211 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5736  hypothetical protein  43.28 
 
 
227 aa  162  5.0000000000000005e-39  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4568  hypothetical protein  44.17 
 
 
231 aa  161  6e-39  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5858  hypothetical protein  50 
 
 
218 aa  160  1e-38  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0885  protein of unknown function DUF305  46.01 
 
 
203 aa  157  9e-38  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.309526 
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4487  hypothetical protein  49.7 
 
 
209 aa  155  4e-37  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.161376  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3032  protein of unknown function DUF305  49.4 
 
 
206 aa  152  2.9999999999999998e-36  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.709279 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_04960  hypothetical protein  47.43 
 
 
232 aa  151  5.9999999999999996e-36  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0057  hypothetical protein  41.35 
 
 
208 aa  139  1.9999999999999998e-32  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009806  Krad_4586  hypothetical protein  45.56 
 
 
265 aa  140  1.9999999999999998e-32  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5740  hypothetical protein  43.55 
 
 
199 aa  136  2e-31  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0139  protein of unknown function DUF305  46.24 
 
 
237 aa  134  7.000000000000001e-31  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0315  hypothetical protein  39.17 
 
 
213 aa  134  9.999999999999999e-31  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2214  protein of unknown function DUF305  44.51 
 
 
207 aa  133  1.9999999999999998e-30  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.702552  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2579  hypothetical protein  42.78 
 
 
202 aa  131  1.0000000000000001e-29  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5683  hypothetical protein  36.92 
 
 
197 aa  125  7e-28  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.389225 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5327  hypothetical protein  36.92 
 
 
197 aa  125  7e-28  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4415  protein of unknown function DUF305  43.75 
 
 
202 aa  124  9e-28  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.126861  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2111  hypothetical protein  38.37 
 
 
223 aa  123  2e-27  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.0727975 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1610  hypothetical protein  39.9 
 
 
219 aa  122  5e-27  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.506361  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0357  protein of unknown function DUF305  42.05 
 
 
208 aa  120  9.999999999999999e-27  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4189  hypothetical protein  40.36 
 
 
195 aa  117  1.9999999999999998e-25  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.314897  normal  0.043987 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3538  protein of unknown function DUF305  43.9 
 
 
205 aa  117  1.9999999999999998e-25  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.396776 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3691  hypothetical protein  37.38 
 
 
197 aa  116  3e-25  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0147  hypothetical protein  37.08 
 
 
202 aa  115  3.9999999999999997e-25  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.404622  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0590  hypothetical protein  44.17 
 
 
208 aa  115  3.9999999999999997e-25  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3672  protein of unknown function DUF305  40.31 
 
 
210 aa  115  3.9999999999999997e-25  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0156  hypothetical protein  37.08 
 
 
202 aa  115  3.9999999999999997e-25  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.908882  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0137  hypothetical protein  37.08 
 
 
202 aa  115  5e-25  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.0732771 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0174  hypothetical protein  41.1 
 
 
205 aa  115  6e-25  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2254  hypothetical protein  38.01 
 
 
223 aa  111  1.0000000000000001e-23  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0831973 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4008  hypothetical protein  36.6 
 
 
197 aa  110  2.0000000000000002e-23  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4268  protein of unknown function DUF305  42.07 
 
 
227 aa  105  4e-22  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.342211  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6146  putative secreted protein  31.11 
 
 
207 aa  104  1e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.666575  normal  0.0345137 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0047  hypothetical protein  34.24 
 
 
232 aa  100  2e-20  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3396  protein of unknown function DUF305  31.05 
 
 
237 aa  99.8  3e-20  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.886047  normal  0.773197 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1394  hypothetical protein  37.11 
 
 
212 aa  98.2  8e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.182892 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1404  protein of unknown function DUF305  35.09 
 
 
231 aa  94.7  1e-18  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  decreased coverage  0.00923301  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0639  putative secreted protein  36.59 
 
 
191 aa  93.6  2e-18  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4455  hypothetical protein  33.33 
 
 
229 aa  90.5  2e-17  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.248989  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2059  protein of unknown function DUF305  33.97 
 
 
208 aa  90.5  2e-17  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.243739  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0485  hypothetical protein  30.92 
 
 
207 aa  87.4  1e-16  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.08806 
 
 
-
 
NC_011881  Achl_4525  protein of unknown function DUF305  33.86 
 
 
280 aa  87  2e-16  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.137283 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2814  hypothetical protein  29 
 
 
188 aa  83.2  0.000000000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5666  hypothetical protein  28.86 
 
 
188 aa  82.8  0.000000000000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5345  hypothetical protein  28.86 
 
 
188 aa  82.8  0.000000000000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1810  protein of unknown function DUF305  30.77 
 
 
257 aa  82.4  0.000000000000004  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.117773  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4123  hypothetical protein  29.9 
 
 
198 aa  82.4  0.000000000000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3506  protein of unknown function DUF305  33.84 
 
 
235 aa  82  0.000000000000006  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.974087  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2129  protein of unknown function DUF305  32.52 
 
 
223 aa  81.6  0.000000000000007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000673647  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3708  hypothetical protein  30.22 
 
 
212 aa  81.6  0.000000000000008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.531089  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1897  protein of unknown function DUF305  31.82 
 
 
270 aa  80.9  0.00000000000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.79954  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_30000  hypothetical protein  30.73 
 
 
264 aa  79.7  0.00000000000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0111824  normal  0.273693 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4037  hypothetical protein  33.33 
 
 
222 aa  79.7  0.00000000000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0675936  hitchhiker  0.00542387 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0736  hypothetical protein  32.45 
 
 
270 aa  79.3  0.00000000000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0460895  hitchhiker  0.00701181 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1836  hypothetical protein  30.77 
 
 
246 aa  79  0.00000000000005  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0521181  normal  0.479841 
 
 
-
 
NC_009806  Krad_4575  hypothetical protein  34.38 
 
 
300 aa  78.6  0.00000000000007  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1517  hypothetical protein  33.95 
 
 
263 aa  78.2  0.00000000000008  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0547298  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1237  hypothetical protein  33.14 
 
 
239 aa  78.2  0.00000000000009  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.584901  normal  0.0371958 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2457  hypothetical protein  27.89 
 
 
179 aa  78.2  0.00000000000009  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.10169  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2090  protein of unknown function DUF305  26.02 
 
 
248 aa  77  0.0000000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0249102  normal  0.0354487 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4157  protein of unknown function DUF305  30.99 
 
 
217 aa  76.6  0.0000000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.427773  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2580  protein of unknown function DUF305  33.95 
 
 
224 aa  76.3  0.0000000000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4859  hypothetical protein  27.89 
 
 
179 aa  75.9  0.0000000000005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.465099  normal  0.0782365 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3974  hypothetical protein  31.82 
 
 
271 aa  74.3  0.000000000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4747  hypothetical protein  31.76 
 
 
199 aa  73.9  0.000000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.244044  normal  0.551165 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2368  hypothetical protein  31.68 
 
 
188 aa  72.8  0.000000000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.838223  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0121  hypothetical protein  28.05 
 
 
211 aa  72.4  0.000000000005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.261528  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_10390  hypothetical protein  26.22 
 
 
356 aa  72  0.000000000006  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.206223  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3655  hypothetical protein  32.72 
 
 
221 aa  72  0.000000000006  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6160  protein of unknown function DUF305  29.19 
 
 
253 aa  71.6  0.000000000008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0869  protein of unknown function DUF305  28.76 
 
 
233 aa  71.2  0.00000000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.296281  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2558  hypothetical protein  29.46 
 
 
217 aa  70.9  0.00000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.503516  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1810  protein of unknown function DUF305  30.86 
 
 
239 aa  69.3  0.00000000004  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2783  hypothetical protein  32.91 
 
 
202 aa  68.9  0.00000000005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1047  protein of unknown function DUF305  31.9 
 
 
210 aa  68.6  0.00000000007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.109327 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1150  hypothetical protein  31.1 
 
 
218 aa  67.4  0.0000000001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0200  protein of unknown function DUF305  34.76 
 
 
243 aa  67  0.0000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0285  hypothetical protein  28.65 
 
 
279 aa  65.1  0.0000000007  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5333  protein of unknown function DUF305  27.06 
 
 
206 aa  64.3  0.000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.628713  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>