159 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Strop_2111 on replicon NC_009380
Organism: Salinispora tropica CNB-440



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009380  Strop_2111  hypothetical protein  100 
 
 
223 aa  442  1e-123  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.0727975 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2254  hypothetical protein  79.37 
 
 
223 aa  315  2e-85  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0831973 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1394  hypothetical protein  43.43 
 
 
212 aa  134  8e-31  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.182892 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3396  protein of unknown function DUF305  39.41 
 
 
237 aa  132  3e-30  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.886047  normal  0.773197 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2059  protein of unknown function DUF305  41.81 
 
 
208 aa  128  6e-29  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.243739  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5740  hypothetical protein  43.71 
 
 
199 aa  125  5e-28  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0357  protein of unknown function DUF305  47.06 
 
 
208 aa  124  1e-27  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6146  putative secreted protein  37.33 
 
 
207 aa  121  7e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.666575  normal  0.0345137 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0057  hypothetical protein  40.26 
 
 
208 aa  120  1.9999999999999998e-26  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2579  hypothetical protein  42.95 
 
 
202 aa  119  3e-26  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0047  hypothetical protein  37.56 
 
 
232 aa  119  3e-26  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3980  hypothetical protein  37.63 
 
 
207 aa  119  4.9999999999999996e-26  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4189  hypothetical protein  41.22 
 
 
195 aa  118  6e-26  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.314897  normal  0.043987 
 
 
-
 
NC_009806  Krad_4586  hypothetical protein  35.39 
 
 
265 aa  116  3e-25  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3032  protein of unknown function DUF305  38.51 
 
 
206 aa  114  1.0000000000000001e-24  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.709279 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_18400  hypothetical protein  40.13 
 
 
227 aa  113  3e-24  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2595  protein of unknown function DUF305  37.21 
 
 
217 aa  112  6e-24  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.974704  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3672  protein of unknown function DUF305  40.13 
 
 
210 aa  107  1e-22  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2214  protein of unknown function DUF305  39.07 
 
 
207 aa  107  1e-22  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.702552  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3538  protein of unknown function DUF305  42.14 
 
 
205 aa  105  7e-22  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.396776 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4415  protein of unknown function DUF305  39.22 
 
 
202 aa  105  7e-22  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.126861  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0139  protein of unknown function DUF305  34.97 
 
 
237 aa  104  1e-21  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_04960  hypothetical protein  37.79 
 
 
232 aa  103  3e-21  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4244  protein of unknown function DUF305  35.85 
 
 
217 aa  100  2e-20  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.827618  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5858  hypothetical protein  32.2 
 
 
218 aa  100  2e-20  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4487  hypothetical protein  38.93 
 
 
209 aa  99.4  4e-20  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.161376  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0315  hypothetical protein  38.22 
 
 
213 aa  97.8  1e-19  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0885  protein of unknown function DUF305  39.74 
 
 
203 aa  97.4  1e-19  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.309526 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1610  hypothetical protein  32.6 
 
 
219 aa  96.3  3e-19  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.506361  normal 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5683  hypothetical protein  38.1 
 
 
197 aa  95.9  4e-19  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.389225 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5327  hypothetical protein  38.1 
 
 
197 aa  95.9  4e-19  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4461  hypothetical protein  36.67 
 
 
213 aa  95.1  7e-19  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008538  Arth_4292  hypothetical protein  36.67 
 
 
213 aa  95.1  7e-19  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008539  Arth_4192  hypothetical protein  36.67 
 
 
213 aa  95.1  7e-19  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0147  hypothetical protein  36.42 
 
 
202 aa  94.4  1e-18  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.404622  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0156  hypothetical protein  36.42 
 
 
202 aa  94.4  1e-18  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.908882  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0137  hypothetical protein  37.09 
 
 
202 aa  94.7  1e-18  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.0732771 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3889  hypothetical protein  34.68 
 
 
227 aa  94.4  1e-18  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.154198  normal  0.229372 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4526  hypothetical protein  34.43 
 
 
189 aa  93.6  2e-18  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.410166  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2245  hypothetical protein  35 
 
 
220 aa  94  2e-18  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.19318  normal 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5698  hypothetical protein  31.05 
 
 
237 aa  93.2  3e-18  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.472111  normal  0.587955 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5311  hypothetical protein  31.05 
 
 
237 aa  93.2  3e-18  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.126804  normal  0.734032 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0891  hypothetical protein  32.96 
 
 
229 aa  92  6e-18  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4568  hypothetical protein  33.15 
 
 
231 aa  92  7e-18  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3676  hypothetical protein  29.59 
 
 
243 aa  91.3  1e-17  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0963625  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4268  protein of unknown function DUF305  40.79 
 
 
227 aa  90.9  2e-17  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.342211  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4447  hypothetical protein  35 
 
 
213 aa  90.5  2e-17  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.708243  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2836  hypothetical protein  33.71 
 
 
215 aa  87.8  1e-16  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.196211 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5736  hypothetical protein  32.04 
 
 
227 aa  87  2e-16  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1437  hypothetical protein  34.09 
 
 
228 aa  86.7  3e-16  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.115856  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5320  hypothetical protein  30.11 
 
 
225 aa  86.7  3e-16  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1455  hypothetical protein  34.09 
 
 
228 aa  86.7  3e-16  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.502246 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5409  hypothetical protein  30.11 
 
 
225 aa  86.7  3e-16  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.180608  normal  0.175735 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5699  hypothetical protein  30.56 
 
 
227 aa  85.9  5e-16  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0174  hypothetical protein  31.93 
 
 
205 aa  83.6  0.000000000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3691  hypothetical protein  37.41 
 
 
197 aa  81.6  0.000000000000008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011881  Achl_4525  protein of unknown function DUF305  32.58 
 
 
280 aa  80.5  0.00000000000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.137283 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0485  hypothetical protein  30.32 
 
 
207 aa  79.3  0.00000000000005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.08806 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2457  hypothetical protein  31.52 
 
 
179 aa  77  0.0000000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.10169  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4859  hypothetical protein  32.73 
 
 
179 aa  76.6  0.0000000000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.465099  normal  0.0782365 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3397  hypothetical protein  36.81 
 
 
199 aa  75.9  0.0000000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.423621 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3506  protein of unknown function DUF305  29.19 
 
 
235 aa  75.5  0.0000000000006  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.974087  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5333  protein of unknown function DUF305  33.12 
 
 
206 aa  75.1  0.0000000000008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.628713  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0590  hypothetical protein  32.24 
 
 
208 aa  72.8  0.000000000004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4389  hypothetical protein  30.15 
 
 
185 aa  71.6  0.000000000008  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.844774 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4008  hypothetical protein  28.99 
 
 
197 aa  71.2  0.00000000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1143  protein of unknown function DUF305  31.54 
 
 
200 aa  70.1  0.00000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1150  hypothetical protein  30 
 
 
218 aa  68.6  0.00000000008  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4157  protein of unknown function DUF305  27.44 
 
 
217 aa  66.2  0.0000000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.427773  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4123  hypothetical protein  33.33 
 
 
198 aa  65.5  0.0000000006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2580  protein of unknown function DUF305  28 
 
 
224 aa  65.1  0.0000000008  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4455  hypothetical protein  27.44 
 
 
229 aa  64.7  0.000000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.248989  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1237  hypothetical protein  28.05 
 
 
239 aa  64.7  0.000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.584901  normal  0.0371958 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1047  protein of unknown function DUF305  32.87 
 
 
210 aa  64.3  0.000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.109327 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0132  protein of unknown function DUF305  32.89 
 
 
192 aa  63.5  0.000000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.857037  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2368  hypothetical protein  30.22 
 
 
188 aa  63.2  0.000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.838223  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_30000  hypothetical protein  26.15 
 
 
264 aa  63.2  0.000000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0111824  normal  0.273693 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0639  putative secreted protein  26.95 
 
 
191 aa  62.8  0.000000004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3655  hypothetical protein  25.15 
 
 
221 aa  63.2  0.000000004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3044  protein of unknown function DUF305  33.99 
 
 
230 aa  62.4  0.000000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.22024  normal  0.753211 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1633  hypothetical protein  29.25 
 
 
191 aa  62.4  0.000000005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4037  hypothetical protein  25.15 
 
 
222 aa  62.8  0.000000005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0675936  hitchhiker  0.00542387 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4397  hypothetical protein  26.67 
 
 
226 aa  62.4  0.000000005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.801052  normal  0.828991 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0121  hypothetical protein  27.75 
 
 
211 aa  62.4  0.000000006  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.261528  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1810  protein of unknown function DUF305  25.65 
 
 
239 aa  61.6  0.000000009  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1810  protein of unknown function DUF305  25.7 
 
 
257 aa  61.2  0.00000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.117773  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1404  protein of unknown function DUF305  29.63 
 
 
231 aa  61.2  0.00000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  decreased coverage  0.00923301  normal 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0815  hypothetical protein  26.19 
 
 
207 aa  61.2  0.00000001  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1473  hypothetical protein  29.41 
 
 
253 aa  61.2  0.00000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.49823  normal  0.238367 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2783  hypothetical protein  30 
 
 
202 aa  61.6  0.00000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6160  protein of unknown function DUF305  26.34 
 
 
253 aa  61.2  0.00000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2558  hypothetical protein  28.57 
 
 
217 aa  60.1  0.00000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.503516  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2090  protein of unknown function DUF305  24.27 
 
 
248 aa  60.5  0.00000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0249102  normal  0.0354487 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1313  hypothetical protein  28.67 
 
 
211 aa  60.1  0.00000003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2567  hypothetical protein  34.01 
 
 
206 aa  60.1  0.00000003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0200  protein of unknown function DUF305  29.89 
 
 
243 aa  57.8  0.0000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009806  Krad_4575  hypothetical protein  28.02 
 
 
300 aa  57.8  0.0000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2129  protein of unknown function DUF305  26.79 
 
 
223 aa  57.8  0.0000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000673647  n/a   
 
 
-
 
NC_013731  Slin_6656  protein of unknown function DUF305  27.46 
 
 
197 aa  57.4  0.0000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.817107 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2213  hypothetical protein  30.28 
 
 
241 aa  56.6  0.0000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>