98 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Oter_4397 on replicon NC_010571
Organism: Opitutus terrae PB90-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010571  Oter_4397  hypothetical protein  100 
 
 
226 aa  451  1.0000000000000001e-126  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.801052  normal  0.828991 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2579  hypothetical protein  30.98 
 
 
202 aa  78.6  0.00000000000007  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2580  protein of unknown function DUF305  29.35 
 
 
224 aa  77.4  0.0000000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0057  hypothetical protein  31.49 
 
 
208 aa  73.2  0.000000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009806  Krad_4586  hypothetical protein  27.96 
 
 
265 aa  72.4  0.000000000005  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3396  protein of unknown function DUF305  28.96 
 
 
237 aa  69.3  0.00000000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.886047  normal  0.773197 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0736  hypothetical protein  28.04 
 
 
270 aa  68.2  0.00000000009  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0460895  hitchhiker  0.00701181 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1150  hypothetical protein  24.31 
 
 
218 aa  68.2  0.0000000001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0147  hypothetical protein  30.39 
 
 
202 aa  67  0.0000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.404622  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0156  hypothetical protein  30.39 
 
 
202 aa  67  0.0000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.908882  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0047  hypothetical protein  30.65 
 
 
232 aa  67  0.0000000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4157  protein of unknown function DUF305  27.57 
 
 
217 aa  66.2  0.0000000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.427773  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0137  hypothetical protein  29.83 
 
 
202 aa  66.2  0.0000000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.0732771 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0121  hypothetical protein  26.23 
 
 
211 aa  65.1  0.0000000008  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.261528  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4415  protein of unknown function DUF305  27.8 
 
 
202 aa  63.9  0.000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.126861  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0139  protein of unknown function DUF305  28.27 
 
 
237 aa  63.9  0.000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2090  protein of unknown function DUF305  28.33 
 
 
248 aa  64.3  0.000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0249102  normal  0.0354487 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0132  protein of unknown function DUF305  25.79 
 
 
192 aa  63.2  0.000000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.857037  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2111  hypothetical protein  26.67 
 
 
223 aa  62.4  0.000000005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.0727975 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1394  hypothetical protein  28.57 
 
 
212 aa  62  0.000000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.182892 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3676  hypothetical protein  29.63 
 
 
243 aa  60.8  0.00000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0963625  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_30000  hypothetical protein  29.02 
 
 
264 aa  58.9  0.00000005  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0111824  normal  0.273693 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3974  hypothetical protein  28.57 
 
 
271 aa  58.9  0.00000007  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6160  protein of unknown function DUF305  28.42 
 
 
253 aa  58.5  0.00000008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2059  protein of unknown function DUF305  26.37 
 
 
208 aa  58.2  0.0000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.243739  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2457  hypothetical protein  25.41 
 
 
179 aa  57.8  0.0000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.10169  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0639  putative secreted protein  28.49 
 
 
191 aa  57.4  0.0000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4859  hypothetical protein  25.97 
 
 
179 aa  57.4  0.0000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.465099  normal  0.0782365 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5740  hypothetical protein  26.02 
 
 
199 aa  56.6  0.0000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0485  hypothetical protein  25.68 
 
 
207 aa  56.2  0.0000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.08806 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2254  hypothetical protein  25.56 
 
 
223 aa  55.5  0.0000006  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0831973 
 
 
-
 
NC_011881  Achl_4525  protein of unknown function DUF305  28.84 
 
 
280 aa  55.1  0.0000008  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.137283 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4123  hypothetical protein  23.4 
 
 
198 aa  55.1  0.0000008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2567  hypothetical protein  23.62 
 
 
206 aa  55.1  0.0000009  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1610  hypothetical protein  25.27 
 
 
219 aa  54.7  0.000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.506361  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0305  hypothetical protein  20.73 
 
 
192 aa  53.5  0.000003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0122  hypothetical protein  29.41 
 
 
301 aa  53.5  0.000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.647625  normal  0.435357 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1047  protein of unknown function DUF305  24.19 
 
 
210 aa  53.1  0.000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.109327 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0315  hypothetical protein  26.2 
 
 
213 aa  51.6  0.000009  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0086  hypothetical protein  24.21 
 
 
197 aa  51.6  0.00001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1897  protein of unknown function DUF305  27.11 
 
 
270 aa  51.2  0.00001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.79954  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1810  protein of unknown function DUF305  29.24 
 
 
257 aa  50.8  0.00002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.117773  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5409  hypothetical protein  24.87 
 
 
225 aa  50.4  0.00002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.180608  normal  0.175735 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5320  hypothetical protein  24.87 
 
 
225 aa  50.4  0.00002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3672  protein of unknown function DUF305  25.7 
 
 
210 aa  50.1  0.00003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5699  hypothetical protein  24.87 
 
 
227 aa  50.1  0.00003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_18400  hypothetical protein  24.86 
 
 
227 aa  49.7  0.00004  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4189  hypothetical protein  27.93 
 
 
195 aa  49.7  0.00004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.314897  normal  0.043987 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0174  hypothetical protein  21.67 
 
 
205 aa  49.3  0.00005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1143  protein of unknown function DUF305  22.22 
 
 
200 aa  49.3  0.00005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5311  hypothetical protein  27.03 
 
 
237 aa  49.3  0.00005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.126804  normal  0.734032 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5698  hypothetical protein  27.03 
 
 
237 aa  49.3  0.00005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.472111  normal  0.587955 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1404  protein of unknown function DUF305  25.27 
 
 
231 aa  49.3  0.00005  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  decreased coverage  0.00923301  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0357  protein of unknown function DUF305  31.54 
 
 
208 aa  49.3  0.00005  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0891  hypothetical protein  31.49 
 
 
229 aa  48.9  0.00006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_04960  hypothetical protein  24.46 
 
 
232 aa  48.9  0.00006  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3980  hypothetical protein  39.06 
 
 
207 aa  47.8  0.0001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3032  protein of unknown function DUF305  25 
 
 
206 aa  47.8  0.0001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.709279 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6075  protein of unknown function DUF305  34.78 
 
 
137 aa  47  0.0002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.69008  normal  0.152537 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2299  hypothetical protein  35.82 
 
 
131 aa  47.4  0.0002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.502645  normal  0.300694 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3506  protein of unknown function DUF305  24.88 
 
 
235 aa  47.4  0.0002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.974087  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2280  hypothetical protein  22.83 
 
 
226 aa  46.2  0.0004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5683  hypothetical protein  21.43 
 
 
197 aa  46.2  0.0005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.389225 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5327  hypothetical protein  21.43 
 
 
197 aa  46.2  0.0005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4526  hypothetical protein  25.27 
 
 
189 aa  45.8  0.0005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.410166  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2558  hypothetical protein  34.31 
 
 
217 aa  45.8  0.0005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.503516  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5858  hypothetical protein  25.81 
 
 
218 aa  45.8  0.0005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1099  protein of unknown function DUF305  28.46 
 
 
160 aa  45.8  0.0006  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.115444  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1455  hypothetical protein  28.11 
 
 
228 aa  45.4  0.0008  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.502246 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1437  hypothetical protein  28.11 
 
 
228 aa  45.4  0.0008  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.115856  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0200  protein of unknown function DUF305  27.37 
 
 
243 aa  44.7  0.001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2129  protein of unknown function DUF305  35.14 
 
 
223 aa  45.1  0.001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000673647  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2783  hypothetical protein  28.57 
 
 
202 aa  44.3  0.001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009806  Krad_4575  hypothetical protein  33.33 
 
 
300 aa  44.7  0.001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5736  hypothetical protein  25.95 
 
 
227 aa  44.7  0.001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0590  hypothetical protein  25 
 
 
208 aa  45.1  0.001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5333  protein of unknown function DUF305  20.33 
 
 
206 aa  44.3  0.001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.628713  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0885  protein of unknown function DUF305  25.63 
 
 
203 aa  44.3  0.001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.309526 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2281  protein of unknown function DUF305  26 
 
 
180 aa  44.3  0.002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.0018571  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3538  protein of unknown function DUF305  25.14 
 
 
205 aa  44.3  0.002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.396776 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0706  hypothetical protein  38.81 
 
 
203 aa  43.5  0.002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4455  hypothetical protein  27.22 
 
 
229 aa  43.9  0.002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.248989  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2245  hypothetical protein  23.75 
 
 
220 aa  44.3  0.002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.19318  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0108  protein of unknown function DUF305  28.99 
 
 
134 aa  43.9  0.002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.937647 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2829  hypothetical protein  27.54 
 
 
128 aa  43.1  0.003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.137612 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4008  hypothetical protein  22.38 
 
 
197 aa  43.1  0.003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4568  hypothetical protein  25.52 
 
 
231 aa  43.5  0.003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0506  protein of unknown function DUF305  31.82 
 
 
119 aa  43.1  0.003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.0184859 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3044  protein of unknown function DUF305  22.1 
 
 
230 aa  43.5  0.003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.22024  normal  0.753211 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5499  putative outer membrane protein  38.78 
 
 
191 aa  42.7  0.004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.234024  decreased coverage  0.000160663 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3889  hypothetical protein  24.86 
 
 
227 aa  42.7  0.004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.154198  normal  0.229372 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5614  protein of unknown function DUF305  37.5 
 
 
135 aa  43.1  0.004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1130  protein of unknown function DUF305  23.86 
 
 
214 aa  42.4  0.005  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.0486316 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1237  hypothetical protein  31.75 
 
 
239 aa  42.7  0.005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.584901  normal  0.0371958 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2836  hypothetical protein  27.08 
 
 
215 aa  42.7  0.005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.196211 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3056  protein of unknown function DUF305  27.54 
 
 
128 aa  42.4  0.005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4129  protein of unknown function DUF305  34.85 
 
 
125 aa  42  0.007  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.933838  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0092  protein of unknown function DUF305  35.82 
 
 
139 aa  41.6  0.009  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.62579 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>