184 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrub_0305 on replicon NC_013946
Organism: Meiothermus ruber DSM 1279



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013946  Mrub_0305  hypothetical protein  100 
 
 
192 aa  397  9.999999999999999e-111  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0132  protein of unknown function DUF305  72.73 
 
 
192 aa  269  2e-71  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.857037  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0086  hypothetical protein  35.16 
 
 
197 aa  111  5e-24  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4123  hypothetical protein  37.36 
 
 
198 aa  109  3e-23  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2368  hypothetical protein  33.53 
 
 
188 aa  102  3e-21  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.838223  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2567  hypothetical protein  32.38 
 
 
206 aa  102  4e-21  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2580  protein of unknown function DUF305  35.8 
 
 
224 aa  101  8e-21  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1143  protein of unknown function DUF305  33.92 
 
 
200 aa  98.2  7e-20  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0312  hypothetical protein  38.82 
 
 
250 aa  95.1  6e-19  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.153905  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1047  protein of unknown function DUF305  39.47 
 
 
210 aa  95.1  6e-19  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.109327 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2783  hypothetical protein  38.26 
 
 
202 aa  95.1  6e-19  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1836  hypothetical protein  37.82 
 
 
246 aa  94  1e-18  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0521181  normal  0.479841 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2280  hypothetical protein  36.36 
 
 
226 aa  92.8  2e-18  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0121  hypothetical protein  34.48 
 
 
211 aa  92  4e-18  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.261528  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0285  hypothetical protein  37.33 
 
 
279 aa  90.9  1e-17  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1473  hypothetical protein  35.33 
 
 
253 aa  90.1  2e-17  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.49823  normal  0.238367 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0815  hypothetical protein  32.89 
 
 
207 aa  87.4  1e-16  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1517  hypothetical protein  30.38 
 
 
263 aa  86.3  3e-16  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0547298  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1313  hypothetical protein  33.56 
 
 
211 aa  85.9  4e-16  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0057  hypothetical protein  30.95 
 
 
208 aa  82.8  0.000000000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1150  hypothetical protein  31.45 
 
 
218 aa  81.3  0.000000000000008  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3538  protein of unknown function DUF305  32.05 
 
 
205 aa  80.5  0.00000000000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.396776 
 
 
-
 
NC_009806  Krad_4586  hypothetical protein  30.59 
 
 
265 aa  80.1  0.00000000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1097  protein of unknown function DUF305  30.67 
 
 
223 aa  79.3  0.00000000000003  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000215144  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4447  hypothetical protein  32.99 
 
 
213 aa  77.4  0.0000000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.708243  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4189  hypothetical protein  31.76 
 
 
195 aa  77.4  0.0000000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.314897  normal  0.043987 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2245  hypothetical protein  33.15 
 
 
220 aa  77  0.0000000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.19318  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0885  protein of unknown function DUF305  32.89 
 
 
203 aa  74.3  0.0000000000009  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.309526 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1571  conserved hypothetical protein (DUF305 domain protein)  24.26 
 
 
206 aa  73.9  0.000000000001  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0139  protein of unknown function DUF305  26.32 
 
 
237 aa  72.4  0.000000000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0357  protein of unknown function DUF305  29.61 
 
 
208 aa  70.9  0.00000000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1508  hypothetical protein  29.75 
 
 
217 aa  69.3  0.00000000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  decreased coverage  0.0000100839  normal  0.123657 
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4487  hypothetical protein  30.92 
 
 
209 aa  68.9  0.00000000004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.161376  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1404  protein of unknown function DUF305  30.18 
 
 
231 aa  68.9  0.00000000004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  decreased coverage  0.00923301  normal 
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4461  hypothetical protein  31.45 
 
 
213 aa  68.6  0.00000000005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008538  Arth_4292  hypothetical protein  31.45 
 
 
213 aa  68.6  0.00000000005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008539  Arth_4192  hypothetical protein  31.45 
 
 
213 aa  68.6  0.00000000005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0137  hypothetical protein  30.61 
 
 
202 aa  68.6  0.00000000006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.0732771 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3044  protein of unknown function DUF305  28.86 
 
 
230 aa  67.8  0.00000000008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.22024  normal  0.753211 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3980  hypothetical protein  29.48 
 
 
207 aa  67.8  0.00000000008  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0147  hypothetical protein  30.41 
 
 
202 aa  67.8  0.0000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.404622  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0156  hypothetical protein  30.41 
 
 
202 aa  67.8  0.0000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.908882  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1535  hypothetical protein  36.11 
 
 
113 aa  67  0.0000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.619429  normal  0.733742 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5740  hypothetical protein  28.38 
 
 
199 aa  65.9  0.0000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1610  hypothetical protein  25.5 
 
 
219 aa  65.9  0.0000000004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.506361  normal 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5683  hypothetical protein  30.41 
 
 
197 aa  65.9  0.0000000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.389225 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5327  hypothetical protein  30.41 
 
 
197 aa  65.9  0.0000000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0590  hypothetical protein  29.7 
 
 
208 aa  65.5  0.0000000005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4389  hypothetical protein  28.86 
 
 
185 aa  65.1  0.0000000006  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.844774 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3032  protein of unknown function DUF305  30.32 
 
 
206 aa  65.1  0.0000000007  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.709279 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1810  protein of unknown function DUF305  25.56 
 
 
239 aa  64.7  0.0000000008  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2579  hypothetical protein  29.14 
 
 
202 aa  63.9  0.000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_04960  hypothetical protein  28.82 
 
 
232 aa  63.5  0.000000002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0541  hypothetical protein  43.06 
 
 
120 aa  63.5  0.000000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1101  protein of unknown function DUF305  35.19 
 
 
132 aa  62.8  0.000000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.3981  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0461  protein of unknown function DUF305  42.86 
 
 
119 aa  62.8  0.000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.607138  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4526  hypothetical protein  28.82 
 
 
189 aa  62.8  0.000000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.410166  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3868  hypothetical protein  41.27 
 
 
134 aa  62.4  0.000000004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6516  protein of unknown function DUF305  25.64 
 
 
218 aa  62.4  0.000000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.14254  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4415  protein of unknown function DUF305  30.61 
 
 
202 aa  62  0.000000005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.126861  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_18400  hypothetical protein  29.34 
 
 
227 aa  62  0.000000005  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2129  protein of unknown function DUF305  31.51 
 
 
223 aa  61.2  0.000000009  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000673647  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0315  hypothetical protein  27.08 
 
 
213 aa  60.8  0.00000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4397  hypothetical protein  22.28 
 
 
226 aa  60.8  0.00000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.801052  normal  0.828991 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3430  hypothetical protein  37.36 
 
 
116 aa  60.8  0.00000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0174  hypothetical protein  27.45 
 
 
205 aa  59.7  0.00000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6146  putative secreted protein  28.82 
 
 
207 aa  59.7  0.00000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.666575  normal  0.0345137 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2213  hypothetical protein  31.97 
 
 
241 aa  59.7  0.00000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3672  protein of unknown function DUF305  29.11 
 
 
210 aa  59.7  0.00000003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0179  hypothetical protein  48.21 
 
 
142 aa  59.7  0.00000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0473864  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3895  hypothetical protein  43.64 
 
 
134 aa  59.3  0.00000004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0926  hypothetical protein  35.56 
 
 
117 aa  59.3  0.00000004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.984322  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2254  hypothetical protein  32.43 
 
 
223 aa  58.9  0.00000004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0831973 
 
 
-
 
NC_013731  Slin_6656  protein of unknown function DUF305  27.27 
 
 
197 aa  58.5  0.00000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.817107 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2111  hypothetical protein  31.97 
 
 
223 aa  58.5  0.00000006  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.0727975 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1810  protein of unknown function DUF305  27.92 
 
 
257 aa  58.2  0.00000007  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.117773  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5858  hypothetical protein  27.33 
 
 
218 aa  58.2  0.00000007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4244  protein of unknown function DUF305  27.67 
 
 
217 aa  58.2  0.00000007  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.827618  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3242  hypothetical protein  43.4 
 
 
134 aa  58.2  0.00000008  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0506  protein of unknown function DUF305  39.68 
 
 
119 aa  58.2  0.00000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.0184859 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0639  putative secreted protein  25.62 
 
 
191 aa  57.8  0.0000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1437  hypothetical protein  26.59 
 
 
228 aa  57.8  0.0000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.115856  n/a   
 
 
-
 
NC_013731  Slin_6657  protein of unknown function DUF305  29.38 
 
 
209 aa  57.8  0.0000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.50824 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2947  protein of unknown function DUF305  48.21 
 
 
128 aa  57.4  0.0000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1455  hypothetical protein  26.59 
 
 
228 aa  57.8  0.0000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.502246 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3691  hypothetical protein  28.86 
 
 
197 aa  57  0.0000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2829  hypothetical protein  30.09 
 
 
128 aa  57  0.0000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.137612 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2059  protein of unknown function DUF305  25.17 
 
 
208 aa  56.6  0.0000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.243739  n/a   
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4455  hypothetical protein  28.57 
 
 
229 aa  57  0.0000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.248989  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0401  hypothetical protein  32.18 
 
 
126 aa  57  0.0000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.0681518 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2214  protein of unknown function DUF305  30.2 
 
 
207 aa  57  0.0000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.702552  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0261  hypothetical protein  40.96 
 
 
127 aa  56.6  0.0000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.188703  normal  0.0101728 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2666  hypothetical protein  40.96 
 
 
127 aa  56.6  0.0000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.499995 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2595  protein of unknown function DUF305  27.04 
 
 
217 aa  57  0.0000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.974704  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3056  protein of unknown function DUF305  30.97 
 
 
128 aa  56.2  0.0000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5614  protein of unknown function DUF305  37.23 
 
 
135 aa  55.8  0.0000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0108  protein of unknown function DUF305  47.37 
 
 
134 aa  55.8  0.0000004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.937647 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1237  hypothetical protein  40 
 
 
239 aa  55.8  0.0000004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.584901  normal  0.0371958 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1394  hypothetical protein  30.2 
 
 
212 aa  55.1  0.0000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.182892 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5333  protein of unknown function DUF305  23.65 
 
 
206 aa  54.7  0.0000008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.628713  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>