62 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_6516 on replicon NC_013730
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013730  Slin_6516  protein of unknown function DUF305  100 
 
 
218 aa  432  1e-120  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.14254  normal 
 
 
-
 
NC_013732  Slin_6903  protein of unknown function DUF305  27.71 
 
 
194 aa  92.8  3e-18  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.912049  normal 
 
 
-
 
NC_013731  Slin_6657  protein of unknown function DUF305  27.72 
 
 
209 aa  80.5  0.00000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.50824 
 
 
-
 
NC_013731  Slin_6656  protein of unknown function DUF305  27.41 
 
 
197 aa  79.3  0.00000000000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.817107 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1836  hypothetical protein  28.67 
 
 
246 aa  72  0.000000000006  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0521181  normal  0.479841 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1508  hypothetical protein  26.45 
 
 
217 aa  67.4  0.0000000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  decreased coverage  0.0000100839  normal  0.123657 
 
 
-
 
NC_013732  Slin_6904  protein of unknown function DUF305  28.49 
 
 
237 aa  64.3  0.000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.147564  normal  0.887388 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0312  hypothetical protein  26.62 
 
 
250 aa  60.5  0.00000002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.153905  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0305  hypothetical protein  25 
 
 
192 aa  58.5  0.00000007  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0285  hypothetical protein  27.74 
 
 
279 aa  58.2  0.00000009  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3868  hypothetical protein  28.69 
 
 
134 aa  57.8  0.0000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1517  hypothetical protein  25.34 
 
 
263 aa  55.8  0.0000005  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0547298  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0132  protein of unknown function DUF305  23.97 
 
 
192 aa  55.5  0.0000006  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.857037  normal 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1876  hypothetical protein  33.33 
 
 
141 aa  55.1  0.0000008  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.257011  n/a   
 
 
-
 
NC_008758  Pnap_4562  hypothetical protein  35.94 
 
 
91 aa  53.9  0.000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008758  Pnap_4535  hypothetical protein  35.94 
 
 
98 aa  53.9  0.000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.858749  normal 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0406  hypothetical protein  32.26 
 
 
141 aa  53.1  0.000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.1733  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5398  hypothetical protein  38.71 
 
 
152 aa  52.8  0.000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0461  protein of unknown function DUF305  35.29 
 
 
119 aa  51.6  0.000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.607138  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3796  hypothetical protein  32.14 
 
 
151 aa  51.2  0.00001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4933  protein of unknown function DUF305  31.67 
 
 
158 aa  50.4  0.00002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.913389  normal  0.245188 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6259  hypothetical protein  32.79 
 
 
164 aa  50.4  0.00002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.510981 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3856  protein of unknown function DUF305  31.67 
 
 
158 aa  50.4  0.00002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.422416  normal 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1967  hypothetical protein  34.92 
 
 
141 aa  49.3  0.00004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.619841  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0401  hypothetical protein  27.47 
 
 
126 aa  49.7  0.00004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.0681518 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1571  conserved hypothetical protein (DUF305 domain protein)  22.97 
 
 
206 aa  49.3  0.00005  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3242  hypothetical protein  25.81 
 
 
134 aa  48.9  0.00006  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5736  protein of unknown function DUF305  33.33 
 
 
132 aa  48.1  0.00009  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.470482 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0506  protein of unknown function DUF305  31.43 
 
 
119 aa  47.8  0.0001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.0184859 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0179  hypothetical protein  38.6 
 
 
142 aa  47.8  0.0001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0473864  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6148  hypothetical protein  33.33 
 
 
127 aa  48.1  0.0001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.137676  normal  0.19662 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5806  hypothetical protein  33.33 
 
 
122 aa  47.8  0.0001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6564  hypothetical protein  31.75 
 
 
130 aa  47.4  0.0002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0261  hypothetical protein  32.26 
 
 
127 aa  47.4  0.0002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.188703  normal  0.0101728 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2666  hypothetical protein  32.26 
 
 
127 aa  47.4  0.0002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.499995 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5510  hypothetical protein  30.59 
 
 
130 aa  47  0.0002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.563471  normal  0.269299 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0541  hypothetical protein  34.33 
 
 
120 aa  46.6  0.0003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010070  Bmul_6297  hypothetical protein  30.77 
 
 
131 aa  46.6  0.0003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.21149  normal  0.389023 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6278  hypothetical protein  31.94 
 
 
130 aa  46.2  0.0004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00531992 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1290  hypothetical protein  33.33 
 
 
127 aa  45.8  0.0005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.434421  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6541  hypothetical protein  33.33 
 
 
127 aa  45.8  0.0005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.249657  normal 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3772  hypothetical protein  31.51 
 
 
100 aa  44.7  0.001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.697679  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2280  hypothetical protein  25 
 
 
226 aa  44.7  0.001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2580  protein of unknown function DUF305  22.22 
 
 
224 aa  44.7  0.001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5614  protein of unknown function DUF305  36.67 
 
 
135 aa  44.3  0.001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3056  protein of unknown function DUF305  25.22 
 
 
128 aa  43.9  0.002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1097  protein of unknown function DUF305  28.57 
 
 
223 aa  43.5  0.002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000215144  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2045  hypothetical protein  31.75 
 
 
132 aa  43.5  0.003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.928225  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1985  hypothetical protein  29.07 
 
 
128 aa  43.1  0.003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.448564  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0997  protein of unknown function DUF305  29.63 
 
 
148 aa  42.7  0.004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.495486  normal  0.061691 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3538  protein of unknown function DUF305  20.13 
 
 
205 aa  42.7  0.004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.396776 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2299  hypothetical protein  31.25 
 
 
131 aa  42.7  0.004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.502645  normal  0.300694 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1101  protein of unknown function DUF305  24.49 
 
 
132 aa  42.7  0.005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.3981  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3895  hypothetical protein  27.34 
 
 
134 aa  42.4  0.005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2829  hypothetical protein  25.22 
 
 
128 aa  42.7  0.005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.137612 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0926  hypothetical protein  25.84 
 
 
117 aa  42  0.007  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.984322  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0147  hypothetical protein  33.85 
 
 
202 aa  42  0.007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.404622  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0137  hypothetical protein  33.85 
 
 
202 aa  42  0.007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.0732771 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0156  hypothetical protein  33.85 
 
 
202 aa  42  0.007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.908882  normal 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0815  hypothetical protein  21.02 
 
 
207 aa  42  0.007  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5258  hypothetical protein  30.65 
 
 
150 aa  42  0.007  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.355958  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6075  protein of unknown function DUF305  33.33 
 
 
137 aa  42  0.008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.69008  normal  0.152537 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>