170 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphyt_6075 on replicon NC_010676
Organism: Burkholderia phytofirmans PsJN



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010676  Bphyt_6075  protein of unknown function DUF305  100 
 
 
137 aa  281  3.0000000000000004e-75  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.69008  normal  0.152537 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2299  hypothetical protein  86.26 
 
 
131 aa  239  6e-63  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.502645  normal  0.300694 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2045  hypothetical protein  63.04 
 
 
132 aa  155  2e-37  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.928225  normal 
 
 
-
 
NC_010070  Bmul_6297  hypothetical protein  53.28 
 
 
131 aa  132  9.999999999999999e-31  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.21149  normal  0.389023 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6278  hypothetical protein  70.37 
 
 
130 aa  122  2e-27  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00531992 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6148  hypothetical protein  52.67 
 
 
127 aa  121  3e-27  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.137676  normal  0.19662 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6564  hypothetical protein  68.24 
 
 
130 aa  120  5e-27  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1290  hypothetical protein  68.29 
 
 
127 aa  118  3e-26  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.434421  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6541  hypothetical protein  68.29 
 
 
127 aa  118  3e-26  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.249657  normal 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1876  hypothetical protein  64.77 
 
 
141 aa  117  6e-26  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.257011  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1967  hypothetical protein  64.77 
 
 
141 aa  117  7e-26  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.619841  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0406  hypothetical protein  64.77 
 
 
141 aa  117  7.999999999999999e-26  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.1733  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5510  hypothetical protein  65.85 
 
 
130 aa  115  1.9999999999999998e-25  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.563471  normal  0.269299 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0506  protein of unknown function DUF305  55.79 
 
 
119 aa  103  8e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.0184859 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0461  protein of unknown function DUF305  55.79 
 
 
119 aa  102  2e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.607138  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3895  hypothetical protein  43.61 
 
 
134 aa  97.4  5e-20  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1535  hypothetical protein  42.28 
 
 
113 aa  96.7  9e-20  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.619429  normal  0.733742 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5806  hypothetical protein  52.04 
 
 
122 aa  96.3  1e-19  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0926  hypothetical protein  51.16 
 
 
117 aa  92.8  1e-18  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.984322  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3056  protein of unknown function DUF305  42.74 
 
 
128 aa  91.7  3e-18  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0401  hypothetical protein  50.54 
 
 
126 aa  91.3  4e-18  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.0681518 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3242  hypothetical protein  42.4 
 
 
134 aa  91.3  4e-18  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2536  hypothetical protein  42.42 
 
 
133 aa  90.9  6e-18  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.608732  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4129  protein of unknown function DUF305  53.75 
 
 
125 aa  89.7  1e-17  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.933838  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2829  hypothetical protein  42.74 
 
 
128 aa  89  2e-17  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.137612 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0997  protein of unknown function DUF305  51.85 
 
 
148 aa  87  7e-17  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.495486  normal  0.061691 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2947  protein of unknown function DUF305  51.65 
 
 
128 aa  86.7  9e-17  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1101  protein of unknown function DUF305  45.79 
 
 
132 aa  86.7  1e-16  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.3981  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0179  hypothetical protein  50.59 
 
 
142 aa  85.1  3e-16  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0473864  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5614  protein of unknown function DUF305  49.41 
 
 
135 aa  83.2  0.000000000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0092  protein of unknown function DUF305  47.47 
 
 
139 aa  81.6  0.000000000000003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.62579 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0108  protein of unknown function DUF305  48.15 
 
 
134 aa  81.6  0.000000000000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.937647 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6259  hypothetical protein  53.12 
 
 
164 aa  78.6  0.00000000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.510981 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5736  protein of unknown function DUF305  53.62 
 
 
132 aa  78.6  0.00000000000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.470482 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3856  protein of unknown function DUF305  50 
 
 
158 aa  77.8  0.00000000000004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.422416  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4933  protein of unknown function DUF305  50 
 
 
158 aa  77.8  0.00000000000004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.913389  normal  0.245188 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3868  hypothetical protein  40.68 
 
 
134 aa  77.4  0.00000000000007  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0261  hypothetical protein  57.63 
 
 
127 aa  77  0.00000000000008  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.188703  normal  0.0101728 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2666  hypothetical protein  57.63 
 
 
127 aa  77  0.00000000000008  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.499995 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5398  hypothetical protein  56.25 
 
 
152 aa  77  0.00000000000009  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1985  hypothetical protein  52.17 
 
 
128 aa  75.9  0.0000000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.448564  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3796  hypothetical protein  49.28 
 
 
151 aa  75.1  0.0000000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3430  hypothetical protein  42.2 
 
 
116 aa  75.1  0.0000000000003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5258  hypothetical protein  53.12 
 
 
150 aa  72.8  0.000000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.355958  normal 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5874  protein of unknown function DUF305  39.55 
 
 
143 aa  72.8  0.000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0285  hypothetical protein  34.21 
 
 
279 aa  70.1  0.000000000009  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0541  hypothetical protein  54.1 
 
 
120 aa  70.1  0.00000000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008758  Pnap_4562  hypothetical protein  55.38 
 
 
91 aa  69.3  0.00000000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008758  Pnap_4535  hypothetical protein  53.85 
 
 
98 aa  68.2  0.00000000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.858749  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1099  protein of unknown function DUF305  42.7 
 
 
160 aa  67.4  0.00000000006  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.115444  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1836  hypothetical protein  45.71 
 
 
246 aa  67  0.00000000007  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0521181  normal  0.479841 
 
 
-
 
NC_011986  Avi_9856  hypothetical protein  37.7 
 
 
142 aa  67  0.00000000009  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3230  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  40.23 
 
 
517 aa  65.5  0.0000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.476229  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1508  hypothetical protein  51.79 
 
 
217 aa  65.1  0.0000000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  decreased coverage  0.0000100839  normal  0.123657 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7165  protein of unknown function DUF305  34.78 
 
 
143 aa  64.7  0.0000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.277418  normal  0.663487 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0312  hypothetical protein  47.27 
 
 
250 aa  63.9  0.0000000006  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.153905  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1517  hypothetical protein  42.31 
 
 
263 aa  63.5  0.000000001  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0547298  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1097  protein of unknown function DUF305  42.65 
 
 
223 aa  62.8  0.000000002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000215144  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1338  hypothetical protein  55.77 
 
 
152 aa  60.8  0.000000005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.031335  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1571  conserved hypothetical protein (DUF305 domain protein)  50 
 
 
206 aa  60.8  0.000000007  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1150  hypothetical protein  49.09 
 
 
218 aa  60.1  0.000000009  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3044  protein of unknown function DUF305  56.86 
 
 
230 aa  60.1  0.000000009  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.22024  normal  0.753211 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2580  protein of unknown function DUF305  47.17 
 
 
224 aa  59.7  0.00000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013731  Slin_6657  protein of unknown function DUF305  44.64 
 
 
209 aa  59.7  0.00000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.50824 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2316  hypothetical protein  37.5 
 
 
130 aa  60.1  0.00000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.865879 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0815  hypothetical protein  46.48 
 
 
207 aa  59.3  0.00000002  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0071  hypothetical protein  42.31 
 
 
136 aa  58.5  0.00000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal  0.316359 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0121  hypothetical protein  47.06 
 
 
211 aa  57  0.00000008  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.261528  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0139  protein of unknown function DUF305  39.82 
 
 
237 aa  57  0.00000009  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2280  hypothetical protein  31.82 
 
 
226 aa  55.8  0.0000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3873  hypothetical protein  43.94 
 
 
147 aa  55.8  0.0000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3772  hypothetical protein  38.37 
 
 
100 aa  55.5  0.0000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.697679  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2783  hypothetical protein  43.28 
 
 
202 aa  55.5  0.0000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4123  hypothetical protein  46.3 
 
 
198 aa  55.1  0.0000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0057  hypothetical protein  45.76 
 
 
208 aa  54.3  0.0000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0086  hypothetical protein  40.35 
 
 
197 aa  53.9  0.0000008  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1610  hypothetical protein  46.67 
 
 
219 aa  53.1  0.000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.506361  normal 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5698  hypothetical protein  48.33 
 
 
237 aa  53.1  0.000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.472111  normal  0.587955 
 
 
-
 
NC_013731  Slin_6656  protein of unknown function DUF305  43.1 
 
 
197 aa  53.5  0.000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.817107 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5311  hypothetical protein  48.33 
 
 
237 aa  53.1  0.000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.126804  normal  0.734032 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0132  protein of unknown function DUF305  43.4 
 
 
192 aa  52.8  0.000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.857037  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3676  hypothetical protein  47.54 
 
 
243 aa  52.8  0.000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0963625  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4568  hypothetical protein  48.39 
 
 
231 aa  52.4  0.000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3032  protein of unknown function DUF305  43.94 
 
 
206 aa  52.4  0.000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.709279 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0891  hypothetical protein  46.77 
 
 
229 aa  52  0.000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2579  hypothetical protein  44.44 
 
 
202 aa  52  0.000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0147  hypothetical protein  40.91 
 
 
202 aa  51.2  0.000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.404622  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0156  hypothetical protein  40.91 
 
 
202 aa  51.2  0.000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.908882  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0137  hypothetical protein  40.91 
 
 
202 aa  51.2  0.000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.0732771 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1473  hypothetical protein  37.18 
 
 
253 aa  51.6  0.000004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.49823  normal  0.238367 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2595  protein of unknown function DUF305  35.23 
 
 
217 aa  51.2  0.000005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.974704  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2567  hypothetical protein  32.79 
 
 
206 aa  50.8  0.000006  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2420  hypothetical protein  38.32 
 
 
147 aa  50.8  0.000006  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.692364 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5858  hypothetical protein  51.85 
 
 
218 aa  50.8  0.000006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4244  protein of unknown function DUF305  35.23 
 
 
217 aa  50.8  0.000006  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.827618  n/a   
 
 
-
 
NC_009806  Krad_4586  hypothetical protein  51.85 
 
 
265 aa  50.8  0.000006  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2836  hypothetical protein  49.23 
 
 
215 aa  50.4  0.000007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.196211 
 
 
-
 
NC_013732  Slin_6903  protein of unknown function DUF305  37.68 
 
 
194 aa  50.4  0.000008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.912049  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1047  protein of unknown function DUF305  37.04 
 
 
210 aa  50.4  0.000009  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.109327 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3077  hypothetical protein  54.9 
 
 
164 aa  50.1  0.000009  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>