179 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avi_5806 on replicon NC_011988
Organism: Agrobacterium vitis S4



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011988  Avi_5806  hypothetical protein  100 
 
 		 122 aa  250  4.0000000000000004e-66  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0401  hypothetical protein  66.67 
 
 		 126 aa  125  2.0000000000000002e-28  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0681518 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0461  protein of unknown function DUF305  54.55 
 
 		 119 aa  124  4.0000000000000003e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.607138  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0506  protein of unknown function DUF305  52.89 
 
 		 119 aa  122  2e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0184859 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0926  hypothetical protein  57.45 
 
 		 117 aa  114  6e-25  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.984322  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3895  hypothetical protein  47.11 
 
 		 134 aa  112  2.0000000000000002e-24  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1535  hypothetical protein  47.93 
 
 		 113 aa  111  3e-24  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.619429  normal  0.733742 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3242  hypothetical protein  43.9 
 
 		 134 aa  107  8.000000000000001e-23  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0108  protein of unknown function DUF305  46.56 
 
 		 134 aa  102  2e-21  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.937647 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6075  protein of unknown function DUF305  45.83 
 
 		 137 aa  99.4  1e-20  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.69008  normal  0.152537 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3056  protein of unknown function DUF305  43.33 
 
 		 128 aa  98.6  2e-20  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2829  hypothetical protein  42.5 
 
 		 128 aa  97.4  6e-20  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.137612 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1101  protein of unknown function DUF305  49.48 
 
 		 132 aa  95.9  2e-19  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.3981  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2947  protein of unknown function DUF305  54.88 
 
 		 128 aa  95.1  3e-19  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2045  hypothetical protein  47.58 
 
 		 132 aa  95.1  3e-19  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.928225  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2299  hypothetical protein  45.97 
 
 		 131 aa  94.7  4e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.502645  normal  0.300694 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3868  hypothetical protein  41.46 
 
 		 134 aa  94  6e-19  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6148  hypothetical protein  53.01 
 
 		 127 aa  93.6  8e-19  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.137676  normal  0.19662 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6278  hypothetical protein  54.88 
 
 		 130 aa  92.8  1e-18  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00531992 
 
 
-
 
NC_010070  Bmul_6297  hypothetical protein  42.62 
 
 		 131 aa  91.7  3e-18  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.21149  normal  0.389023 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1290  hypothetical protein  53.01 
 
 		 127 aa  91.3  4e-18  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.434421  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6541  hypothetical protein  53.01 
 
 		 127 aa  91.3  4e-18  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.249657  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5510  hypothetical protein  54.88 
 
 		 130 aa  90.9  5e-18  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.563471  normal  0.269299 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0092  protein of unknown function DUF305  46.32 
 
 		 139 aa  90.9  6e-18  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.62579 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6564  hypothetical protein  53.66 
 
 		 130 aa  89.7  1e-17  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1876  hypothetical protein  44.17 
 
 		 141 aa  90.1  1e-17  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.257011  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0406  hypothetical protein  51.69 
 
 		 141 aa  87.4  6e-17  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.1733  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1967  hypothetical protein  51.69 
 
 		 141 aa  87.4  6e-17  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.619841  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0541  hypothetical protein  62.9 
 
 		 120 aa  87  8e-17  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0179  hypothetical protein  48.81 
 
 		 142 aa  82.4  0.000000000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0473864  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3873  hypothetical protein  51.81 
 
 		 147 aa  81.3  0.000000000000004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5614  protein of unknown function DUF305  47.62 
 
 		 135 aa  81.3  0.000000000000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0261  hypothetical protein  56.41 
 
 		 127 aa  80.9  0.000000000000006  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.188703  normal  0.0101728 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2666  hypothetical protein  56.41 
 
 		 127 aa  80.9  0.000000000000006  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.499995 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0285  hypothetical protein  49.37 
 
 		 279 aa  80.1  0.000000000000009  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4129  protein of unknown function DUF305  42.74 
 
 		 125 aa  78.6  0.00000000000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.933838  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3230  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  50 
 
 		 517 aa  78.2  0.00000000000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.476229  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3430  hypothetical protein  51.9 
 
 		 116 aa  78.2  0.00000000000004  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1517  hypothetical protein  47.37 
 
 		 263 aa  77.8  0.00000000000005  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0547298  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1836  hypothetical protein  46.67 
 
 		 246 aa  76.3  0.0000000000001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0521181  normal  0.479841 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0312  hypothetical protein  45.57 
 
 		 250 aa  75.9  0.0000000000002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.153905  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2536  hypothetical protein  46.34 
 
 		 133 aa  75.9  0.0000000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.608732  normal  1 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5736  protein of unknown function DUF305  54.41 
 
 		 132 aa  74.7  0.0000000000004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.470482 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4933  protein of unknown function DUF305  38.14 
 
 		 158 aa  73.9  0.0000000000006  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.913389  normal  0.245188 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3856  protein of unknown function DUF305  38.14 
 
 		 158 aa  73.9  0.0000000000006  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.422416  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0997  protein of unknown function DUF305  44.57 
 
 		 148 aa  73.9  0.0000000000006  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.495486  normal  0.061691 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1985  hypothetical protein  56.9 
 
 		 128 aa  71.6  0.000000000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.448564  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1338  hypothetical protein  43.33 
 
 		 152 aa  71.6  0.000000000004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.031335  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6259  hypothetical protein  50.75 
 
 		 164 aa  71.2  0.000000000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.510981 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5398  hypothetical protein  50.65 
 
 		 152 aa  69.7  0.00000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3796  hypothetical protein  49.3 
 
 		 151 aa  68.9  0.00000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5258  hypothetical protein  44.57 
 
 		 150 aa  68.2  0.00000000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.355958  normal  1 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7165  protein of unknown function DUF305  50 
 
 		 143 aa  68.6  0.00000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.277418  normal  0.663487 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5874  protein of unknown function DUF305  50 
 
 		 143 aa  67.4  0.00000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1097  protein of unknown function DUF305  41.1 
 
 		 223 aa  67  0.00000000007  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000215144  n/a   
 
 
-
 
NC_008758  Pnap_4562  hypothetical protein  53.12 
 
 		 91 aa  66.6  0.0000000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011986  Avi_9856  hypothetical protein  57.14 
 
 		 142 aa  66.2  0.0000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013731  Slin_6657  protein of unknown function DUF305  46.77 
 
 		 209 aa  65.9  0.0000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.50824 
 
 
-
 
NC_008758  Pnap_4535  hypothetical protein  51.56 
 
 		 98 aa  65.1  0.0000000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.858749  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2280  hypothetical protein  42.39 
 
 		 226 aa  63.2  0.000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2580  protein of unknown function DUF305  43.16 
 
 		 224 aa  62.4  0.000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1508  hypothetical protein  44.83 
 
 		 217 aa  62  0.000000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  decreased coverage  0.0000100839  normal  0.123657 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3044  protein of unknown function DUF305  56.6 
 
 		 230 aa  59.3  0.00000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.22024  normal  0.753211 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1571  conserved hypothetical protein (DUF305 domain protein)  42.86 
 
 		 206 aa  58.9  0.00000002  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1099  protein of unknown function DUF305  41.67 
 
 		 160 aa  59.3  0.00000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.115444  normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0815  hypothetical protein  40.66 
 
 		 207 aa  58.2  0.00000003  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013732  Slin_6903  protein of unknown function DUF305  32.46 
 
 		 194 aa  57.4  0.00000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.912049  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3772  hypothetical protein  35.71 
 
 		 100 aa  57.4  0.00000006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.697679  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4123  hypothetical protein  51.92 
 
 		 198 aa  57.8  0.00000006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2783  hypothetical protein  50 
 
 		 202 aa  57  0.00000008  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3974  hypothetical protein  40.62 
 
 		 271 aa  57  0.00000009  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0086  hypothetical protein  40.62 
 
 		 197 aa  56.6  0.0000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0121  hypothetical protein  48.15 
 
 		 211 aa  56.6  0.0000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.261528  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0357  protein of unknown function DUF305  47.27 
 
 		 208 aa  56.6  0.0000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013732  Slin_6904  protein of unknown function DUF305  35.16 
 
 		 237 aa  55.8  0.0000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.147564  normal  0.887388 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0200  protein of unknown function DUF305  42.37 
 
 		 243 aa  55.5  0.0000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013731  Slin_6656  protein of unknown function DUF305  45.61 
 
 		 197 aa  55.5  0.0000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.817107 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0147  hypothetical protein  49.02 
 
 		 202 aa  54.7  0.0000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.404622  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0156  hypothetical protein  49.02 
 
 		 202 aa  54.7  0.0000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.908882  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0137  hypothetical protein  49.02 
 
 		 202 aa  54.7  0.0000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0732771 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0736  hypothetical protein  39.06 
 
 		 270 aa  54.3  0.0000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0460895  hitchhiker  0.00701181 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4447  hypothetical protein  52 
 
 		 213 aa  53.9  0.0000006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.708243  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0139  protein of unknown function DUF305  37.3 
 
 		 237 aa  54.3  0.0000006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2836  hypothetical protein  48.33 
 
 		 215 aa  53.5  0.0000009  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.196211 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0132  protein of unknown function DUF305  40 
 
 		 192 aa  52.8  0.000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.857037  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2245  hypothetical protein  50 
 
 		 220 aa  52.8  0.000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.19318  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4568  hypothetical protein  49.12 
 
 		 231 aa  52.8  0.000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3655  hypothetical protein  35.59 
 
 		 221 aa  52.4  0.000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0071  hypothetical protein  47.17 
 
 		 136 aa  52.8  0.000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal  0.316359 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2368  hypothetical protein  33.33 
 
 		 188 aa  52.4  0.000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.838223  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4037  hypothetical protein  34.92 
 
 		 222 aa  51.6  0.000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0675936  hitchhiker  0.00542387 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4526  hypothetical protein  39.13 
 
 		 189 aa  51.6  0.000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.410166  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0639  putative secreted protein  40.68 
 
 		 191 aa  51.2  0.000005  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0590  hypothetical protein  44.07 
 
 		 208 aa  51.2  0.000005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5858  hypothetical protein  40.22 
 
 		 218 aa  50.8  0.000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009806  Krad_4586  hypothetical protein  43.33 
 
 		 265 aa  50.8  0.000005  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0885  protein of unknown function DUF305  44 
 
 		 203 aa  50.8  0.000006  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.309526 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1047  protein of unknown function DUF305  42.86 
 
 		 210 aa  50.8  0.000006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.109327 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3538  protein of unknown function DUF305  41.67 
 
 		 205 aa  50.4  0.000009  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.396776 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0891  hypothetical protein  45 
 
 		 229 aa  50.1  0.000009  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>