166 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bamb_6564 on replicon NC_008392
Organism: Burkholderia ambifaria AMMD



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008392  Bamb_6564  hypothetical protein  100 
 
 		 130 aa  261  2e-69  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6278  hypothetical protein  96.92 
 
 		 130 aa  222  1e-57  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00531992 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6148  hypothetical protein  73.85 
 
 		 127 aa  191  2e-48  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.137676  normal  0.19662 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1290  hypothetical protein  83.67 
 
 		 127 aa  173  8e-43  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.434421  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6541  hypothetical protein  83.67 
 
 		 127 aa  173  8e-43  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.249657  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5510  hypothetical protein  79.59 
 
 		 130 aa  163  8e-40  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.563471  normal  0.269299 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1876  hypothetical protein  67.83 
 
 		 141 aa  151  2.9999999999999998e-36  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.257011  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0406  hypothetical protein  73.47 
 
 		 141 aa  149  2e-35  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.1733  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1967  hypothetical protein  73.47 
 
 		 141 aa  148  2e-35  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.619841  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2045  hypothetical protein  68.29 
 
 		 132 aa  127  5.0000000000000004e-29  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.928225  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6075  protein of unknown function DUF305  54.26 
 
 		 137 aa  123  9e-28  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.69008  normal  0.152537 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2299  hypothetical protein  54.47 
 
 		 131 aa  119  9.999999999999999e-27  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.502645  normal  0.300694 
 
 
-
 
NC_010070  Bmul_6297  hypothetical protein  49.17 
 
 		 131 aa  117  3.9999999999999996e-26  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.21149  normal  0.389023 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1535  hypothetical protein  48.62 
 
 		 113 aa  96.7  9e-20  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.619429  normal  0.733742 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0506  protein of unknown function DUF305  46.73 
 
 		 119 aa  91.3  4e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0184859 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3895  hypothetical protein  50.52 
 
 		 134 aa  90.9  5e-18  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0926  hypothetical protein  52.75 
 
 		 117 aa  89.7  1e-17  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.984322  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0092  protein of unknown function DUF305  50 
 
 		 139 aa  88.6  2e-17  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.62579 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0461  protein of unknown function DUF305  50.56 
 
 		 119 aa  89.4  2e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.607138  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5806  hypothetical protein  53.66 
 
 		 122 aa  88.6  3e-17  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0401  hypothetical protein  46.39 
 
 		 126 aa  87.4  7e-17  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0681518 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0179  hypothetical protein  51.69 
 
 		 142 aa  86.7  9e-17  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0473864  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2536  hypothetical protein  46.88 
 
 		 133 aa  85.1  3e-16  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.608732  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3056  protein of unknown function DUF305  45.83 
 
 		 128 aa  84.7  4e-16  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4129  protein of unknown function DUF305  40.32 
 
 		 125 aa  84  6e-16  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.933838  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3242  hypothetical protein  50.62 
 
 		 134 aa  83.2  0.000000000000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5614  protein of unknown function DUF305  52.17 
 
 		 135 aa  82.4  0.000000000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2829  hypothetical protein  46.79 
 
 		 128 aa  82.4  0.000000000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.137612 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0997  protein of unknown function DUF305  46.74 
 
 		 148 aa  81.3  0.000000000000004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.495486  normal  0.061691 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3868  hypothetical protein  38.4 
 
 		 134 aa  79.7  0.00000000000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1985  hypothetical protein  48.15 
 
 		 128 aa  79  0.00000000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.448564  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2947  protein of unknown function DUF305  46.88 
 
 		 128 aa  79  0.00000000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0261  hypothetical protein  55.71 
 
 		 127 aa  79  0.00000000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.188703  normal  0.0101728 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2666  hypothetical protein  55.71 
 
 		 127 aa  79  0.00000000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.499995 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6259  hypothetical protein  57.81 
 
 		 164 aa  77.8  0.00000000000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.510981 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3796  hypothetical protein  42.24 
 
 		 151 aa  77  0.00000000000008  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0108  protein of unknown function DUF305  45.92 
 
 		 134 aa  76.3  0.0000000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.937647 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5736  protein of unknown function DUF305  59.68 
 
 		 132 aa  75.1  0.0000000000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.470482 
 
 
-
 
NC_008758  Pnap_4562  hypothetical protein  52.17 
 
 		 91 aa  74.3  0.0000000000005  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008758  Pnap_4535  hypothetical protein  50.72 
 
 		 98 aa  73.2  0.000000000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.858749  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1101  protein of unknown function DUF305  46.91 
 
 		 132 aa  71.6  0.000000000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.3981  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3856  protein of unknown function DUF305  41.82 
 
 		 158 aa  71.6  0.000000000004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.422416  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4933  protein of unknown function DUF305  41.82 
 
 		 158 aa  71.6  0.000000000004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.913389  normal  0.245188 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0541  hypothetical protein  52.78 
 
 		 120 aa  70.9  0.000000000006  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5398  hypothetical protein  54.69 
 
 		 152 aa  70.5  0.000000000007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5258  hypothetical protein  42.48 
 
 		 150 aa  69.3  0.00000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.355958  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1508  hypothetical protein  31.86 
 
 		 217 aa  68.6  0.00000000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  decreased coverage  0.0000100839  normal  0.123657 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3430  hypothetical protein  43.75 
 
 		 116 aa  67.4  0.00000000006  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013731  Slin_6657  protein of unknown function DUF305  38.55 
 
 		 209 aa  66.6  0.0000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.50824 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1517  hypothetical protein  47.14 
 
 		 263 aa  66.2  0.0000000001  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0547298  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0312  hypothetical protein  40.74 
 
 		 250 aa  65.9  0.0000000002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.153905  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1097  protein of unknown function DUF305  34.62 
 
 		 223 aa  65.9  0.0000000002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000215144  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3230  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  43.96 
 
 		 517 aa  65.1  0.0000000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.476229  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1338  hypothetical protein  50.77 
 
 		 152 aa  64.7  0.0000000004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.031335  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1836  hypothetical protein  45.56 
 
 		 246 aa  64.3  0.0000000005  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0521181  normal  0.479841 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0285  hypothetical protein  42.5 
 
 		 279 aa  62.4  0.000000002  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7165  protein of unknown function DUF305  46.3 
 
 		 143 aa  62  0.000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.277418  normal  0.663487 
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0071  hypothetical protein  39.74 
 
 		 136 aa  62.8  0.000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal  0.316359 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5874  protein of unknown function DUF305  46.3 
 
 		 143 aa  61.6  0.000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1571  conserved hypothetical protein (DUF305 domain protein)  50 
 
 		 206 aa  61.2  0.000000004  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1099  protein of unknown function DUF305  38.55 
 
 		 160 aa  58.9  0.00000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.115444  normal  1 
 
 
-
 
NC_011986  Avi_9856  hypothetical protein  51.85 
 
 		 142 aa  57.8  0.00000005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0815  hypothetical protein  41.94 
 
 		 207 aa  57.4  0.00000006  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013732  Slin_6903  protein of unknown function DUF305  32.35 
 
 		 194 aa  57  0.00000008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.912049  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3044  protein of unknown function DUF305  58.82 
 
 		 230 aa  57  0.00000008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.22024  normal  0.753211 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2580  protein of unknown function DUF305  45 
 
 		 224 aa  57  0.00000008  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1150  hypothetical protein  33.03 
 
 		 218 aa  56.2  0.0000002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0132  protein of unknown function DUF305  47.27 
 
 		 192 aa  55.8  0.0000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.857037  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3772  hypothetical protein  34.74 
 
 		 100 aa  55.5  0.0000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.697679  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2280  hypothetical protein  46.67 
 
 		 226 aa  55.1  0.0000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0121  hypothetical protein  36.78 
 
 		 211 aa  55.1  0.0000004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.261528  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_04960  hypothetical protein  44.12 
 
 		 232 aa  54.3  0.0000005  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3873  hypothetical protein  45.07 
 
 		 147 aa  53.9  0.0000007  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013731  Slin_6656  protein of unknown function DUF305  32.5 
 
 		 197 aa  53.5  0.000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.817107 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3032  protein of unknown function DUF305  52.83 
 
 		 206 aa  52.8  0.000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.709279 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4123  hypothetical protein  37.38 
 
 		 198 aa  52.4  0.000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3396  protein of unknown function DUF305  47.27 
 
 		 237 aa  51.6  0.000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.886047  normal  0.773197 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0305  hypothetical protein  42.86 
 
 		 192 aa  52  0.000003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1047  protein of unknown function DUF305  39.29 
 
 		 210 aa  51.6  0.000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.109327 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0139  protein of unknown function DUF305  45.1 
 
 		 237 aa  51.2  0.000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2783  hypothetical protein  50 
 
 		 202 aa  51.2  0.000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5858  hypothetical protein  37.31 
 
 		 218 aa  50.4  0.000007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013732  Slin_6904  protein of unknown function DUF305  33.71 
 
 		 237 aa  50.8  0.000007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.147564  normal  0.887388 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2581  hypothetical protein  28.7 
 
 		 236 aa  50.4  0.000008  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.405095 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2579  hypothetical protein  43.33 
 
 		 202 aa  50.4  0.000009  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0057  hypothetical protein  41.67 
 
 		 208 aa  49.7  0.00001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5320  hypothetical protein  40.62 
 
 		 225 aa  49.7  0.00001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5698  hypothetical protein  47.46 
 
 		 237 aa  49.7  0.00001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.472111  normal  0.587955 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5409  hypothetical protein  40.62 
 
 		 225 aa  49.7  0.00001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.180608  normal  0.175735 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3676  hypothetical protein  47.46 
 
 		 243 aa  50.1  0.00001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0963625  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4526  hypothetical protein  37.23 
 
 		 189 aa  50.1  0.00001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.410166  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5699  hypothetical protein  40.62 
 
 		 227 aa  49.7  0.00001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2836  hypothetical protein  46.77 
 
 		 215 aa  49.7  0.00001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.196211 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5311  hypothetical protein  47.46 
 
 		 237 aa  49.7  0.00001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.126804  normal  0.734032 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2051  protein of unknown function DUF305  48.33 
 
 		 171 aa  49.3  0.00002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_18400  hypothetical protein  42.19 
 
 		 227 aa  48.9  0.00002  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2595  protein of unknown function DUF305  43.4 
 
 		 217 aa  48.9  0.00002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.974704  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1033  protein of unknown function DUF305  27.83 
 
 		 234 aa  48.9  0.00002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.784993 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6516  protein of unknown function DUF305  28.16 
 
 		 218 aa  48.5  0.00003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.14254  normal  1 
 
 
-
 
NC_009806  Krad_4586  hypothetical protein  39.62 
 
 		 265 aa  48.5  0.00003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>