123 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_6656 on replicon NC_013731
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013731  Slin_6656  protein of unknown function DUF305  100 
 
 
197 aa  395  1e-109  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.817107 
 
 
-
 
NC_013732  Slin_6903  protein of unknown function DUF305  73.71 
 
 
194 aa  284  7e-76  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.912049  normal 
 
 
-
 
NC_013731  Slin_6657  protein of unknown function DUF305  35.9 
 
 
209 aa  98.2  7e-20  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.50824 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1508  hypothetical protein  31.88 
 
 
217 aa  92.8  3e-18  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  decreased coverage  0.0000100839  normal  0.123657 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6516  protein of unknown function DUF305  27.69 
 
 
218 aa  92.8  3e-18  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.14254  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1836  hypothetical protein  30.99 
 
 
246 aa  73.9  0.000000000002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0521181  normal  0.479841 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0312  hypothetical protein  31.18 
 
 
250 aa  72.8  0.000000000003  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.153905  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0285  hypothetical protein  29.82 
 
 
279 aa  71.6  0.000000000007  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013732  Slin_6904  protein of unknown function DUF305  31.85 
 
 
237 aa  70.1  0.00000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.147564  normal  0.887388 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0057  hypothetical protein  30.14 
 
 
208 aa  67.4  0.0000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1150  hypothetical protein  24.64 
 
 
218 aa  65.9  0.0000000004  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0815  hypothetical protein  29.71 
 
 
207 aa  65.9  0.0000000004  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3032  protein of unknown function DUF305  32 
 
 
206 aa  63.2  0.000000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.709279 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6259  hypothetical protein  29.5 
 
 
164 aa  61.6  0.000000008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.510981 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4189  hypothetical protein  31.16 
 
 
195 aa  61.2  0.000000009  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.314897  normal  0.043987 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3868  hypothetical protein  42.03 
 
 
134 aa  60.8  0.00000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008758  Pnap_4535  hypothetical protein  44.62 
 
 
98 aa  60.8  0.00000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.858749  normal 
 
 
-
 
NC_008758  Pnap_4562  hypothetical protein  44.62 
 
 
91 aa  61.2  0.00000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1517  hypothetical protein  28.39 
 
 
263 aa  60.5  0.00000001  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0547298  normal 
 
 
-
 
NC_009806  Krad_4586  hypothetical protein  26.32 
 
 
265 aa  60.5  0.00000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2580  protein of unknown function DUF305  26 
 
 
224 aa  60.5  0.00000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0092  protein of unknown function DUF305  36.78 
 
 
139 aa  60.5  0.00000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.62579 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0132  protein of unknown function DUF305  30.43 
 
 
192 aa  59.3  0.00000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.857037  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0261  hypothetical protein  35.56 
 
 
127 aa  58.5  0.00000006  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.188703  normal  0.0101728 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2666  hypothetical protein  35.56 
 
 
127 aa  58.5  0.00000006  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.499995 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3796  hypothetical protein  30.36 
 
 
151 aa  57.4  0.0000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2111  hypothetical protein  23.32 
 
 
223 aa  57.8  0.0000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.0727975 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1571  conserved hypothetical protein (DUF305 domain protein)  27.5 
 
 
206 aa  57.8  0.0000001  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5740  hypothetical protein  29.45 
 
 
199 aa  56.6  0.0000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2214  protein of unknown function DUF305  29.66 
 
 
207 aa  56.6  0.0000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.702552  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0305  hypothetical protein  27.27 
 
 
192 aa  57  0.0000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1876  hypothetical protein  32.5 
 
 
141 aa  56.2  0.0000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.257011  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4933  protein of unknown function DUF305  37.04 
 
 
158 aa  56.2  0.0000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.913389  normal  0.245188 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3856  protein of unknown function DUF305  37.04 
 
 
158 aa  56.2  0.0000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.422416  normal 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0406  hypothetical protein  32.5 
 
 
141 aa  55.8  0.0000004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.1733  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1290  hypothetical protein  38.24 
 
 
127 aa  55.8  0.0000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.434421  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6541  hypothetical protein  38.24 
 
 
127 aa  55.8  0.0000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.249657  normal 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1967  hypothetical protein  32.5 
 
 
141 aa  55.5  0.0000005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.619841  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1394  hypothetical protein  27.74 
 
 
212 aa  55.5  0.0000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.182892 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3538  protein of unknown function DUF305  22.88 
 
 
205 aa  55.5  0.0000005  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.396776 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0885  protein of unknown function DUF305  26.49 
 
 
203 aa  55.1  0.0000007  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.309526 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4526  hypothetical protein  28.03 
 
 
189 aa  54.7  0.0000008  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.410166  normal 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5510  hypothetical protein  36.76 
 
 
130 aa  54.7  0.0000008  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.563471  normal  0.269299 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5806  hypothetical protein  45.61 
 
 
122 aa  54.7  0.0000009  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5398  hypothetical protein  42.59 
 
 
152 aa  54.3  0.000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3980  hypothetical protein  26 
 
 
207 aa  54.3  0.000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6148  hypothetical protein  36.76 
 
 
127 aa  54.3  0.000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.137676  normal  0.19662 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2045  hypothetical protein  40 
 
 
132 aa  54.3  0.000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.928225  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2579  hypothetical protein  26.32 
 
 
202 aa  54.7  0.000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2299  hypothetical protein  43.1 
 
 
131 aa  53.5  0.000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.502645  normal  0.300694 
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4455  hypothetical protein  23.81 
 
 
229 aa  53.9  0.000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.248989  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6075  protein of unknown function DUF305  43.1 
 
 
137 aa  53.5  0.000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.69008  normal  0.152537 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4415  protein of unknown function DUF305  28.67 
 
 
202 aa  53.1  0.000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.126861  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1985  hypothetical protein  34.21 
 
 
128 aa  53.1  0.000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.448564  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0121  hypothetical protein  22.6 
 
 
211 aa  52.8  0.000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.261528  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6146  putative secreted protein  25.55 
 
 
207 aa  52.8  0.000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.666575  normal  0.0345137 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6564  hypothetical protein  32.5 
 
 
130 aa  53.1  0.000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1097  protein of unknown function DUF305  27.15 
 
 
223 aa  52.8  0.000003  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000215144  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0461  protein of unknown function DUF305  30 
 
 
119 aa  53.1  0.000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.607138  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6278  hypothetical protein  31.25 
 
 
130 aa  52  0.000005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00531992 
 
 
-
 
NC_010070  Bmul_6297  hypothetical protein  36.67 
 
 
131 aa  52  0.000006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.21149  normal  0.389023 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4129  protein of unknown function DUF305  34.52 
 
 
125 aa  52  0.000006  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.933838  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0506  protein of unknown function DUF305  29.52 
 
 
119 aa  52  0.000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.0184859 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1810  protein of unknown function DUF305  26 
 
 
239 aa  52  0.000006  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5614  protein of unknown function DUF305  33.33 
 
 
135 aa  51.6  0.000007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5736  protein of unknown function DUF305  30 
 
 
132 aa  51.6  0.000008  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.470482 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0174  hypothetical protein  24.26 
 
 
205 aa  50.8  0.00001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3242  hypothetical protein  28.57 
 
 
134 aa  50.8  0.00001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2254  hypothetical protein  25.35 
 
 
223 aa  50.1  0.00002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0831973 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2536  hypothetical protein  33.33 
 
 
133 aa  50.1  0.00002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.608732  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0179  hypothetical protein  36.92 
 
 
142 aa  50.4  0.00002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0473864  normal 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2567  hypothetical protein  25.17 
 
 
206 aa  49.7  0.00003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4461  hypothetical protein  28.12 
 
 
213 aa  49.7  0.00003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008538  Arth_4292  hypothetical protein  28.12 
 
 
213 aa  49.7  0.00003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008539  Arth_4192  hypothetical protein  28.12 
 
 
213 aa  49.7  0.00003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0401  hypothetical protein  40.35 
 
 
126 aa  49.7  0.00003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.0681518 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1143  protein of unknown function DUF305  24.83 
 
 
200 aa  49.7  0.00003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_18400  hypothetical protein  28.57 
 
 
227 aa  49.7  0.00003  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0926  hypothetical protein  41.67 
 
 
117 aa  49.3  0.00004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.984322  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0541  hypothetical protein  33.94 
 
 
120 aa  48.1  0.00007  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0997  protein of unknown function DUF305  35.29 
 
 
148 aa  48.1  0.00008  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.495486  normal  0.061691 
 
 
-
 
NC_011881  Achl_4525  protein of unknown function DUF305  24.26 
 
 
280 aa  47.8  0.00009  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.137283 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2280  hypothetical protein  25 
 
 
226 aa  47.4  0.0001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0086  hypothetical protein  23.94 
 
 
197 aa  47.8  0.0001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0357  protein of unknown function DUF305  23.53 
 
 
208 aa  47.4  0.0001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4244  protein of unknown function DUF305  25 
 
 
217 aa  47.8  0.0001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.827618  n/a   
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4487  hypothetical protein  25.93 
 
 
209 aa  47  0.0002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.161376  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5258  hypothetical protein  30.25 
 
 
150 aa  47  0.0002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.355958  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1033  protein of unknown function DUF305  22.58 
 
 
234 aa  47  0.0002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.784993 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0139  protein of unknown function DUF305  24.16 
 
 
237 aa  46.6  0.0002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1610  hypothetical protein  22.16 
 
 
219 aa  46.6  0.0003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.506361  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3895  hypothetical protein  35.71 
 
 
134 aa  46.2  0.0003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2245  hypothetical protein  26.99 
 
 
220 aa  46.2  0.0003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.19318  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2783  hypothetical protein  24.03 
 
 
202 aa  46.6  0.0003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1535  hypothetical protein  25.69 
 
 
113 aa  45.8  0.0004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.619429  normal  0.733742 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1437  hypothetical protein  28.99 
 
 
228 aa  45.1  0.0006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.115856  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1455  hypothetical protein  28.99 
 
 
228 aa  45.1  0.0006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.502246 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3672  protein of unknown function DUF305  24.34 
 
 
210 aa  45.1  0.0006  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3430  hypothetical protein  30.95 
 
 
116 aa  45.1  0.0006  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1047  protein of unknown function DUF305  31.67 
 
 
210 aa  44.7  0.0008  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.109327 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>