98 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rsph17025_3772 on replicon NC_009429
Organism: Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009429  Rsph17025_3772  hypothetical protein  100 
 
 		 100 aa  198  1.9999999999999998e-50  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.697679  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4129  protein of unknown function DUF305  42.57 
 
 		 125 aa  82  0.000000000000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.933838  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2536  hypothetical protein  41.49 
 
 		 133 aa  76.6  0.00000000000009  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.608732  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3868  hypothetical protein  41.35 
 
 		 134 aa  75.5  0.0000000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0179  hypothetical protein  42.11 
 
 		 142 aa  75.1  0.0000000000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0473864  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0926  hypothetical protein  38.14 
 
 		 117 aa  74.7  0.0000000000004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.984322  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5614  protein of unknown function DUF305  42.53 
 
 		 135 aa  73.9  0.0000000000007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0997  protein of unknown function DUF305  46.77 
 
 		 148 aa  70.1  0.000000000009  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.495486  normal  0.061691 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0461  protein of unknown function DUF305  42.86 
 
 		 119 aa  68.9  0.00000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.607138  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0506  protein of unknown function DUF305  44.05 
 
 		 119 aa  68.9  0.00000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0184859 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3430  hypothetical protein  38.3 
 
 		 116 aa  68.6  0.00000000003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1338  hypothetical protein  46.15 
 
 		 152 aa  68.6  0.00000000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.031335  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1535  hypothetical protein  36.46 
 
 		 113 aa  68.2  0.00000000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.619429  normal  0.733742 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0401  hypothetical protein  39.22 
 
 		 126 aa  68.2  0.00000000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0681518 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3230  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  37.5 
 
 		 517 aa  67.4  0.00000000006  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.476229  n/a   
 
 
-
 
NC_011986  Avi_9856  hypothetical protein  48.33 
 
 		 142 aa  67.4  0.00000000007  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0285  hypothetical protein  36.56 
 
 		 279 aa  67  0.00000000008  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5806  hypothetical protein  38.78 
 
 		 122 aa  66.2  0.0000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1099  protein of unknown function DUF305  37.04 
 
 		 160 aa  65.1  0.0000000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.115444  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0541  hypothetical protein  39.47 
 
 		 120 aa  64.7  0.0000000004  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3242  hypothetical protein  37.63 
 
 		 134 aa  64.7  0.0000000005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3895  hypothetical protein  39.22 
 
 		 134 aa  63.2  0.000000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0312  hypothetical protein  35.44 
 
 		 250 aa  63.2  0.000000001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.153905  normal  1 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7165  protein of unknown function DUF305  41.67 
 
 		 143 aa  60.5  0.000000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.277418  normal  0.663487 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6564  hypothetical protein  34.74 
 
 		 130 aa  59.7  0.00000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5874  protein of unknown function DUF305  41.67 
 
 		 143 aa  60.1  0.00000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1508  hypothetical protein  43.06 
 
 		 217 aa  58.9  0.00000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  decreased coverage  0.0000100839  normal  0.123657 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1836  hypothetical protein  36.71 
 
 		 246 aa  59.3  0.00000002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0521181  normal  0.479841 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6278  hypothetical protein  33.68 
 
 		 130 aa  58.2  0.00000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00531992 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5736  protein of unknown function DUF305  42.67 
 
 		 132 aa  58.2  0.00000004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.470482 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6148  hypothetical protein  34.94 
 
 		 127 aa  58.2  0.00000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.137676  normal  0.19662 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3873  hypothetical protein  37.35 
 
 		 147 aa  57.8  0.00000004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0071  hypothetical protein  38.75 
 
 		 136 aa  57.8  0.00000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal  0.316359 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2045  hypothetical protein  37.04 
 
 		 132 aa  57.4  0.00000007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.928225  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1967  hypothetical protein  37.35 
 
 		 141 aa  57  0.00000009  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.619841  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0092  protein of unknown function DUF305  33.33 
 
 		 139 aa  57  0.00000009  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.62579 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6075  protein of unknown function DUF305  38.37 
 
 		 137 aa  57  0.00000009  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.69008  normal  0.152537 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1876  hypothetical protein  37.35 
 
 		 141 aa  56.2  0.0000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.257011  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0406  hypothetical protein  37.35 
 
 		 141 aa  56.6  0.0000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.1733  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2666  hypothetical protein  41.67 
 
 		 127 aa  56.6  0.0000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.499995 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0261  hypothetical protein  41.67 
 
 		 127 aa  56.6  0.0000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.188703  normal  0.0101728 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6541  hypothetical protein  32.29 
 
 		 127 aa  55.8  0.0000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.249657  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1517  hypothetical protein  33.98 
 
 		 263 aa  55.8  0.0000002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0547298  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1290  hypothetical protein  32.29 
 
 		 127 aa  55.8  0.0000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.434421  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2299  hypothetical protein  36.36 
 
 		 131 aa  55.5  0.0000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.502645  normal  0.300694 
 
 
-
 
NC_010070  Bmul_6297  hypothetical protein  31.18 
 
 		 131 aa  54.7  0.0000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.21149  normal  0.389023 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5510  hypothetical protein  33.73 
 
 		 130 aa  54.7  0.0000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.563471  normal  0.269299 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5258  hypothetical protein  39.13 
 
 		 150 aa  54.7  0.0000004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.355958  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1101  protein of unknown function DUF305  31.25 
 
 		 132 aa  54.3  0.0000005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.3981  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1097  protein of unknown function DUF305  32.1 
 
 		 223 aa  53.1  0.000001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000215144  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1985  hypothetical protein  37.29 
 
 		 128 aa  52.8  0.000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.448564  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2575  hypothetical protein  39.39 
 
 		 123 aa  52.8  0.000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0843755  normal  0.521427 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0815  hypothetical protein  36.21 
 
 		 207 aa  52.8  0.000002  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5398  hypothetical protein  37.65 
 
 		 152 aa  52  0.000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2316  hypothetical protein  42.37 
 
 		 130 aa  50.4  0.000007  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.865879 
 
 
-
 
NC_013731  Slin_6657  protein of unknown function DUF305  41.07 
 
 		 209 aa  50.4  0.000007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.50824 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1027  protein of unknown function DUF305  37.31 
 
 		 123 aa  50.1  0.000009  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013732  Slin_6903  protein of unknown function DUF305  37.8 
 
 		 194 aa  49.7  0.00001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.912049  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0108  protein of unknown function DUF305  29.91 
 
 		 134 aa  50.1  0.00001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.937647 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2947  protein of unknown function DUF305  29.76 
 
 		 128 aa  49.7  0.00001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0305  hypothetical protein  35.48 
 
 		 192 aa  49.7  0.00002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3056  protein of unknown function DUF305  32.5 
 
 		 128 aa  49.3  0.00002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1571  conserved hypothetical protein (DUF305 domain protein)  36.62 
 
 		 206 aa  48.9  0.00002  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2567  hypothetical protein  44.9 
 
 		 206 aa  48.9  0.00002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3796  hypothetical protein  36.25 
 
 		 151 aa  48.5  0.00003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2829  hypothetical protein  32.5 
 
 		 128 aa  48.5  0.00003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.137612 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0086  hypothetical protein  36.84 
 
 		 197 aa  47.8  0.00004  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2580  protein of unknown function DUF305  40.38 
 
 		 224 aa  47.8  0.00005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0132  protein of unknown function DUF305  34.94 
 
 		 192 aa  47.4  0.00006  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.857037  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0121  hypothetical protein  34.62 
 
 		 211 aa  46.6  0.0001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.261528  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3044  protein of unknown function DUF305  38.6 
 
 		 230 aa  45.8  0.0002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.22024  normal  0.753211 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2783  hypothetical protein  39.62 
 
 		 202 aa  45.4  0.0002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6516  protein of unknown function DUF305  28.3 
 
 		 218 aa  45.1  0.0004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.14254  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0174  hypothetical protein  32.39 
 
 		 205 aa  44.7  0.0004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4189  hypothetical protein  33.87 
 
 		 195 aa  44.7  0.0004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.314897  normal  0.043987 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6259  hypothetical protein  32.91 
 
 		 164 aa  43.9  0.0007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.510981 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2305  hypothetical protein  38.71 
 
 		 210 aa  43.1  0.001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.775317  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2280  hypothetical protein  38.6 
 
 		 226 aa  43.5  0.001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0706  hypothetical protein  31.48 
 
 		 203 aa  42.4  0.002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5736  hypothetical protein  37.7 
 
 		 227 aa  42.7  0.002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2368  hypothetical protein  38.46 
 
 		 188 aa  42.7  0.002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.838223  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3672  protein of unknown function DUF305  40 
 
 		 210 aa  42.7  0.002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6146  putative secreted protein  31.03 
 
 		 207 aa  42.7  0.002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.666575  normal  0.0345137 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3538  protein of unknown function DUF305  31.67 
 
 		 205 aa  42  0.003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.396776 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1150  hypothetical protein  36.67 
 
 		 218 aa  42  0.003  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013731  Slin_6656  protein of unknown function DUF305  32.94 
 
 		 197 aa  42  0.003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.817107 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4933  protein of unknown function DUF305  34.48 
 
 		 158 aa  41.6  0.003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.913389  normal  0.245188 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3856  protein of unknown function DUF305  34.48 
 
 		 158 aa  41.6  0.003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.422416  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2581  hypothetical protein  29.21 
 
 		 236 aa  41.6  0.003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.405095 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4526  hypothetical protein  36.92 
 
 		 189 aa  41.2  0.005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.410166  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1033  protein of unknown function DUF305  27.27 
 
 		 234 aa  40.8  0.005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.784993 
 
 
-
 
NC_007595  Synpcc7942_B2645  hypothetical protein  34.33 
 
 		 207 aa  40.8  0.006  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1610  hypothetical protein  33.96 
 
 		 219 aa  40.8  0.006  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.506361  normal  1 
 
 
-
 
NC_009806  Krad_4586  hypothetical protein  34.43 
 
 		 265 aa  40.8  0.006  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1810  protein of unknown function DUF305  28.74 
 
 		 239 aa  40.4  0.007  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4925  hypothetical protein  35.71 
 
 		 147 aa  40.4  0.007  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.455285  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0057  hypothetical protein  30.16 
 
 		 208 aa  40.4  0.008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4123  hypothetical protein  32.73 
 
 		 198 aa  40.4  0.009  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>