84 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smed_4925 on replicon NC_009620
Organism: Sinorhizobium medicae WSM419



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009620  Smed_4925  hypothetical protein  100 
 
 		 147 aa  297  3e-80  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.455285  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2051  protein of unknown function DUF305  59.71 
 
 		 171 aa  175  2e-43  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1322  hypothetical protein  55.32 
 
 		 166 aa  171  2.9999999999999996e-42  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.927633  normal  0.338762 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2287  hypothetical protein  55.32 
 
 		 151 aa  171  3.9999999999999995e-42  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.000356026  hitchhiker  0.00039069 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3245  hypothetical protein  55.32 
 
 		 167 aa  166  7e-41  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3896  hypothetical protein  54.61 
 
 		 167 aa  164  2.9999999999999998e-40  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2420  hypothetical protein  55.17 
 
 		 147 aa  160  8.000000000000001e-39  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.692364 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4811  hypothetical protein  50.35 
 
 		 161 aa  157  6e-38  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.405374 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4398  hypothetical protein  41.78 
 
 		 157 aa  126  1.0000000000000001e-28  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.271713  normal  0.854107 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3077  hypothetical protein  42.14 
 
 		 164 aa  118  1.9999999999999998e-26  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013732  Slin_6892  protein of unknown function DUF305  39.58 
 
 		 175 aa  114  6e-25  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013732  Slin_6962  protein of unknown function DUF305  37.76 
 
 		 161 aa  107  5e-23  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.211177  normal  0.0771819 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11708  hypothetical protein  36.81 
 
 		 163 aa  103  1e-21  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013731  Slin_6646  protein of unknown function DUF305  41.38 
 
 		 170 aa  100  8e-21  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.350625  normal  0.51653 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1942  hypothetical protein  38.03 
 
 		 170 aa  99.4  2e-20  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11363  hypothetical protein  36.62 
 
 		 161 aa  98.6  2e-20  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1589  hypothetical protein  34.29 
 
 		 161 aa  95.5  2e-19  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  decreased coverage  0.000000759319  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0010  protein of unknown function DUF305  33.8 
 
 		 173 aa  93.6  8e-19  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0695  hypothetical protein  34.29 
 
 		 161 aa  93.2  1e-18  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  unclonable  0.000000975548  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0712  hypothetical protein  35 
 
 		 158 aa  92.8  2e-18  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.118157 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3677  hypothetical protein  34.04 
 
 		 297 aa  90.5  6e-18  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.160508 
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3594  hypothetical protein  34.51 
 
 		 278 aa  90.5  7e-18  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0376172  normal  0.29662 
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_3932  hypothetical protein  34.51 
 
 		 278 aa  90.5  7e-18  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.609829  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0359  protein of unknown function DUF305  33.33 
 
 		 178 aa  87.4  6e-17  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1170  protein of unknown function DUF305  32.12 
 
 		 148 aa  87  7e-17  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4663  hypothetical protein  36.94 
 
 		 118 aa  79  0.00000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000351024 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2305  hypothetical protein  30.56 
 
 		 210 aa  75.5  0.0000000000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.775317  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00407  hypothetical protein  40.4 
 
 		 137 aa  75.5  0.0000000000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1088  hypothetical protein  32.64 
 
 		 185 aa  75.9  0.0000000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0287  protein of unknown function DUF305  30.71 
 
 		 201 aa  73.9  0.0000000000007  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.087537 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3242  hypothetical protein  39.76 
 
 		 134 aa  58.9  0.00000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0506  protein of unknown function DUF305  51.79 
 
 		 119 aa  54.7  0.0000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0184859 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0461  protein of unknown function DUF305  41.86 
 
 		 119 aa  52.8  0.000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.607138  normal  1 
 
 
-
 
NC_010070  Bmul_6297  hypothetical protein  44.78 
 
 		 131 aa  53.1  0.000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.21149  normal  0.389023 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3895  hypothetical protein  48.33 
 
 		 134 aa  52.8  0.000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1535  hypothetical protein  35.29 
 
 		 113 aa  51.2  0.000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.619429  normal  0.733742 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4129  protein of unknown function DUF305  41.07 
 
 		 125 aa  50.8  0.000007  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.933838  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5614  protein of unknown function DUF305  41.38 
 
 		 135 aa  48.9  0.00002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3868  hypothetical protein  47.17 
 
 		 134 aa  48.9  0.00002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2045  hypothetical protein  44.78 
 
 		 132 aa  48.5  0.00003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.928225  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0926  hypothetical protein  41.94 
 
 		 117 aa  48.5  0.00003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.984322  normal  1 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2567  hypothetical protein  48 
 
 		 206 aa  48.1  0.00004  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0108  protein of unknown function DUF305  48.15 
 
 		 134 aa  48.1  0.00004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.937647 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3230  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  44.9 
 
 		 517 aa  47.8  0.00005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.476229  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3056  protein of unknown function DUF305  50 
 
 		 128 aa  47.8  0.00005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2829  hypothetical protein  50 
 
 		 128 aa  47.8  0.00005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.137612 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3430  hypothetical protein  45.45 
 
 		 116 aa  47.8  0.00006  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2783  hypothetical protein  46.43 
 
 		 202 aa  47  0.00009  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1101  protein of unknown function DUF305  47.17 
 
 		 132 aa  46.6  0.0001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.3981  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2947  protein of unknown function DUF305  49.02 
 
 		 128 aa  46.6  0.0001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2536  hypothetical protein  37.5 
 
 		 133 aa  46.6  0.0001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.608732  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0997  protein of unknown function DUF305  39.62 
 
 		 148 aa  45.8  0.0002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.495486  normal  0.061691 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3538  protein of unknown function DUF305  46.43 
 
 		 205 aa  45.1  0.0003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.396776 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2368  hypothetical protein  42 
 
 		 188 aa  44.3  0.0005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.838223  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1097  protein of unknown function DUF305  36.84 
 
 		 223 aa  44.3  0.0005  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000215144  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3676  hypothetical protein  41.51 
 
 		 243 aa  43.9  0.0007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0963625  normal  1 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5698  hypothetical protein  41.51 
 
 		 237 aa  43.9  0.0007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.472111  normal  0.587955 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5311  hypothetical protein  41.51 
 
 		 237 aa  43.9  0.0007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.126804  normal  0.734032 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2245  hypothetical protein  35.44 
 
 		 220 aa  42.7  0.001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.19318  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2280  hypothetical protein  35.71 
 
 		 226 aa  43.5  0.001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2580  protein of unknown function DUF305  35.71 
 
 		 224 aa  43.5  0.001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0121  hypothetical protein  41.07 
 
 		 211 aa  43.1  0.001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.261528  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2579  hypothetical protein  41.07 
 
 		 202 aa  42.4  0.002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4123  hypothetical protein  39.29 
 
 		 198 aa  42.7  0.002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3032  protein of unknown function DUF305  43.4 
 
 		 206 aa  42.7  0.002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.709279 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0057  hypothetical protein  41.07 
 
 		 208 aa  42  0.003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0179  hypothetical protein  35.71 
 
 		 142 aa  42  0.003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0473864  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1876  hypothetical protein  42.62 
 
 		 141 aa  41.2  0.004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.257011  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4244  protein of unknown function DUF305  35.09 
 
 		 217 aa  41.6  0.004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.827618  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1338  hypothetical protein  42.86 
 
 		 152 aa  41.6  0.004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.031335  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0315  hypothetical protein  45.1 
 
 		 213 aa  41.6  0.004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5806  hypothetical protein  40 
 
 		 122 aa  41.2  0.004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0147  hypothetical protein  37.31 
 
 		 202 aa  41.2  0.005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.404622  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0156  hypothetical protein  37.31 
 
 		 202 aa  41.2  0.005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.908882  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1810  protein of unknown function DUF305  30.14 
 
 		 257 aa  41.2  0.005  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.117773  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0137  hypothetical protein  37.31 
 
 		 202 aa  40.8  0.006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0732771 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3672  protein of unknown function DUF305  43.64 
 
 		 210 aa  40.8  0.006  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4447  hypothetical protein  40.38 
 
 		 213 aa  40.8  0.006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.708243  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2595  protein of unknown function DUF305  35.09 
 
 		 217 aa  40.8  0.006  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.974704  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1836  hypothetical protein  39.66 
 
 		 246 aa  40.8  0.007  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0521181  normal  0.479841 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3772  hypothetical protein  35.85 
 
 		 100 aa  40.4  0.007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.697679  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1967  hypothetical protein  42.62 
 
 		 141 aa  40.4  0.008  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.619841  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0406  hypothetical protein  42.62 
 
 		 141 aa  40  0.009  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.1733  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0541  hypothetical protein  42.59 
 
 		 120 aa  40  0.01  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>