53 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Meso_1088 on replicon NC_008254
Organism: Chelativorans sp. BNC1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008254  Meso_1088  hypothetical protein  100 
 
 		 185 aa  379  1e-104  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2305  hypothetical protein  69.73 
 
 		 210 aa  252  3e-66  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.775317  normal  1 
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_3932  hypothetical protein  47.8 
 
 		 278 aa  144  5e-34  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.609829  n/a   
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3594  hypothetical protein  47.8 
 
 		 278 aa  144  5e-34  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0376172  normal  0.29662 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0010  protein of unknown function DUF305  49.01 
 
 		 173 aa  140  9.999999999999999e-33  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3677  hypothetical protein  45.27 
 
 		 297 aa  134  9.999999999999999e-31  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.160508 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1589  hypothetical protein  44.37 
 
 		 161 aa  127  1.0000000000000001e-28  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  decreased coverage  0.000000759319  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0287  protein of unknown function DUF305  42.77 
 
 		 201 aa  127  1.0000000000000001e-28  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.087537 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0712  hypothetical protein  43.23 
 
 		 158 aa  127  1.0000000000000001e-28  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.118157 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0359  protein of unknown function DUF305  45.75 
 
 		 178 aa  125  3e-28  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0695  hypothetical protein  42.25 
 
 		 161 aa  120  9.999999999999999e-27  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  unclonable  0.000000975548  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1170  protein of unknown function DUF305  46.1 
 
 		 148 aa  117  9.999999999999999e-26  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013732  Slin_6962  protein of unknown function DUF305  42.86 
 
 		 161 aa  116  1.9999999999999998e-25  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.211177  normal  0.0771819 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1942  hypothetical protein  39.41 
 
 		 170 aa  115  3e-25  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00407  hypothetical protein  44.72 
 
 		 137 aa  107  1e-22  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11708  hypothetical protein  38.12 
 
 		 163 aa  100  1e-20  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11363  hypothetical protein  34.42 
 
 		 161 aa  97.8  7e-20  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4398  hypothetical protein  36.13 
 
 		 157 aa  92  4e-18  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.271713  normal  0.854107 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2420  hypothetical protein  36.11 
 
 		 147 aa  80.5  0.00000000000001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.692364 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2051  protein of unknown function DUF305  30.72 
 
 		 171 aa  79.7  0.00000000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3077  hypothetical protein  32.64 
 
 		 164 aa  79  0.00000000000004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013731  Slin_6646  protein of unknown function DUF305  33.33 
 
 		 170 aa  73.6  0.000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.350625  normal  0.51653 
 
 
-
 
NC_013732  Slin_6892  protein of unknown function DUF305  29.86 
 
 		 175 aa  72.4  0.000000000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4811  hypothetical protein  33.82 
 
 		 161 aa  72  0.000000000004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.405374 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3245  hypothetical protein  30.56 
 
 		 167 aa  70.9  0.00000000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4663  hypothetical protein  38.83 
 
 		 118 aa  67.4  0.0000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000351024 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3896  hypothetical protein  31.62 
 
 		 167 aa  65.1  0.0000000005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4925  hypothetical protein  32.64 
 
 		 147 aa  63.9  0.000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.455285  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1322  hypothetical protein  30 
 
 		 166 aa  63.5  0.000000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.927633  normal  0.338762 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2287  hypothetical protein  30 
 
 		 151 aa  63.5  0.000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.000356026  hitchhiker  0.00039069 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3895  hypothetical protein  32.82 
 
 		 134 aa  55.8  0.0000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0121  hypothetical protein  46.67 
 
 		 211 aa  53.9  0.000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.261528  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0926  hypothetical protein  51.85 
 
 		 117 aa  53.5  0.000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.984322  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1535  hypothetical protein  43.42 
 
 		 113 aa  52.4  0.000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.619429  normal  0.733742 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3242  hypothetical protein  50.94 
 
 		 134 aa  49.3  0.00003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2579  hypothetical protein  45.76 
 
 		 202 aa  46.2  0.0003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3230  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  42.59 
 
 		 517 aa  45.4  0.0004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.476229  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3868  hypothetical protein  43.4 
 
 		 134 aa  44.7  0.0009  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2580  protein of unknown function DUF305  37.36 
 
 		 224 aa  44.3  0.001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1097  protein of unknown function DUF305  34.55 
 
 		 223 aa  43.9  0.001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000215144  n/a   
 
 
-
 
NC_009806  Krad_4586  hypothetical protein  28.05 
 
 		 265 aa  43.1  0.002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2567  hypothetical protein  48 
 
 		 206 aa  43.1  0.002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2829  hypothetical protein  38.71 
 
 		 128 aa  43.1  0.003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.137612 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3056  protein of unknown function DUF305  24.03 
 
 		 128 aa  42.4  0.004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3873  hypothetical protein  43.64 
 
 		 147 aa  42.4  0.004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2947  protein of unknown function DUF305  40.32 
 
 		 128 aa  42  0.005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0541  hypothetical protein  47.06 
 
 		 120 aa  41.6  0.006  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1338  hypothetical protein  45.45 
 
 		 152 aa  41.6  0.006  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.031335  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3044  protein of unknown function DUF305  32.14 
 
 		 230 aa  41.6  0.006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.22024  normal  0.753211 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5806  hypothetical protein  43.64 
 
 		 122 aa  41.6  0.007  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0092  protein of unknown function DUF305  36.07 
 
 		 139 aa  40.8  0.01  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.62579 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5736  protein of unknown function DUF305  44.12 
 
 		 132 aa  41.2  0.01  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.470482 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4526  hypothetical protein  38.36 
 
 		 189 aa  40.8  0.01  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.410166  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>