82 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmet_2287 on replicon NC_007973
Organism: Cupriavidus metallidurans CH34



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008782  Ajs_1322  hypothetical protein  100 
 
 		 166 aa  313  5e-85  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.927633  normal  0.338762 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2287  hypothetical protein  100 
 
 		 151 aa  312  9.999999999999999e-85  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.000356026  hitchhiker  0.00039069 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3896  hypothetical protein  79.33 
 
 		 167 aa  245  2e-64  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3245  hypothetical protein  71.15 
 
 		 167 aa  230  6e-60  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4811  hypothetical protein  65.99 
 
 		 161 aa  204  4e-52  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.405374 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2051  protein of unknown function DUF305  66.44 
 
 		 171 aa  195  2.0000000000000003e-49  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4925  hypothetical protein  55.32 
 
 		 147 aa  153  8e-37  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.455285  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2420  hypothetical protein  52.82 
 
 		 147 aa  151  4e-36  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.692364 
 
 
-
 
NC_013732  Slin_6892  protein of unknown function DUF305  40.41 
 
 		 175 aa  108  2.0000000000000002e-23  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3077  hypothetical protein  36.43 
 
 		 164 aa  107  4.0000000000000004e-23  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4398  hypothetical protein  38.93 
 
 		 157 aa  107  7.000000000000001e-23  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.271713  normal  0.854107 
 
 
-
 
NC_013731  Slin_6646  protein of unknown function DUF305  41.96 
 
 		 170 aa  100  6e-21  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.350625  normal  0.51653 
 
 
-
 
NC_013732  Slin_6962  protein of unknown function DUF305  34.97 
 
 		 161 aa  95.5  2e-19  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.211177  normal  0.0771819 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0287  protein of unknown function DUF305  38.69 
 
 		 201 aa  89.4  2e-17  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.087537 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0359  protein of unknown function DUF305  34.31 
 
 		 178 aa  83.6  0.000000000000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0712  hypothetical protein  31.54 
 
 		 158 aa  82  0.000000000000003  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.118157 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1589  hypothetical protein  31.72 
 
 		 161 aa  80.9  0.000000000000006  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  decreased coverage  0.000000759319  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11708  hypothetical protein  31.79 
 
 		 163 aa  80.5  0.000000000000007  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0010  protein of unknown function DUF305  33.78 
 
 		 173 aa  79  0.00000000000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0695  hypothetical protein  31.51 
 
 		 161 aa  79  0.00000000000002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  unclonable  0.000000975548  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11363  hypothetical protein  31.03 
 
 		 161 aa  78.2  0.00000000000003  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_3932  hypothetical protein  31.72 
 
 		 278 aa  71.6  0.000000000003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.609829  n/a   
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3594  hypothetical protein  31.72 
 
 		 278 aa  71.6  0.000000000003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0376172  normal  0.29662 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4663  hypothetical protein  36.28 
 
 		 118 aa  71.2  0.000000000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000351024 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3677  hypothetical protein  30.41 
 
 		 297 aa  70.5  0.000000000008  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.160508 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00407  hypothetical protein  38.61 
 
 		 137 aa  69.7  0.00000000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1170  protein of unknown function DUF305  30.22 
 
 		 148 aa  67.4  0.00000000006  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1942  hypothetical protein  31.16 
 
 		 170 aa  63.9  0.0000000007  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2305  hypothetical protein  28.78 
 
 		 210 aa  63.5  0.0000000009  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.775317  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1088  hypothetical protein  30 
 
 		 185 aa  63.5  0.000000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010070  Bmul_6297  hypothetical protein  41.67 
 
 		 131 aa  50.4  0.000009  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.21149  normal  0.389023 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2579  hypothetical protein  48.21 
 
 		 202 aa  50.1  0.00001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2595  protein of unknown function DUF305  41.67 
 
 		 217 aa  49.7  0.00001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.974704  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2045  hypothetical protein  43.33 
 
 		 132 aa  48.5  0.00004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.928225  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2580  protein of unknown function DUF305  45.1 
 
 		 224 aa  47.4  0.00006  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0506  protein of unknown function DUF305  44.44 
 
 		 119 aa  47.4  0.00006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0184859 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3430  hypothetical protein  46.15 
 
 		 116 aa  47.4  0.00007  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2783  hypothetical protein  48.98 
 
 		 202 aa  47  0.00009  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1535  hypothetical protein  46 
 
 		 113 aa  46.2  0.0002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.619429  normal  0.733742 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3242  hypothetical protein  42.37 
 
 		 134 aa  46.2  0.0002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2567  hypothetical protein  44.64 
 
 		 206 aa  45.8  0.0002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0057  hypothetical protein  44.64 
 
 		 208 aa  45.4  0.0002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2280  hypothetical protein  45.1 
 
 		 226 aa  45.4  0.0003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3895  hypothetical protein  43.64 
 
 		 134 aa  45.1  0.0003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6278  hypothetical protein  46.43 
 
 		 130 aa  45.1  0.0003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00531992 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1985  hypothetical protein  42.42 
 
 		 128 aa  44.7  0.0004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.448564  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5258  hypothetical protein  45 
 
 		 150 aa  44.7  0.0004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.355958  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0121  hypothetical protein  47.06 
 
 		 211 aa  44.7  0.0005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.261528  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6564  hypothetical protein  46.43 
 
 		 130 aa  44.7  0.0005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4123  hypothetical protein  43.14 
 
 		 198 aa  43.9  0.0009  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4244  protein of unknown function DUF305  43.14 
 
 		 217 aa  43.5  0.0009  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.827618  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6075  protein of unknown function DUF305  41.67 
 
 		 137 aa  43.5  0.0009  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.69008  normal  0.152537 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6541  hypothetical protein  44.64 
 
 		 127 aa  43.5  0.001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.249657  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6148  hypothetical protein  44.83 
 
 		 127 aa  43.1  0.001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.137676  normal  0.19662 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1290  hypothetical protein  44.64 
 
 		 127 aa  43.5  0.001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.434421  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0926  hypothetical protein  41.82 
 
 		 117 aa  43.5  0.001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.984322  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4129  protein of unknown function DUF305  41.07 
 
 		 125 aa  42.7  0.002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.933838  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1150  hypothetical protein  43.4 
 
 		 218 aa  42.4  0.002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4189  hypothetical protein  39.29 
 
 		 195 aa  42.7  0.002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.314897  normal  0.043987 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3044  protein of unknown function DUF305  46.94 
 
 		 230 aa  42.7  0.002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.22024  normal  0.753211 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2299  hypothetical protein  45.1 
 
 		 131 aa  42.4  0.002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.502645  normal  0.300694 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5510  hypothetical protein  44.64 
 
 		 130 aa  42.7  0.002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.563471  normal  0.269299 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1186  protein of unknown function DUF305  37.5 
 
 		 407 aa  42.7  0.002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.220752  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0461  protein of unknown function DUF305  40.74 
 
 		 119 aa  42.7  0.002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.607138  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3676  hypothetical protein  31 
 
 		 243 aa  42  0.003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0963625  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1876  hypothetical protein  30.17 
 
 		 141 aa  42  0.003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.257011  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0139  protein of unknown function DUF305  39.39 
 
 		 237 aa  42  0.003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3538  protein of unknown function DUF305  46 
 
 		 205 aa  42  0.003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.396776 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2666  hypothetical protein  47.37 
 
 		 127 aa  41.6  0.003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.499995 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0261  hypothetical protein  47.37 
 
 		 127 aa  41.6  0.003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.188703  normal  0.0101728 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2536  hypothetical protein  39.29 
 
 		 133 aa  41.6  0.004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.608732  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2368  hypothetical protein  40.38 
 
 		 188 aa  41.6  0.004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.838223  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1967  hypothetical protein  47.27 
 
 		 141 aa  41.6  0.004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.619841  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5614  protein of unknown function DUF305  33.33 
 
 		 135 aa  41.2  0.005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0406  hypothetical protein  47.27 
 
 		 141 aa  41.2  0.005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.1733  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4915  hypothetical protein  36.26 
 
 		 370 aa  41.2  0.006  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0400128 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3056  protein of unknown function DUF305  42 
 
 		 128 aa  40.8  0.007  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4415  protein of unknown function DUF305  32.97 
 
 		 202 aa  40.8  0.007  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.126861  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0132  protein of unknown function DUF305  43.75 
 
 		 192 aa  40.8  0.007  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.857037  normal  1 
 
 
-
 
NC_009806  Krad_4586  hypothetical protein  30.77 
 
 		 265 aa  40.4  0.008  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5736  protein of unknown function DUF305  48.15 
 
 		 132 aa  40.4  0.009  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.470482 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5858  hypothetical protein  40 
 
 		 218 aa  40.4  0.009  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>