76 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_6646 on replicon NC_013731
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013731  Slin_6646  protein of unknown function DUF305  100 
 
 		 170 aa  350  5.9999999999999994e-96  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.350625  normal  0.51653 
 
 
-
 
NC_013732  Slin_6892  protein of unknown function DUF305  74.86 
 
 		 175 aa  269  1e-71  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3077  hypothetical protein  64.83 
 
 		 164 aa  196  1.0000000000000001e-49  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4398  hypothetical protein  40 
 
 		 157 aa  126  2.0000000000000002e-28  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.271713  normal  0.854107 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4811  hypothetical protein  40.91 
 
 		 161 aa  125  4.0000000000000003e-28  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.405374 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11708  hypothetical protein  37.95 
 
 		 163 aa  119  3e-26  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2420  hypothetical protein  40.85 
 
 		 147 aa  118  3e-26  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.692364 
 
 
-
 
NC_013732  Slin_6962  protein of unknown function DUF305  38.78 
 
 		 161 aa  116  9.999999999999999e-26  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.211177  normal  0.0771819 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1322  hypothetical protein  41.96 
 
 		 166 aa  115  1.9999999999999998e-25  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.927633  normal  0.338762 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2287  hypothetical protein  41.96 
 
 		 151 aa  115  3.9999999999999997e-25  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.000356026  hitchhiker  0.00039069 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3245  hypothetical protein  42.65 
 
 		 167 aa  111  4.0000000000000004e-24  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2051  protein of unknown function DUF305  41.84 
 
 		 171 aa  107  6e-23  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11363  hypothetical protein  39.33 
 
 		 161 aa  107  7.000000000000001e-23  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3896  hypothetical protein  38.85 
 
 		 167 aa  102  3e-21  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0010  protein of unknown function DUF305  36.49 
 
 		 173 aa  98.6  4e-20  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4925  hypothetical protein  41.38 
 
 		 147 aa  98.2  5e-20  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.455285  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1170  protein of unknown function DUF305  36.55 
 
 		 148 aa  96.3  2e-19  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_3932  hypothetical protein  34.03 
 
 		 278 aa  92.4  3e-18  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.609829  n/a   
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3594  hypothetical protein  34.03 
 
 		 278 aa  92.4  3e-18  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0376172  normal  0.29662 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1589  hypothetical protein  34.9 
 
 		 161 aa  92.4  3e-18  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  decreased coverage  0.000000759319  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0695  hypothetical protein  35.14 
 
 		 161 aa  92  4e-18  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  unclonable  0.000000975548  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3677  hypothetical protein  34.27 
 
 		 297 aa  88.6  4e-17  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.160508 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0712  hypothetical protein  34.25 
 
 		 158 aa  87.4  9e-17  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.118157 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0287  protein of unknown function DUF305  33.33 
 
 		 201 aa  86.7  1e-16  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.087537 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4663  hypothetical protein  38.26 
 
 		 118 aa  86.7  1e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000351024 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1088  hypothetical protein  33.33 
 
 		 185 aa  82  0.000000000000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0359  protein of unknown function DUF305  33.11 
 
 		 178 aa  81.3  0.000000000000006  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00407  hypothetical protein  37.04 
 
 		 137 aa  78.2  0.00000000000004  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1942  hypothetical protein  31.97 
 
 		 170 aa  78.2  0.00000000000006  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2305  hypothetical protein  31.52 
 
 		 210 aa  74.3  0.0000000000008  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.775317  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3868  hypothetical protein  49.15 
 
 		 134 aa  56.6  0.0000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1535  hypothetical protein  50.88 
 
 		 113 aa  56.6  0.0000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.619429  normal  0.733742 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3242  hypothetical protein  47.46 
 
 		 134 aa  54.7  0.0000005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3895  hypothetical protein  45.9 
 
 		 134 aa  53.9  0.000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3430  hypothetical protein  57.14 
 
 		 116 aa  51.2  0.000006  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0926  hypothetical protein  43.75 
 
 		 117 aa  51.2  0.000007  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.984322  normal  1 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2567  hypothetical protein  44.64 
 
 		 206 aa  50.4  0.00001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0121  hypothetical protein  46 
 
 		 211 aa  50.1  0.00002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.261528  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1101  protein of unknown function DUF305  50 
 
 		 132 aa  49.7  0.00002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.3981  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3044  protein of unknown function DUF305  44.64 
 
 		 230 aa  49.3  0.00003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.22024  normal  0.753211 
 
 
-
 
NC_010070  Bmul_6297  hypothetical protein  49.09 
 
 		 131 aa  49.3  0.00003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.21149  normal  0.389023 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2829  hypothetical protein  50 
 
 		 128 aa  48.5  0.00004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.137612 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2783  hypothetical protein  44.83 
 
 		 202 aa  48.5  0.00005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2580  protein of unknown function DUF305  48 
 
 		 224 aa  48.1  0.00005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0108  protein of unknown function DUF305  46 
 
 		 134 aa  47  0.0001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.937647 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2299  hypothetical protein  48.21 
 
 		 131 aa  46.2  0.0002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.502645  normal  0.300694 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3056  protein of unknown function DUF305  48 
 
 		 128 aa  46.2  0.0002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2947  protein of unknown function DUF305  46 
 
 		 128 aa  46.6  0.0002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6075  protein of unknown function DUF305  48.21 
 
 		 137 aa  46.2  0.0002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.69008  normal  0.152537 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5258  hypothetical protein  46.55 
 
 		 150 aa  46.2  0.0002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.355958  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2368  hypothetical protein  47.17 
 
 		 188 aa  46.2  0.0002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.838223  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0401  hypothetical protein  46.3 
 
 		 126 aa  45.8  0.0003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0681518 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0506  protein of unknown function DUF305  43.64 
 
 		 119 aa  45.4  0.0003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0184859 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0541  hypothetical protein  52 
 
 		 120 aa  45.4  0.0004  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5736  protein of unknown function DUF305  49.09 
 
 		 132 aa  45.4  0.0004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.470482 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4123  hypothetical protein  42.86 
 
 		 198 aa  45.1  0.0005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0132  protein of unknown function DUF305  41.07 
 
 		 192 aa  45.1  0.0005  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.857037  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1338  hypothetical protein  34.18 
 
 		 152 aa  44.7  0.0006  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.031335  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1150  hypothetical protein  50 
 
 		 218 aa  44.3  0.0007  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0285  hypothetical protein  41.38 
 
 		 279 aa  44.3  0.0009  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0312  hypothetical protein  43.33 
 
 		 250 aa  44.3  0.0009  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.153905  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1836  hypothetical protein  44.64 
 
 		 246 aa  43.9  0.001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0521181  normal  0.479841 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2045  hypothetical protein  46 
 
 		 132 aa  43.5  0.001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.928225  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2280  hypothetical protein  48 
 
 		 226 aa  43.5  0.001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4129  protein of unknown function DUF305  44.44 
 
 		 125 aa  43.1  0.002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.933838  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2090  protein of unknown function DUF305  37.65 
 
 		 248 aa  42.7  0.002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0249102  normal  0.0354487 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1313  hypothetical protein  42.59 
 
 		 211 aa  42.4  0.003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0174  hypothetical protein  44.68 
 
 		 205 aa  42.4  0.003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0057  hypothetical protein  44 
 
 		 208 aa  42  0.004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3230  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  39.66 
 
 		 517 aa  42  0.004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.476229  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4415  protein of unknown function DUF305  31.13 
 
 		 202 aa  42  0.004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.126861  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0086  hypothetical protein  45.65 
 
 		 197 aa  41.6  0.005  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5614  protein of unknown function DUF305  44.44 
 
 		 135 aa  41.6  0.005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0305  hypothetical protein  35.71 
 
 		 192 aa  40.8  0.009  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1985  hypothetical protein  41.51 
 
 		 128 aa  40.8  0.01  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.448564  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0461  protein of unknown function DUF305  44.9 
 
 		 119 aa  40.8  0.01  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.607138  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>