41 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MADE_00407 on replicon NC_011138
Organism: Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011138  MADE_00407  hypothetical protein  100 
 
 		 137 aa  283  8e-76  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1942  hypothetical protein  60.83 
 
 		 170 aa  169  1e-41  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0010  protein of unknown function DUF305  63.21 
 
 		 173 aa  140  8e-33  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0359  protein of unknown function DUF305  53.12 
 
 		 178 aa  137  3.9999999999999997e-32  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0287  protein of unknown function DUF305  51.97 
 
 		 201 aa  135  1e-31  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.087537 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3677  hypothetical protein  58.49 
 
 		 297 aa  134  3.0000000000000003e-31  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.160508 
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_3932  hypothetical protein  57.52 
 
 		 278 aa  133  6.0000000000000005e-31  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.609829  n/a   
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3594  hypothetical protein  57.52 
 
 		 278 aa  133  6.0000000000000005e-31  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0376172  normal  0.29662 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0695  hypothetical protein  58.49 
 
 		 161 aa  130  9e-30  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  unclonable  0.000000975548  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1589  hypothetical protein  56.6 
 
 		 161 aa  127  5.0000000000000004e-29  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  decreased coverage  0.000000759319  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0712  hypothetical protein  56.6 
 
 		 158 aa  125  3e-28  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.118157 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1170  protein of unknown function DUF305  57.01 
 
 		 148 aa  120  7e-27  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1088  hypothetical protein  44.72 
 
 		 185 aa  107  8.000000000000001e-23  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11708  hypothetical protein  57.58 
 
 		 163 aa  104  4e-22  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013732  Slin_6962  protein of unknown function DUF305  42.31 
 
 		 161 aa  94.4  5e-19  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.211177  normal  0.0771819 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2305  hypothetical protein  39.71 
 
 		 210 aa  93.2  1e-18  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.775317  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2420  hypothetical protein  42.72 
 
 		 147 aa  92.8  1e-18  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.692364 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4398  hypothetical protein  42.73 
 
 		 157 aa  90.9  5e-18  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.271713  normal  0.854107 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11363  hypothetical protein  51.55 
 
 		 161 aa  88.6  2e-17  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2051  protein of unknown function DUF305  44.44 
 
 		 171 aa  77.4  0.00000000000006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3245  hypothetical protein  36.89 
 
 		 167 aa  75.9  0.0000000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3896  hypothetical protein  43.56 
 
 		 167 aa  75.9  0.0000000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3077  hypothetical protein  36.11 
 
 		 164 aa  72.8  0.000000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4811  hypothetical protein  35.35 
 
 		 161 aa  71.6  0.000000000004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.405374 
 
 
-
 
NC_013731  Slin_6646  protein of unknown function DUF305  37.04 
 
 		 170 aa  71.2  0.000000000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.350625  normal  0.51653 
 
 
-
 
NC_013732  Slin_6892  protein of unknown function DUF305  35.19 
 
 		 175 aa  70.1  0.000000000009  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1322  hypothetical protein  39 
 
 		 166 aa  70.1  0.000000000009  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.927633  normal  0.338762 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4663  hypothetical protein  48 
 
 		 118 aa  70.1  0.000000000009  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000351024 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2287  hypothetical protein  38.61 
 
 		 151 aa  69.7  0.00000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.000356026  hitchhiker  0.00039069 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4925  hypothetical protein  36.14 
 
 		 147 aa  61.6  0.000000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.455285  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1338  hypothetical protein  45.28 
 
 		 152 aa  45.8  0.0002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.031335  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0121  hypothetical protein  40 
 
 		 211 aa  44.7  0.0004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.261528  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0461  protein of unknown function DUF305  43.86 
 
 		 119 aa  44.3  0.0006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.607138  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0541  hypothetical protein  41.79 
 
 		 120 aa  43.9  0.0008  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1097  protein of unknown function DUF305  37.04 
 
 		 223 aa  43.5  0.001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000215144  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3430  hypothetical protein  45.28 
 
 		 116 aa  42.7  0.001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3230  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  41.51 
 
 		 517 aa  41.6  0.003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.476229  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4447  hypothetical protein  43.1 
 
 		 213 aa  41.2  0.005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.708243  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2783  hypothetical protein  42.19 
 
 		 202 aa  41.2  0.005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3056  protein of unknown function DUF305  38.89 
 
 		 128 aa  40.8  0.006  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0926  hypothetical protein  41.27 
 
 		 117 aa  40  0.01  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.984322  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>