38 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rsph17029_3677 on replicon NC_009050
Organism: Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009050  Rsph17029_3677  hypothetical protein  100 
 
 		 297 aa  600  1e-170  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.160508 
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_3932  hypothetical protein  46.13 
 
 		 278 aa  235  6e-61  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.609829  n/a   
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3594  hypothetical protein  46.13 
 
 		 278 aa  235  6e-61  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0376172  normal  0.29662 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0712  hypothetical protein  62.94 
 
 		 158 aa  190  2.9999999999999997e-47  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.118157 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1589  hypothetical protein  59.44 
 
 		 161 aa  184  1.0000000000000001e-45  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  decreased coverage  0.000000759319  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0695  hypothetical protein  60.14 
 
 		 161 aa  184  1.0000000000000001e-45  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  unclonable  0.000000975548  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0010  protein of unknown function DUF305  58.06 
 
 		 173 aa  183  3e-45  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1942  hypothetical protein  60.96 
 
 		 170 aa  177  3e-43  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1170  protein of unknown function DUF305  58.04 
 
 		 148 aa  166  2.9999999999999998e-40  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11708  hypothetical protein  53.38 
 
 		 163 aa  152  7e-36  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11363  hypothetical protein  52.11 
 
 		 161 aa  150  3e-35  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0359  protein of unknown function DUF305  51.75 
 
 		 178 aa  147  3e-34  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013732  Slin_6962  protein of unknown function DUF305  45.7 
 
 		 161 aa  144  2e-33  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.211177  normal  0.0771819 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0287  protein of unknown function DUF305  49.31 
 
 		 201 aa  143  4e-33  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.087537 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4398  hypothetical protein  49.28 
 
 		 157 aa  140  3.9999999999999997e-32  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.271713  normal  0.854107 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2305  hypothetical protein  45.62 
 
 		 210 aa  134  9.999999999999999e-31  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.775317  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00407  hypothetical protein  58.49 
 
 		 137 aa  134  9.999999999999999e-31  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1088  hypothetical protein  45.27 
 
 		 185 aa  134  3e-30  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4663  hypothetical protein  48.18 
 
 		 118 aa  102  8e-21  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000351024 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2420  hypothetical protein  35.86 
 
 		 147 aa  95.5  1e-18  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.692364 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2051  protein of unknown function DUF305  36.25 
 
 		 171 aa  91.3  2e-17  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3077  hypothetical protein  32.85 
 
 		 164 aa  88.2  1e-16  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4811  hypothetical protein  34.72 
 
 		 161 aa  80.5  0.00000000000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.405374 
 
 
-
 
NC_013731  Slin_6646  protein of unknown function DUF305  34.27 
 
 		 170 aa  80.5  0.00000000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.350625  normal  0.51653 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3896  hypothetical protein  32.89 
 
 		 167 aa  79.3  0.00000000000008  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013732  Slin_6892  protein of unknown function DUF305  30.2 
 
 		 175 aa  78.6  0.0000000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4925  hypothetical protein  34.04 
 
 		 147 aa  75.9  0.0000000000007  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.455285  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3245  hypothetical protein  31.76 
 
 		 167 aa  73.6  0.000000000004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1322  hypothetical protein  29.03 
 
 		 166 aa  71.2  0.00000000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.927633  normal  0.338762 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2287  hypothetical protein  30.41 
 
 		 151 aa  70.5  0.00000000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.000356026  hitchhiker  0.00039069 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1047  protein of unknown function DUF305  36.49 
 
 		 210 aa  46.6  0.0006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.109327 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3056  protein of unknown function DUF305  48.94 
 
 		 128 aa  45.1  0.001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0121  hypothetical protein  45.83 
 
 		 211 aa  45.1  0.002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.261528  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1097  protein of unknown function DUF305  29.03 
 
 		 223 aa  43.9  0.003  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000215144  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2567  hypothetical protein  43.86 
 
 		 206 aa  43.5  0.004  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3538  protein of unknown function DUF305  47.17 
 
 		 205 aa  43.5  0.004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.396776 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0461  protein of unknown function DUF305  43.14 
 
 		 119 aa  43.1  0.006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.607138  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3230  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  44 
 
 		 517 aa  42.7  0.008  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.476229  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>