58 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tbd_2305 on replicon NC_007404
Organism: Thiobacillus denitrificans ATCC 25259



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007404  Tbd_2305  hypothetical protein  100 
 
 		 210 aa  434  1e-121  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.775317  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1088  hypothetical protein  69.73 
 
 		 185 aa  262  3e-69  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3677  hypothetical protein  45.62 
 
 		 297 aa  141  7e-33  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.160508 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0010  protein of unknown function DUF305  51.33 
 
 		 173 aa  140  9.999999999999999e-33  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3594  hypothetical protein  43.26 
 
 		 278 aa  140  9.999999999999999e-33  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0376172  normal  0.29662 
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_3932  hypothetical protein  43.26 
 
 		 278 aa  140  9.999999999999999e-33  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.609829  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0712  hypothetical protein  46.45 
 
 		 158 aa  130  1.0000000000000001e-29  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.118157 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0359  protein of unknown function DUF305  47.3 
 
 		 178 aa  130  2.0000000000000002e-29  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1589  hypothetical protein  46.9 
 
 		 161 aa  129  5.0000000000000004e-29  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  decreased coverage  0.000000759319  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0695  hypothetical protein  44.68 
 
 		 161 aa  124  9e-28  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  unclonable  0.000000975548  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0287  protein of unknown function DUF305  39.81 
 
 		 201 aa  124  1e-27  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.087537 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1170  protein of unknown function DUF305  51.06 
 
 		 148 aa  122  3e-27  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1942  hypothetical protein  42.38 
 
 		 170 aa  120  9.999999999999999e-27  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013732  Slin_6962  protein of unknown function DUF305  42.86 
 
 		 161 aa  110  2.0000000000000002e-23  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.211177  normal  0.0771819 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11363  hypothetical protein  40.85 
 
 		 161 aa  108  8.000000000000001e-23  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00407  hypothetical protein  39.71 
 
 		 137 aa  105  6e-22  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4398  hypothetical protein  38.41 
 
 		 157 aa  104  9e-22  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.271713  normal  0.854107 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11708  hypothetical protein  38.56 
 
 		 163 aa  101  6e-21  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3077  hypothetical protein  31.61 
 
 		 164 aa  87.8  1e-16  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013732  Slin_6892  protein of unknown function DUF305  29.21 
 
 		 175 aa  86.3  3e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2051  protein of unknown function DUF305  34.16 
 
 		 171 aa  84.7  8e-16  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013731  Slin_6646  protein of unknown function DUF305  31.52 
 
 		 170 aa  77  0.0000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.350625  normal  0.51653 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4811  hypothetical protein  35.16 
 
 		 161 aa  76.3  0.0000000000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.405374 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3896  hypothetical protein  31.45 
 
 		 167 aa  73.2  0.000000000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4925  hypothetical protein  30.56 
 
 		 147 aa  69.7  0.00000000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.455285  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3245  hypothetical protein  28.86 
 
 		 167 aa  69.3  0.00000000004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2420  hypothetical protein  33.59 
 
 		 147 aa  68.6  0.00000000006  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.692364 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1322  hypothetical protein  27.45 
 
 		 166 aa  67.4  0.0000000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.927633  normal  0.338762 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2287  hypothetical protein  28.78 
 
 		 151 aa  66.6  0.0000000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.000356026  hitchhiker  0.00039069 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4663  hypothetical protein  36.63 
 
 		 118 aa  64.3  0.000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000351024 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3895  hypothetical protein  49.12 
 
 		 134 aa  50.8  0.00001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1535  hypothetical protein  50 
 
 		 113 aa  49.7  0.00003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.619429  normal  0.733742 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3230  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  46.3 
 
 		 517 aa  50.1  0.00003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.476229  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2579  hypothetical protein  41.89 
 
 		 202 aa  49.3  0.00004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0121  hypothetical protein  49.02 
 
 		 211 aa  49.3  0.00004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.261528  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0926  hypothetical protein  48.15 
 
 		 117 aa  48.1  0.00009  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.984322  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2836  hypothetical protein  41.89 
 
 		 215 aa  46.6  0.0002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.196211 
 
 
-
 
NC_010070  Bmul_6297  hypothetical protein  35.45 
 
 		 131 aa  46.2  0.0004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.21149  normal  0.389023 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1097  protein of unknown function DUF305  37.04 
 
 		 223 aa  45.8  0.0005  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000215144  n/a   
 
 
-
 
NC_009806  Krad_4586  hypothetical protein  38.6 
 
 		 265 aa  45.4  0.0006  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2580  protein of unknown function DUF305  39.13 
 
 		 224 aa  45.4  0.0006  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3538  protein of unknown function DUF305  35.71 
 
 		 205 aa  45.4  0.0007  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.396776 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3242  hypothetical protein  45.28 
 
 		 134 aa  45.1  0.0009  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3868  hypothetical protein  39.39 
 
 		 134 aa  44.7  0.001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1338  hypothetical protein  52 
 
 		 152 aa  44.3  0.001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.031335  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5614  protein of unknown function DUF305  39.66 
 
 		 135 aa  44.7  0.001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2567  hypothetical protein  42.11 
 
 		 206 aa  43.5  0.002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0891  hypothetical protein  37.18 
 
 		 229 aa  43.9  0.002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4568  hypothetical protein  40 
 
 		 231 aa  42.7  0.004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4129  protein of unknown function DUF305  46 
 
 		 125 aa  42.7  0.004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.933838  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3772  hypothetical protein  38.71 
 
 		 100 aa  42.4  0.005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.697679  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4526  hypothetical protein  42.37 
 
 		 189 aa  42.4  0.005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.410166  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0092  protein of unknown function DUF305  41.51 
 
 		 139 aa  42.4  0.005  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.62579 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0997  protein of unknown function DUF305  37.93 
 
 		 148 aa  42.4  0.005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.495486  normal  0.061691 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2368  hypothetical protein  44 
 
 		 188 aa  42  0.007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.838223  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3889  hypothetical protein  42.37 
 
 		 227 aa  41.6  0.008  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.154198  normal  0.229372 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0057  hypothetical protein  44.83 
 
 		 208 aa  41.6  0.009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0541  hypothetical protein  38.33 
 
 		 120 aa  41.6  0.009  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>