84 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_6962 on replicon NC_013732
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013732  Slin_6962  protein of unknown function DUF305  100 
 
 
161 aa  332  1e-90  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.211177  normal  0.0771819 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4398  hypothetical protein  46.36 
 
 
157 aa  145  3e-34  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.271713  normal  0.854107 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3677  hypothetical protein  45.7 
 
 
297 aa  144  7.0000000000000006e-34  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.160508 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11708  hypothetical protein  44.44 
 
 
163 aa  143  1e-33  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11363  hypothetical protein  46.91 
 
 
161 aa  143  1e-33  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0010  protein of unknown function DUF305  45.52 
 
 
173 aa  139  9.999999999999999e-33  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3594  hypothetical protein  46.1 
 
 
278 aa  139  1.9999999999999998e-32  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0376172  normal  0.29662 
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_3932  hypothetical protein  46.1 
 
 
278 aa  139  1.9999999999999998e-32  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.609829  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1589  hypothetical protein  45.33 
 
 
161 aa  135  3.0000000000000003e-31  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  decreased coverage  0.000000759319  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1170  protein of unknown function DUF305  44.83 
 
 
148 aa  132  1.9999999999999998e-30  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0712  hypothetical protein  43.92 
 
 
158 aa  130  6.999999999999999e-30  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal  0.118157 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0695  hypothetical protein  43.06 
 
 
161 aa  128  3e-29  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  unclonable  0.000000975548  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1942  hypothetical protein  45.77 
 
 
170 aa  120  8e-27  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1088  hypothetical protein  42.86 
 
 
185 aa  116  9.999999999999999e-26  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013732  Slin_6892  protein of unknown function DUF305  38.04 
 
 
175 aa  113  1.0000000000000001e-24  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2420  hypothetical protein  41.35 
 
 
147 aa  110  1.0000000000000001e-23  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.692364 
 
 
-
 
NC_013731  Slin_6646  protein of unknown function DUF305  38.78 
 
 
170 aa  106  1e-22  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.350625  normal  0.51653 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4663  hypothetical protein  43.86 
 
 
118 aa  105  2e-22  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000000351024 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2305  hypothetical protein  42.86 
 
 
210 aa  105  2e-22  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.775317  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2051  protein of unknown function DUF305  37.09 
 
 
171 aa  105  4e-22  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0359  protein of unknown function DUF305  37.84 
 
 
178 aa  104  5e-22  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3077  hypothetical protein  39.07 
 
 
164 aa  103  8e-22  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0287  protein of unknown function DUF305  37.86 
 
 
201 aa  100  6e-21  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.087537 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4811  hypothetical protein  37.25 
 
 
161 aa  97.4  8e-20  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.405374 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1322  hypothetical protein  34.97 
 
 
166 aa  95.5  3e-19  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.927633  normal  0.338762 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2287  hypothetical protein  34.97 
 
 
151 aa  95.5  3e-19  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.000356026  hitchhiker  0.00039069 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00407  hypothetical protein  42.31 
 
 
137 aa  94.4  7e-19  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4925  hypothetical protein  37.76 
 
 
147 aa  92.8  2e-18  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.455285  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3896  hypothetical protein  33.56 
 
 
167 aa  89.4  2e-17  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3245  hypothetical protein  34.69 
 
 
167 aa  89.4  2e-17  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3242  hypothetical protein  46.55 
 
 
134 aa  54.7  0.0000006  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1535  hypothetical protein  50.91 
 
 
113 aa  53.5  0.000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.619429  normal  0.733742 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2567  hypothetical protein  50 
 
 
206 aa  52.8  0.000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1097  protein of unknown function DUF305  46.3 
 
 
223 aa  52.8  0.000002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000215144  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2783  hypothetical protein  50.91 
 
 
202 aa  52.8  0.000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2579  hypothetical protein  52.83 
 
 
202 aa  52  0.000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010070  Bmul_6297  hypothetical protein  48.21 
 
 
131 aa  50.4  0.000009  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.21149  normal  0.389023 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0926  hypothetical protein  36.59 
 
 
117 aa  50.4  0.00001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.984322  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2829  hypothetical protein  49.09 
 
 
128 aa  50.4  0.00001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.137612 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0108  protein of unknown function DUF305  47.27 
 
 
134 aa  49.7  0.00002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.937647 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3056  protein of unknown function DUF305  49.06 
 
 
128 aa  49.7  0.00002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1338  hypothetical protein  53.7 
 
 
152 aa  49.7  0.00002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.031335  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1101  protein of unknown function DUF305  49.06 
 
 
132 aa  49.3  0.00002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.3981  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3538  protein of unknown function DUF305  43.64 
 
 
205 aa  49.7  0.00002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.396776 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3230  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  45.45 
 
 
517 aa  48.9  0.00003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.476229  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0506  protein of unknown function DUF305  48.15 
 
 
119 aa  48.9  0.00003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.0184859 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0057  hypothetical protein  37.72 
 
 
208 aa  48.5  0.00004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3895  hypothetical protein  46.3 
 
 
134 aa  48.5  0.00004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2045  hypothetical protein  45 
 
 
132 aa  48.5  0.00004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.928225  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3430  hypothetical protein  30.43 
 
 
116 aa  48.1  0.00005  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2947  protein of unknown function DUF305  47.27 
 
 
128 aa  48.1  0.00005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2368  hypothetical protein  46.15 
 
 
188 aa  47.4  0.00008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.838223  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0121  hypothetical protein  43.14 
 
 
211 aa  47.4  0.00008  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.261528  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4123  hypothetical protein  43.4 
 
 
198 aa  47.4  0.00008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3868  hypothetical protein  43.4 
 
 
134 aa  47  0.0001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5614  protein of unknown function DUF305  50 
 
 
135 aa  46.6  0.0001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2580  protein of unknown function DUF305  47.17 
 
 
224 aa  45.8  0.0002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2299  hypothetical protein  52.94 
 
 
131 aa  46.2  0.0002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.502645  normal  0.300694 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2280  hypothetical protein  47.06 
 
 
226 aa  45.8  0.0002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0997  protein of unknown function DUF305  45.28 
 
 
148 aa  45.8  0.0002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.495486  normal  0.061691 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6075  protein of unknown function DUF305  52.94 
 
 
137 aa  45.8  0.0002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.69008  normal  0.152537 
 
 
-
 
NC_009806  Krad_4586  hypothetical protein  30.11 
 
 
265 aa  45.1  0.0004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0461  protein of unknown function DUF305  48.15 
 
 
119 aa  45.4  0.0004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.607138  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0132  protein of unknown function DUF305  45.28 
 
 
192 aa  44.7  0.0005  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.857037  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4129  protein of unknown function DUF305  43.4 
 
 
125 aa  44.7  0.0006  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.933838  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0092  protein of unknown function DUF305  33.33 
 
 
139 aa  43.9  0.0009  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.62579 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1150  hypothetical protein  41.18 
 
 
218 aa  43.5  0.001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1571  conserved hypothetical protein (DUF305 domain protein)  43.64 
 
 
206 aa  43.5  0.001  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0147  hypothetical protein  43.4 
 
 
202 aa  42.7  0.002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.404622  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0156  hypothetical protein  43.4 
 
 
202 aa  42.7  0.002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.908882  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0541  hypothetical protein  46.43 
 
 
120 aa  42.4  0.003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5258  hypothetical protein  47.27 
 
 
150 aa  42  0.003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.355958  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0137  hypothetical protein  43.4 
 
 
202 aa  42  0.003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.0732771 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2213  hypothetical protein  41.07 
 
 
241 aa  41.6  0.004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008758  Pnap_4535  hypothetical protein  47.83 
 
 
98 aa  42  0.004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.858749  normal 
 
 
-
 
NC_008758  Pnap_4562  hypothetical protein  47.83 
 
 
91 aa  41.6  0.004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0305  hypothetical protein  41.51 
 
 
192 aa  42  0.004  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2536  hypothetical protein  43.4 
 
 
133 aa  42  0.004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.608732  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4244  protein of unknown function DUF305  48.15 
 
 
217 aa  41.6  0.005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.827618  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0179  hypothetical protein  45.28 
 
 
142 aa  41.6  0.005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0473864  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2595  protein of unknown function DUF305  48.15 
 
 
217 aa  41.2  0.006  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.974704  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3889  hypothetical protein  47.27 
 
 
227 aa  40.8  0.008  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.154198  normal  0.229372 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3980  hypothetical protein  44.23 
 
 
207 aa  40.4  0.01  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3672  protein of unknown function DUF305  35.71 
 
 
210 aa  40.4  0.01  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>