30 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_4663 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013132  Cpin_4663  hypothetical protein  100 
 
 		 118 aa  237  2.9999999999999997e-62  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000351024 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4398  hypothetical protein  58.77 
 
 		 157 aa  143  1e-33  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.271713  normal  0.854107 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11363  hypothetical protein  50 
 
 		 161 aa  107  5e-23  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0010  protein of unknown function DUF305  48.18 
 
 		 173 aa  107  5e-23  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11708  hypothetical protein  48.25 
 
 		 163 aa  105  2e-22  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013732  Slin_6962  protein of unknown function DUF305  43.86 
 
 		 161 aa  105  2e-22  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.211177  normal  0.0771819 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3677  hypothetical protein  48.18 
 
 		 297 aa  102  2e-21  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.160508 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1170  protein of unknown function DUF305  42.86 
 
 		 148 aa  98.6  3e-20  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3594  hypothetical protein  48.62 
 
 		 278 aa  93.2  1e-18  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0376172  normal  0.29662 
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_3932  hypothetical protein  48.62 
 
 		 278 aa  93.2  1e-18  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.609829  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1589  hypothetical protein  46.36 
 
 		 161 aa  91.7  3e-18  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  decreased coverage  0.000000759319  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0695  hypothetical protein  45.45 
 
 		 161 aa  88.6  2e-17  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  unclonable  0.000000975548  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0712  hypothetical protein  45.45 
 
 		 158 aa  87.8  4e-17  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.118157 
 
 
-
 
NC_013732  Slin_6892  protein of unknown function DUF305  38.94 
 
 		 175 aa  83.2  0.000000000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0287  protein of unknown function DUF305  44.55 
 
 		 201 aa  82  0.000000000000002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.087537 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0359  protein of unknown function DUF305  41.07 
 
 		 178 aa  81.6  0.000000000000003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013731  Slin_6646  protein of unknown function DUF305  39.25 
 
 		 170 aa  81.3  0.000000000000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.350625  normal  0.51653 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2420  hypothetical protein  35.78 
 
 		 147 aa  78.6  0.00000000000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.692364 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2051  protein of unknown function DUF305  38.68 
 
 		 171 aa  77.8  0.00000000000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3077  hypothetical protein  35.78 
 
 		 164 aa  73.9  0.0000000000007  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1942  hypothetical protein  41.44 
 
 		 170 aa  72.4  0.000000000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2287  hypothetical protein  36.28 
 
 		 151 aa  71.2  0.000000000005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.000356026  hitchhiker  0.00039069 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1322  hypothetical protein  37.27 
 
 		 166 aa  70.9  0.000000000006  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.927633  normal  0.338762 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00407  hypothetical protein  48 
 
 		 137 aa  70.1  0.000000000009  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4811  hypothetical protein  33.61 
 
 		 161 aa  67.4  0.00000000006  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.405374 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3896  hypothetical protein  36.61 
 
 		 167 aa  67.8  0.00000000006  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1088  hypothetical protein  38.83 
 
 		 185 aa  67.4  0.00000000007  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3245  hypothetical protein  35.85 
 
 		 167 aa  65.1  0.0000000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4925  hypothetical protein  37.27 
 
 		 147 aa  60.8  0.000000007  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.455285  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2305  hypothetical protein  36.63 
 
 		 210 aa  58.9  0.00000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.775317  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>