50 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PsycPRwf_0712 on replicon NC_009524
Organism: Psychrobacter sp. PRwf-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009524  PsycPRwf_0712  hypothetical protein  100 
 
 		 158 aa  328  2e-89  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.118157 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0695  hypothetical protein  85.53 
 
 		 161 aa  279  8.000000000000001e-75  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  unclonable  0.000000975548  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1589  hypothetical protein  86.18 
 
 		 161 aa  279  1e-74  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  decreased coverage  0.000000759319  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3677  hypothetical protein  62.94 
 
 		 297 aa  190  8e-48  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.160508 
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_3932  hypothetical protein  61.54 
 
 		 278 aa  185  2e-46  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.609829  n/a   
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3594  hypothetical protein  61.54 
 
 		 278 aa  185  2e-46  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0376172  normal  0.29662 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0010  protein of unknown function DUF305  56.58 
 
 		 173 aa  180  6e-45  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1170  protein of unknown function DUF305  55.78 
 
 		 148 aa  172  1.9999999999999998e-42  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11708  hypothetical protein  54.43 
 
 		 163 aa  167  4e-41  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11363  hypothetical protein  52.23 
 
 		 161 aa  162  2.0000000000000002e-39  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0287  protein of unknown function DUF305  51.75 
 
 		 201 aa  150  5.9999999999999996e-36  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.087537 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0359  protein of unknown function DUF305  52.08 
 
 		 178 aa  149  1e-35  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1942  hypothetical protein  54.79 
 
 		 170 aa  149  2e-35  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013732  Slin_6962  protein of unknown function DUF305  43.92 
 
 		 161 aa  130  6.999999999999999e-30  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.211177  normal  0.0771819 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1088  hypothetical protein  43.23 
 
 		 185 aa  127  7.000000000000001e-29  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2305  hypothetical protein  45.03 
 
 		 210 aa  125  2.0000000000000002e-28  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.775317  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00407  hypothetical protein  56.6 
 
 		 137 aa  125  3e-28  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4398  hypothetical protein  42.36 
 
 		 157 aa  122  2e-27  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.271713  normal  0.854107 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2051  protein of unknown function DUF305  35.17 
 
 		 171 aa  94.7  4e-19  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4811  hypothetical protein  34.18 
 
 		 161 aa  92.8  2e-18  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.405374 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3077  hypothetical protein  37.16 
 
 		 164 aa  90.5  8e-18  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4663  hypothetical protein  45.45 
 
 		 118 aa  87.8  5e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000351024 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3245  hypothetical protein  31.21 
 
 		 167 aa  84.3  5e-16  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2287  hypothetical protein  31.54 
 
 		 151 aa  82  0.000000000000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.000356026  hitchhiker  0.00039069 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1322  hypothetical protein  31.54 
 
 		 166 aa  82  0.000000000000003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.927633  normal  0.338762 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2420  hypothetical protein  30.41 
 
 		 147 aa  80.5  0.000000000000008  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.692364 
 
 
-
 
NC_013732  Slin_6892  protein of unknown function DUF305  31.37 
 
 		 175 aa  79.7  0.00000000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013731  Slin_6646  protein of unknown function DUF305  34.25 
 
 		 170 aa  78.6  0.00000000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.350625  normal  0.51653 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3896  hypothetical protein  30.13 
 
 		 167 aa  77.8  0.00000000000005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4925  hypothetical protein  35 
 
 		 147 aa  77.4  0.00000000000007  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.455285  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0121  hypothetical protein  50 
 
 		 211 aa  49.7  0.00001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.261528  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3230  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  45.28 
 
 		 517 aa  48.1  0.00004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.476229  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2829  hypothetical protein  41.94 
 
 		 128 aa  46.2  0.0002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.137612 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1535  hypothetical protein  48 
 
 		 113 aa  45.4  0.0003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.619429  normal  0.733742 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1101  protein of unknown function DUF305  39.68 
 
 		 132 aa  45.4  0.0003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.3981  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0108  protein of unknown function DUF305  40.32 
 
 		 134 aa  45.1  0.0004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.937647 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3242  hypothetical protein  51.02 
 
 		 134 aa  45.1  0.0004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3056  protein of unknown function DUF305  40.32 
 
 		 128 aa  43.9  0.0008  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0926  hypothetical protein  47.27 
 
 		 117 aa  43.9  0.0008  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.984322  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2947  protein of unknown function DUF305  40.32 
 
 		 128 aa  43.5  0.001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2567  hypothetical protein  48.98 
 
 		 206 aa  43.1  0.001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0506  protein of unknown function DUF305  44.23 
 
 		 119 aa  42.4  0.002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0184859 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0461  protein of unknown function DUF305  47.17 
 
 		 119 aa  42.7  0.002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.607138  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3868  hypothetical protein  46 
 
 		 134 aa  43.1  0.002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1097  protein of unknown function DUF305  29.09 
 
 		 223 aa  42.4  0.002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000215144  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3895  hypothetical protein  52.17 
 
 		 134 aa  42  0.003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1047  protein of unknown function DUF305  38.6 
 
 		 210 aa  41.2  0.005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.109327 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0997  protein of unknown function DUF305  40.74 
 
 		 148 aa  41.2  0.005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.495486  normal  0.061691 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1810  protein of unknown function DUF305  52.27 
 
 		 239 aa  40.4  0.009  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2045  hypothetical protein  45.1 
 
 		 132 aa  40.4  0.009  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.928225  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>