60 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Oter_4398 on replicon NC_010571
Organism: Opitutus terrae PB90-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010571  Oter_4398  hypothetical protein  100 
 
 
157 aa  319  9.999999999999999e-87  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.271713  normal  0.854107 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11708  hypothetical protein  48.3 
 
 
163 aa  152  2e-36  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013732  Slin_6962  protein of unknown function DUF305  46.36 
 
 
161 aa  145  3e-34  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.211177  normal  0.0771819 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11363  hypothetical protein  46.98 
 
 
161 aa  144  4.0000000000000006e-34  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4663  hypothetical protein  58.77 
 
 
118 aa  143  1e-33  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000000351024 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3677  hypothetical protein  49.28 
 
 
297 aa  140  9.999999999999999e-33  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.160508 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0010  protein of unknown function DUF305  43.79 
 
 
173 aa  133  9.999999999999999e-31  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1170  protein of unknown function DUF305  44.53 
 
 
148 aa  131  3e-30  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_3932  hypothetical protein  43.62 
 
 
278 aa  130  1.0000000000000001e-29  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.609829  n/a   
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3594  hypothetical protein  43.62 
 
 
278 aa  130  1.0000000000000001e-29  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0376172  normal  0.29662 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2420  hypothetical protein  44.37 
 
 
147 aa  128  3e-29  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.692364 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0359  protein of unknown function DUF305  44.9 
 
 
178 aa  123  1e-27  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0712  hypothetical protein  42.36 
 
 
158 aa  122  2e-27  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal  0.118157 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0695  hypothetical protein  40.28 
 
 
161 aa  119  9.999999999999999e-27  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  unclonable  0.000000975548  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1589  hypothetical protein  40.97 
 
 
161 aa  118  3e-26  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  decreased coverage  0.000000759319  normal 
 
 
-
 
NC_013732  Slin_6892  protein of unknown function DUF305  36.91 
 
 
175 aa  116  9.999999999999999e-26  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3077  hypothetical protein  35.57 
 
 
164 aa  115  1.9999999999999998e-25  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2051  protein of unknown function DUF305  43.36 
 
 
171 aa  116  1.9999999999999998e-25  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013731  Slin_6646  protein of unknown function DUF305  40 
 
 
170 aa  114  3.9999999999999997e-25  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.350625  normal  0.51653 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1942  hypothetical protein  38.93 
 
 
170 aa  110  6e-24  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0287  protein of unknown function DUF305  39.6 
 
 
201 aa  110  9e-24  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.087537 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2287  hypothetical protein  38.93 
 
 
151 aa  107  8.000000000000001e-23  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.000356026  hitchhiker  0.00039069 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4811  hypothetical protein  36.05 
 
 
161 aa  107  8.000000000000001e-23  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.405374 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1322  hypothetical protein  38.93 
 
 
166 aa  107  9.000000000000001e-23  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.927633  normal  0.338762 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4925  hypothetical protein  41.78 
 
 
147 aa  106  1e-22  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.455285  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3245  hypothetical protein  36.24 
 
 
167 aa  103  1e-21  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3896  hypothetical protein  36 
 
 
167 aa  99  2e-20  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2305  hypothetical protein  38.41 
 
 
210 aa  96.7  1e-19  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.775317  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1088  hypothetical protein  36.13 
 
 
185 aa  92  3e-18  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00407  hypothetical protein  42.73 
 
 
137 aa  90.9  5e-18  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2567  hypothetical protein  50 
 
 
206 aa  53.9  0.0000009  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3230  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  49.12 
 
 
517 aa  53.9  0.0000009  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.476229  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1097  protein of unknown function DUF305  42.11 
 
 
223 aa  49.7  0.00001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000215144  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2368  hypothetical protein  45.28 
 
 
188 aa  50.1  0.00001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.838223  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4129  protein of unknown function DUF305  31.03 
 
 
125 aa  50.4  0.00001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.933838  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0506  protein of unknown function DUF305  46.3 
 
 
119 aa  48.9  0.00002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.0184859 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1535  hypothetical protein  42.37 
 
 
113 aa  48.1  0.00004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.619429  normal  0.733742 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5614  protein of unknown function DUF305  40.32 
 
 
135 aa  47.4  0.00007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0997  protein of unknown function DUF305  30.95 
 
 
148 aa  47  0.00009  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.495486  normal  0.061691 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4123  hypothetical protein  33.7 
 
 
198 aa  45.8  0.0002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3242  hypothetical protein  40.68 
 
 
134 aa  46.2  0.0002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3538  protein of unknown function DUF305  40 
 
 
205 aa  45.1  0.0003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.396776 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2783  hypothetical protein  41.51 
 
 
202 aa  44.7  0.0006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0926  hypothetical protein  37.29 
 
 
117 aa  43.9  0.0008  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.984322  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1338  hypothetical protein  44.44 
 
 
152 aa  43.9  0.0009  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.031335  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0179  hypothetical protein  27.59 
 
 
142 aa  43.5  0.001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0473864  normal 
 
 
-
 
NC_010070  Bmul_6297  hypothetical protein  33 
 
 
131 aa  43.5  0.001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.21149  normal  0.389023 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0108  protein of unknown function DUF305  37.7 
 
 
134 aa  42.7  0.002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.937647 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3056  protein of unknown function DUF305  39.62 
 
 
128 aa  42.7  0.002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2829  hypothetical protein  40 
 
 
128 aa  42.7  0.002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.137612 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2947  protein of unknown function DUF305  38.18 
 
 
128 aa  42  0.003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0461  protein of unknown function DUF305  38.89 
 
 
119 aa  42.4  0.003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.607138  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2580  protein of unknown function DUF305  38.71 
 
 
224 aa  42  0.003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0121  hypothetical protein  44 
 
 
211 aa  42.4  0.003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.261528  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0092  protein of unknown function DUF305  35.94 
 
 
139 aa  42  0.003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.62579 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3032  protein of unknown function DUF305  41.51 
 
 
206 aa  41.6  0.004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.709279 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3895  hypothetical protein  40 
 
 
134 aa  41.6  0.005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2536  hypothetical protein  29.27 
 
 
133 aa  41.6  0.005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.608732  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1101  protein of unknown function DUF305  37.74 
 
 
132 aa  40.8  0.007  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.3981  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1810  protein of unknown function DUF305  37.33 
 
 
257 aa  40.8  0.008  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.117773  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>