84 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Fjoh_3077 on replicon NC_009441
Organism: Flavobacterium johnsoniae UW101



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009441  Fjoh_3077  hypothetical protein  100 
 
 
164 aa  332  2e-90  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013732  Slin_6892  protein of unknown function DUF305  64 
 
 
175 aa  192  1e-48  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013731  Slin_6646  protein of unknown function DUF305  64.83 
 
 
170 aa  179  1e-44  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.350625  normal  0.51653 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4811  hypothetical protein  38.56 
 
 
161 aa  123  1e-27  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.405374 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2420  hypothetical protein  41.43 
 
 
147 aa  119  1.9999999999999998e-26  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.692364 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4398  hypothetical protein  35.57 
 
 
157 aa  115  1.9999999999999998e-25  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.271713  normal  0.854107 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3245  hypothetical protein  37.5 
 
 
167 aa  114  8.999999999999998e-25  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1322  hypothetical protein  35.53 
 
 
166 aa  110  1.0000000000000001e-23  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.927633  normal  0.338762 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2051  protein of unknown function DUF305  37.25 
 
 
171 aa  110  1.0000000000000001e-23  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2287  hypothetical protein  36.43 
 
 
151 aa  107  6e-23  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.000356026  hitchhiker  0.00039069 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11708  hypothetical protein  36.42 
 
 
163 aa  107  1e-22  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4925  hypothetical protein  42.14 
 
 
147 aa  106  2e-22  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.455285  normal 
 
 
-
 
NC_013732  Slin_6962  protein of unknown function DUF305  39.07 
 
 
161 aa  103  9e-22  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.211177  normal  0.0771819 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3896  hypothetical protein  35.03 
 
 
167 aa  103  1e-21  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0695  hypothetical protein  40.28 
 
 
161 aa  100  7e-21  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  unclonable  0.000000975548  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1589  hypothetical protein  41.22 
 
 
161 aa  100  8e-21  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  decreased coverage  0.000000759319  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11363  hypothetical protein  39.19 
 
 
161 aa  99  3e-20  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1170  protein of unknown function DUF305  33.33 
 
 
148 aa  93.6  1e-18  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_3932  hypothetical protein  36.17 
 
 
278 aa  91.3  5e-18  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.609829  n/a   
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3594  hypothetical protein  36.17 
 
 
278 aa  91.3  5e-18  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0376172  normal  0.29662 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0712  hypothetical protein  37.16 
 
 
158 aa  90.5  9e-18  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal  0.118157 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0010  protein of unknown function DUF305  36.73 
 
 
173 aa  90.1  1e-17  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3677  hypothetical protein  32.85 
 
 
297 aa  88.2  4e-17  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.160508 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0359  protein of unknown function DUF305  34.64 
 
 
178 aa  82.8  0.000000000000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2305  hypothetical protein  31.61 
 
 
210 aa  79.7  0.00000000000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.775317  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1088  hypothetical protein  32.64 
 
 
185 aa  79  0.00000000000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4663  hypothetical protein  35.78 
 
 
118 aa  73.9  0.0000000000009  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000000351024 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00407  hypothetical protein  36.11 
 
 
137 aa  72.8  0.000000000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1942  hypothetical protein  31.03 
 
 
170 aa  72.4  0.000000000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0287  protein of unknown function DUF305  33.09 
 
 
201 aa  71.2  0.000000000006  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.087537 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2829  hypothetical protein  60.78 
 
 
128 aa  58.5  0.00000004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.137612 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3056  protein of unknown function DUF305  58.82 
 
 
128 aa  55.8  0.0000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2947  protein of unknown function DUF305  54.9 
 
 
128 aa  55.1  0.0000005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1101  protein of unknown function DUF305  54.9 
 
 
132 aa  54.3  0.0000008  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.3981  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0108  protein of unknown function DUF305  52.94 
 
 
134 aa  53.9  0.000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.937647 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1535  hypothetical protein  52 
 
 
113 aa  53.9  0.000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.619429  normal  0.733742 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3242  hypothetical protein  50 
 
 
134 aa  52.4  0.000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3868  hypothetical protein  54 
 
 
134 aa  52.4  0.000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0121  hypothetical protein  48 
 
 
211 aa  52  0.000004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.261528  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0926  hypothetical protein  46.55 
 
 
117 aa  51.6  0.000005  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.984322  normal 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2567  hypothetical protein  46.43 
 
 
206 aa  51.2  0.000005  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2299  hypothetical protein  54.9 
 
 
131 aa  50.4  0.00001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.502645  normal  0.300694 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6075  protein of unknown function DUF305  54.9 
 
 
137 aa  50.1  0.00001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.69008  normal  0.152537 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3044  protein of unknown function DUF305  46.43 
 
 
230 aa  50.1  0.00001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.22024  normal  0.753211 
 
 
-
 
NC_010070  Bmul_6297  hypothetical protein  52.94 
 
 
131 aa  49.7  0.00002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.21149  normal  0.389023 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3895  hypothetical protein  48 
 
 
134 aa  49.3  0.00002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3430  hypothetical protein  55.1 
 
 
116 aa  49.7  0.00002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2783  hypothetical protein  54.9 
 
 
202 aa  49.7  0.00002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2368  hypothetical protein  50.98 
 
 
188 aa  48.9  0.00003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.838223  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4123  hypothetical protein  46.43 
 
 
198 aa  48.5  0.00004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3230  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  42.59 
 
 
517 aa  48.5  0.00004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.476229  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0541  hypothetical protein  51.67 
 
 
120 aa  48.1  0.00005  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2045  hypothetical protein  52 
 
 
132 aa  47.8  0.00006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.928225  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2580  protein of unknown function DUF305  46 
 
 
224 aa  47.8  0.00007  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0506  protein of unknown function DUF305  47.17 
 
 
119 aa  47.4  0.00008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.0184859 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0461  protein of unknown function DUF305  51.85 
 
 
119 aa  46.6  0.0001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.607138  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2090  protein of unknown function DUF305  33.33 
 
 
248 aa  45.8  0.0003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0249102  normal  0.0354487 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2280  hypothetical protein  50 
 
 
226 aa  45.8  0.0003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3032  protein of unknown function DUF305  33.33 
 
 
206 aa  44.3  0.0008  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.709279 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1876  hypothetical protein  50 
 
 
141 aa  43.5  0.001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.257011  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0885  protein of unknown function DUF305  41.07 
 
 
203 aa  42.7  0.002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.309526 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1967  hypothetical protein  50 
 
 
141 aa  43.1  0.002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.619841  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2213  hypothetical protein  41.82 
 
 
241 aa  43.1  0.002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6564  hypothetical protein  48 
 
 
130 aa  42.7  0.002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0406  hypothetical protein  50 
 
 
141 aa  43.1  0.002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.1733  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5614  protein of unknown function DUF305  45.45 
 
 
135 aa  42  0.003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0086  hypothetical protein  43.48 
 
 
197 aa  42.4  0.003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1097  protein of unknown function DUF305  39.29 
 
 
223 aa  42  0.004  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000215144  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3889  hypothetical protein  48 
 
 
227 aa  42  0.004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.154198  normal  0.229372 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0092  protein of unknown function DUF305  44 
 
 
139 aa  42  0.004  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.62579 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3873  hypothetical protein  48.21 
 
 
147 aa  42  0.004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0401  hypothetical protein  48 
 
 
126 aa  41.6  0.005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.0681518 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1338  hypothetical protein  46.94 
 
 
152 aa  41.6  0.005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.031335  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4244  protein of unknown function DUF305  43.33 
 
 
217 aa  41.2  0.006  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.827618  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1150  hypothetical protein  46 
 
 
218 aa  41.2  0.006  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3538  protein of unknown function DUF305  40.68 
 
 
205 aa  41.2  0.007  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.396776 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0997  protein of unknown function DUF305  43.1 
 
 
148 aa  40.8  0.008  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.495486  normal  0.061691 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4129  protein of unknown function DUF305  41.38 
 
 
125 aa  40.8  0.008  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.933838  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2536  hypothetical protein  43.1 
 
 
133 aa  40.8  0.008  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.608732  normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5806  hypothetical protein  50.98 
 
 
122 aa  40.4  0.009  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2595  protein of unknown function DUF305  43.33 
 
 
217 aa  40.8  0.009  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.974704  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1290  hypothetical protein  46 
 
 
127 aa  40.4  0.01  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.434421  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1473  hypothetical protein  44.68 
 
 
253 aa  40.4  0.01  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.49823  normal  0.238367 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6541  hypothetical protein  46 
 
 
127 aa  40.4  0.01  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.249657  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>