122 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Namu_2090 on replicon NC_013235
Organism: Nakamurella multipartita DSM 44233



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013235  Namu_2090  protein of unknown function DUF305  100 
 
 		 248 aa  501  1e-141  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0249102  normal  0.0354487 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4157  protein of unknown function DUF305  45.68 
 
 		 217 aa  186  3e-46  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.427773  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_30000  hypothetical protein  42.42 
 
 		 264 aa  165  6.9999999999999995e-40  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0111824  normal  0.273693 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6160  protein of unknown function DUF305  43.6 
 
 		 253 aa  162  4.0000000000000004e-39  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1897  protein of unknown function DUF305  44.65 
 
 		 270 aa  153  2e-36  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.79954  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0639  putative secreted protein  37.96 
 
 		 191 aa  140  9.999999999999999e-33  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1130  protein of unknown function DUF305  38.07 
 
 		 214 aa  136  4e-31  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0486316 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3974  hypothetical protein  43.19 
 
 		 271 aa  134  9.999999999999999e-31  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1237  hypothetical protein  39.05 
 
 		 239 aa  132  5e-30  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.584901  normal  0.0371958 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2558  hypothetical protein  37.44 
 
 		 217 aa  127  2.0000000000000002e-28  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.503516  normal  1 
 
 
-
 
NC_009806  Krad_4575  hypothetical protein  36.13 
 
 		 300 aa  124  9e-28  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0590  hypothetical protein  37.68 
 
 		 208 aa  122  4e-27  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1404  protein of unknown function DUF305  35.65 
 
 		 231 aa  117  9.999999999999999e-26  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  decreased coverage  0.00923301  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2129  protein of unknown function DUF305  33.62 
 
 		 223 aa  117  9.999999999999999e-26  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000673647  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0736  hypothetical protein  37.8 
 
 		 270 aa  117  3e-25  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0460895  hitchhiker  0.00701181 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0869  protein of unknown function DUF305  38.43 
 
 		 233 aa  116  3e-25  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.296281  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1810  protein of unknown function DUF305  35.12 
 
 		 257 aa  111  1.0000000000000001e-23  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.117773  n/a   
 
 
-
 
NC_011881  Achl_4525  protein of unknown function DUF305  33.04 
 
 		 280 aa  110  3e-23  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.137283 
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4455  hypothetical protein  33.78 
 
 		 229 aa  105  7e-22  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.248989  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4747  hypothetical protein  34.67 
 
 		 199 aa  105  9e-22  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.244044  normal  0.551165 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3506  protein of unknown function DUF305  32.79 
 
 		 235 aa  100  2e-20  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.974087  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0200  protein of unknown function DUF305  35.27 
 
 		 243 aa  98.6  8e-20  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2579  hypothetical protein  31.43 
 
 		 202 aa  91.3  1e-17  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4037  hypothetical protein  29.76 
 
 		 222 aa  91.3  1e-17  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0675936  hitchhiker  0.00542387 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3655  hypothetical protein  29.41 
 
 		 221 aa  90.9  2e-17  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009806  Krad_4586  hypothetical protein  32.66 
 
 		 265 aa  86.7  4e-16  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0706  hypothetical protein  32.2 
 
 		 203 aa  84.3  0.000000000000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0057  hypothetical protein  28.04 
 
 		 208 aa  83.2  0.000000000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0047  hypothetical protein  33 
 
 		 232 aa  82.8  0.000000000000005  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0137  hypothetical protein  29.47 
 
 		 202 aa  77.8  0.0000000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0732771 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0147  hypothetical protein  29.47 
 
 		 202 aa  76.3  0.0000000000005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.404622  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0156  hypothetical protein  29.47 
 
 		 202 aa  76.3  0.0000000000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.908882  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3538  protein of unknown function DUF305  30 
 
 		 205 aa  75.1  0.000000000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.396776 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3676  hypothetical protein  31.34 
 
 		 243 aa  75.1  0.000000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0963625  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4189  hypothetical protein  28.64 
 
 		 195 aa  73.9  0.000000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.314897  normal  0.043987 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0139  protein of unknown function DUF305  31.31 
 
 		 237 aa  73.2  0.000000000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2245  hypothetical protein  27.64 
 
 		 220 aa  72  0.000000000007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.19318  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4568  hypothetical protein  29 
 
 		 231 aa  70.9  0.00000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3032  protein of unknown function DUF305  28.92 
 
 		 206 aa  70.1  0.00000000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.709279 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4447  hypothetical protein  26.09 
 
 		 213 aa  68.6  0.0000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.708243  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4397  hypothetical protein  28.38 
 
 		 226 aa  67.4  0.0000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.801052  normal  0.828991 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1610  hypothetical protein  26.44 
 
 		 219 aa  66.2  0.0000000005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.506361  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4008  hypothetical protein  27.43 
 
 		 197 aa  63.2  0.000000004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5740  hypothetical protein  26.85 
 
 		 199 aa  62.4  0.000000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0885  protein of unknown function DUF305  26.76 
 
 		 203 aa  62.4  0.000000007  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.309526 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2595  protein of unknown function DUF305  24.88 
 
 		 217 aa  62.4  0.000000007  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.974704  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2111  hypothetical protein  24.27 
 
 		 223 aa  62  0.000000009  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.0727975 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0891  hypothetical protein  28 
 
 		 229 aa  61.2  0.00000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0315  hypothetical protein  25.5 
 
 		 213 aa  60.8  0.00000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5698  hypothetical protein  27.92 
 
 		 237 aa  60.8  0.00000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.472111  normal  0.587955 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5311  hypothetical protein  27.92 
 
 		 237 aa  60.8  0.00000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.126804  normal  0.734032 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2457  hypothetical protein  24.55 
 
 		 179 aa  61.2  0.00000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.10169  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4859  hypothetical protein  25.45 
 
 		 179 aa  61.2  0.00000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.465099  normal  0.0782365 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3980  hypothetical protein  26 
 
 		 207 aa  60.1  0.00000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0357  protein of unknown function DUF305  25 
 
 		 208 aa  59.7  0.00000005  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0485  hypothetical protein  24.4 
 
 		 207 aa  58.5  0.00000009  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.08806 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5320  hypothetical protein  27.16 
 
 		 225 aa  58.2  0.0000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5409  hypothetical protein  27.16 
 
 		 225 aa  58.2  0.0000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.180608  normal  0.175735 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3672  protein of unknown function DUF305  41.67 
 
 		 210 aa  58.2  0.0000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1394  hypothetical protein  27.41 
 
 		 212 aa  58.2  0.0000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.182892 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0174  hypothetical protein  24.5 
 
 		 205 aa  57  0.0000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2836  hypothetical protein  29 
 
 		 215 aa  57.8  0.0000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.196211 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4415  protein of unknown function DUF305  24.37 
 
 		 202 aa  57  0.0000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.126861  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2254  hypothetical protein  24.24 
 
 		 223 aa  56.6  0.0000004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0831973 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4244  protein of unknown function DUF305  25 
 
 		 217 aa  56.6  0.0000004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.827618  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5699  hypothetical protein  27.14 
 
 		 227 aa  56.2  0.0000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3396  protein of unknown function DUF305  38.16 
 
 		 237 aa  55.5  0.0000009  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.886047  normal  0.773197 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1437  hypothetical protein  26.34 
 
 		 228 aa  54.7  0.000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.115856  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1455  hypothetical protein  26.34 
 
 		 228 aa  54.7  0.000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.502246 
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4487  hypothetical protein  26.34 
 
 		 209 aa  54.3  0.000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.161376  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_18400  hypothetical protein  25.13 
 
 		 227 aa  54.3  0.000002  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5333  protein of unknown function DUF305  23.65 
 
 		 206 aa  54.3  0.000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.628713  n/a   
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5683  hypothetical protein  23.53 
 
 		 197 aa  53.5  0.000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.389225 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5327  hypothetical protein  23.53 
 
 		 197 aa  53.5  0.000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2580  protein of unknown function DUF305  26.26 
 
 		 224 aa  53.5  0.000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5736  hypothetical protein  25.25 
 
 		 227 aa  53.1  0.000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_04960  hypothetical protein  38.16 
 
 		 232 aa  52.4  0.000007  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1150  hypothetical protein  24.9 
 
 		 218 aa  52.4  0.000008  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3895  hypothetical protein  40.68 
 
 		 134 aa  52  0.000008  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2059  protein of unknown function DUF305  24.74 
 
 		 208 aa  52  0.000008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.243739  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3889  hypothetical protein  26.53 
 
 		 227 aa  52  0.000009  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.154198  normal  0.229372 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0108  protein of unknown function DUF305  30.53 
 
 		 134 aa  50.8  0.00002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.937647 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0092  protein of unknown function DUF305  41.82 
 
 		 139 aa  50.8  0.00002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.62579 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0926  hypothetical protein  40.35 
 
 		 117 aa  50.1  0.00003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.984322  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1535  hypothetical protein  37.29 
 
 		 113 aa  50.1  0.00003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.619429  normal  0.733742 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2214  protein of unknown function DUF305  35.71 
 
 		 207 aa  50.1  0.00003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.702552  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2567  hypothetical protein  32.48 
 
 		 206 aa  49.3  0.00005  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4461  hypothetical protein  25.89 
 
 		 213 aa  49.3  0.00005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008538  Arth_4292  hypothetical protein  25.89 
 
 		 213 aa  49.3  0.00005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008539  Arth_4192  hypothetical protein  25.89 
 
 		 213 aa  49.3  0.00005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1101  protein of unknown function DUF305  32.43 
 
 		 132 aa  48.9  0.00007  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.3981  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2947  protein of unknown function DUF305  28.72 
 
 		 128 aa  48.5  0.00009  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5614  protein of unknown function DUF305  42.37 
 
 		 135 aa  48.5  0.00009  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4526  hypothetical protein  24.49 
 
 		 189 aa  48.5  0.0001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.410166  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2536  hypothetical protein  38.98 
 
 		 133 aa  48.1  0.0001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.608732  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5858  hypothetical protein  38.1 
 
 		 218 aa  47.8  0.0002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2829  hypothetical protein  33.78 
 
 		 128 aa  47.4  0.0002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.137612 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0121  hypothetical protein  40.35 
 
 		 211 aa  47  0.0003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.261528  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4123  hypothetical protein  38.03 
 
 		 198 aa  47  0.0003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0997  protein of unknown function DUF305  36.84 
 
 		 148 aa  46.6  0.0003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.495486  normal  0.061691 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>